Protein–RNA interactions for Protein: P28663

Napb, Beta-soluble NSF attachment protein, mousemouse

Predictions only

Length 298 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NapbP28663 Sh2b2-201ENSMUST00000005188 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
NapbP28663 Gm6159-201ENSMUST00000191249 1724 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
NapbP28663 Jaml-204ENSMUST00000215880 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
NapbP28663 Zfp57-201ENSMUST00000069250 1749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
NapbP28663 Slc22a20-201ENSMUST00000041827 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
NapbP28663 Paf1-201ENSMUST00000003529 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
NapbP28663 Dbn1-203ENSMUST00000109923 2940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
NapbP28663 Ric8b-201ENSMUST00000038523 3069 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
NapbP28663 Tbrg4-201ENSMUST00000000394 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
NapbP28663 Glyr1-202ENSMUST00000115844 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
NapbP28663 Ttc13-210ENSMUST00000214828 3301 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
NapbP28663 Glyr1-201ENSMUST00000023189 3330 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
NapbP28663 Sorbs1-208ENSMUST00000224247 2688 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
NapbP28663 Cenpl-203ENSMUST00000111620 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
NapbP28663 Rtn4-201ENSMUST00000060992 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
NapbP28663 Hsd3b7-203ENSMUST00000106272 1725 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
NapbP28663 Akap17b-201ENSMUST00000051906 6003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
NapbP28663 Procr-201ENSMUST00000029140 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
NapbP28663 Pigg-203ENSMUST00000119014 4573 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
NapbP28663 Pebp1-202ENSMUST00000111973 779 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
NapbP28663 Gm15460-201ENSMUST00000118147 391 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
NapbP28663 Gm5108-201ENSMUST00000177891 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
NapbP28663 Timm13-201ENSMUST00000020440 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
NapbP28663 Gm40493-201ENSMUST00000210223 400 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
NapbP28663 Saa2-203ENSMUST00000210769 652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
NapbP28663 Gm26953-206ENSMUST00000212840 619 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
NapbP28663 AC238811.1-201ENSMUST00000225302 441 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
NapbP28663 Wdyhv1-203ENSMUST00000226889 394 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
NapbP28663 Saa2-201ENSMUST00000075982 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
NapbP28663 Cpne6-201ENSMUST00000074225 2201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
NapbP28663 Lipo3-201ENSMUST00000025694 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
NapbP28663 Hmgb3-201ENSMUST00000015361 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
NapbP28663 Art3-205ENSMUST00000120193 1371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
NapbP28663 Rad54l2-201ENSMUST00000046502 9305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
NapbP28663 Adora2a-201ENSMUST00000105420 2596 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
NapbP28663 Ube2g1-203ENSMUST00000138247 3931 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
NapbP28663 Galnt14-201ENSMUST00000024858 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
NapbP28663 Ldoc1-201ENSMUST00000075983 1459 ntAPPRIS P1 BASIC16.73■□□□□ 0.27
NapbP28663 Slc5a2-202ENSMUST00000118169 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
NapbP28663 Nfe2l1-201ENSMUST00000081775 4654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
NapbP28663 Gbgt1-203ENSMUST00000163121 1335 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
NapbP28663 Pygo2-201ENSMUST00000060061 3198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
NapbP28663 Rfx5-203ENSMUST00000107254 4450 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
NapbP28663 Ppp1r3d-201ENSMUST00000058678 3267 ntAPPRIS P1 BASIC16.73■□□□□ 0.27
NapbP28663 Tmem38b-201ENSMUST00000030127 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
NapbP28663 Ttll5-203ENSMUST00000095536 4150 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
NapbP28663 Tmem211-201ENSMUST00000086615 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
NapbP28663 Gpsm1-203ENSMUST00000078616 3127 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
NapbP28663 Foxl1-201ENSMUST00000181609 2705 ntAPPRIS P1 BASIC16.73■□□□□ 0.27
NapbP28663 Btbd10-201ENSMUST00000047091 2581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
NapbP28663 Rasl12-202ENSMUST00000165682 1903 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
NapbP28663 Arhgap27os1-201ENSMUST00000130556 923 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
NapbP28663 Gm14493-201ENSMUST00000141174 543 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
NapbP28663 Gm37267-201ENSMUST00000194222 681 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
NapbP28663 Gm30934-201ENSMUST00000215803 815 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
NapbP28663 Cela1-201ENSMUST00000023775 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
NapbP28663 Pde8a-201ENSMUST00000026672 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
NapbP28663 Oxt-201ENSMUST00000028764 537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
NapbP28663 Ramp3-201ENSMUST00000045374 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
NapbP28663 S100a13-201ENSMUST00000048138 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
NapbP28663 Pnck-201ENSMUST00000002087 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
NapbP28663 Fmnl2-205ENSMUST00000155586 3939 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
NapbP28663 Ak1-201ENSMUST00000068271 2034 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
NapbP28663 Fgf5-201ENSMUST00000031280 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
NapbP28663 Grik5-201ENSMUST00000003468 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
NapbP28663 Cyp21a2-ps-201ENSMUST00000172970 1383 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
NapbP28663 Bscl2-201ENSMUST00000086058 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
NapbP28663 Cnnm2-201ENSMUST00000077666 3492 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
NapbP28663 Spryd3-203ENSMUST00000154032 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
NapbP28663 Prkacb-202ENSMUST00000102515 4347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
NapbP28663 Tpd52-203ENSMUST00000091355 3081 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
NapbP28663 Pcdha11-202ENSMUST00000115657 5360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
NapbP28663 Wbp2-201ENSMUST00000074628 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
NapbP28663 Spidr-201ENSMUST00000040248 3279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
NapbP28663 Gna13-201ENSMUST00000020930 6160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
NapbP28663 Mospd3-202ENSMUST00000111007 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
NapbP28663 Psrc1-202ENSMUST00000102629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
NapbP28663 Txndc11-203ENSMUST00000118679 3523 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
NapbP28663 Ap1s2-202ENSMUST00000069041 2226 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
NapbP28663 Evc-201ENSMUST00000031005 4325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
NapbP28663 Cdpf1-202ENSMUST00000125947 706 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
NapbP28663 3000002C10Rik-202ENSMUST00000133495 1008 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
NapbP28663 Gm27838-201ENSMUST00000184829 128 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
NapbP28663 Gm29585-201ENSMUST00000185270 514 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
NapbP28663 Ftl1-201ENSMUST00000094434 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
NapbP28663 Zbtb46-201ENSMUST00000029106 5309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
NapbP28663 Snx14-204ENSMUST00000165315 3109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
NapbP28663 Megf9-202ENSMUST00000107359 7924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
NapbP28663 Bag6-202ENSMUST00000166426 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
NapbP28663 Smpd3-202ENSMUST00000212896 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
NapbP28663 Adk-207ENSMUST00000224069 1818 ntAPPRIS ALT1 BASIC16.72■□□□□ 0.27
NapbP28663 Srp72-202ENSMUST00000120550 2297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
NapbP28663 Ldha-202ENSMUST00000048209 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
NapbP28663 Slc8a3-201ENSMUST00000064594 4379 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
NapbP28663 Pex2-202ENSMUST00000071280 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
NapbP28663 Eif3f-201ENSMUST00000033342 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
NapbP28663 Fbxl4-201ENSMUST00000039234 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
NapbP28663 Map2k6-201ENSMUST00000020949 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
NapbP28663 Mrap2-203ENSMUST00000179313 2039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
NapbP28663 Pcyox1l-201ENSMUST00000025472 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.9 ms