Protein–RNA interactions for Protein: P27870

Vav1, Proto-oncogene vav, mousemouse

Predictions only

Length 845 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vav1P27870 Park7-205ENSMUST00000105676 582 ntTSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Vav1P27870 Fis1-203ENSMUST00000111097 601 ntTSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Vav1P27870 Gm6539-201ENSMUST00000119157 1064 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
Vav1P27870 Atcayos-202ENSMUST00000129950 1117 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Vav1P27870 Tctn3-202ENSMUST00000132452 1271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Vav1P27870 Nup188-205ENSMUST00000138666 534 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Vav1P27870 Zfp511-201ENSMUST00000168194 1076 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Vav1P27870 Fis1-201ENSMUST00000019198 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Vav1P27870 Prok2-204ENSMUST00000203738 695 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Vav1P27870 Olfr683-202ENSMUST00000209879 3841 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Vav1P27870 Arap2-201ENSMUST00000076623 7306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Vav1P27870 P2rx3-202ENSMUST00000111613 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Vav1P27870 2610028D06Rik-201ENSMUST00000215216 1713 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
Vav1P27870 Mrpl58-209ENSMUST00000153983 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Vav1P27870 Fubp1-206ENSMUST00000196739 2526 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Vav1P27870 Apol8-202ENSMUST00000089450 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
Vav1P27870 Abi3-201ENSMUST00000059026 4006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Vav1P27870 Foxo4-201ENSMUST00000062000 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Vav1P27870 Gm5763-201ENSMUST00000155951 1530 ntBASIC14.77□□□□□ -0.04
Vav1P27870 Nap1l1-208ENSMUST00000219961 1512 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Vav1P27870 Irf7-203ENSMUST00000106023 2237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Vav1P27870 Kif9-204ENSMUST00000198043 2233 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Vav1P27870 Klc2-203ENSMUST00000113728 2838 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
Vav1P27870 Pam-201ENSMUST00000058762 4095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Vav1P27870 Tnip2-201ENSMUST00000030991 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Vav1P27870 Spon2-201ENSMUST00000046186 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Vav1P27870 Tmem184c-201ENSMUST00000034030 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Vav1P27870 Zfp853-201ENSMUST00000180336 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
Vav1P27870 Rundc1-201ENSMUST00000040561 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Vav1P27870 Hoxa3-201ENSMUST00000114434 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Vav1P27870 Sept1-201ENSMUST00000106313 1285 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Vav1P27870 Ube2v2-202ENSMUST00000115776 1236 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Vav1P27870 Gm12264-201ENSMUST00000123949 500 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Vav1P27870 Gm13883-202ENSMUST00000151310 1156 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Vav1P27870 Vdac2-209ENSMUST00000173456 956 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Vav1P27870 Styxl1-207ENSMUST00000177559 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Vav1P27870 Mobp-207ENSMUST00000215512 498 ntTSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Vav1P27870 AC124732.2-201ENSMUST00000221977 316 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
Vav1P27870 AC149588.3-201ENSMUST00000227515 150 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
Vav1P27870 Mrpl27-201ENSMUST00000025278 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Vav1P27870 Etfdh-201ENSMUST00000029386 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Vav1P27870 Hsd3b7-203ENSMUST00000106272 1725 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Vav1P27870 Olfr160-203ENSMUST00000215727 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Vav1P27870 Pde8a-201ENSMUST00000026672 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Vav1P27870 Epha1-201ENSMUST00000073387 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Vav1P27870 Cd3d-201ENSMUST00000034602 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Vav1P27870 A3galt2-202ENSMUST00000106077 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Vav1P27870 BC005537-201ENSMUST00000019276 5849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Vav1P27870 Cd72-202ENSMUST00000098104 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Vav1P27870 Ccnt2-202ENSMUST00000112570 4511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Vav1P27870 Gm28182-201ENSMUST00000188354 2477 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Vav1P27870 Arhgap8-205ENSMUST00000168811 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Vav1P27870 Il17re-202ENSMUST00000058548 2940 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Vav1P27870 N4bp3-201ENSMUST00000001080 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Vav1P27870 Crhr2-209ENSMUST00000213026 1443 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Vav1P27870 Mto1-201ENSMUST00000034896 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Vav1P27870 Mrps9-201ENSMUST00000057208 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Vav1P27870 Ppp1r15a-202ENSMUST00000167273 2809 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Vav1P27870 AC148324.1-201ENSMUST00000219034 4240 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Vav1P27870 Scap-201ENSMUST00000098350 4227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Vav1P27870 Efhd1-201ENSMUST00000027472 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Vav1P27870 Spidr-201ENSMUST00000040248 3279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Vav1P27870 Tacc1-202ENSMUST00000084512 6471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Vav1P27870 Galnt2-201ENSMUST00000034458 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Vav1P27870 Acp5-201ENSMUST00000069330 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Vav1P27870 Efs-201ENSMUST00000022813 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Vav1P27870 Snx29-207ENSMUST00000180792 2667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Vav1P27870 Kpna6-201ENSMUST00000003828 2195 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Vav1P27870 Ninj2-202ENSMUST00000112711 853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Vav1P27870 Gm6415-201ENSMUST00000118488 348 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Vav1P27870 Hagh-202ENSMUST00000118788 1191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Vav1P27870 Gm6222-201ENSMUST00000120787 396 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Vav1P27870 Tmem262-201ENSMUST00000143303 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Vav1P27870 Khdc3-202ENSMUST00000167514 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Vav1P27870 AC158982.1-201ENSMUST00000228377 901 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Vav1P27870 Tex12-201ENSMUST00000034568 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Vav1P27870 Psrc1-202ENSMUST00000102629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Vav1P27870 Tssk4-202ENSMUST00000164809 1686 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Vav1P27870 Zfp346-201ENSMUST00000021937 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Vav1P27870 Mpl-201ENSMUST00000006556 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Vav1P27870 Klhl12-203ENSMUST00000116528 3277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Vav1P27870 Kcnh1-202ENSMUST00000110844 7161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Vav1P27870 Kcnab2-202ENSMUST00000105648 1576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Vav1P27870 Erc1-207ENSMUST00000183911 3865 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Vav1P27870 Gm38102-201ENSMUST00000192791 1935 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Vav1P27870 Gnl3-201ENSMUST00000037739 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Vav1P27870 Syk-203ENSMUST00000120135 5363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Vav1P27870 P2ry2-201ENSMUST00000037540 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Vav1P27870 Slc39a8-202ENSMUST00000081978 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Vav1P27870 Gm37691-201ENSMUST00000192147 2573 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Vav1P27870 Mapk9-210ENSMUST00000178543 4677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Vav1P27870 Tubg2-201ENSMUST00000043654 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Vav1P27870 Ncln-202ENSMUST00000118498 2841 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Vav1P27870 Plcb3-201ENSMUST00000025912 4201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Vav1P27870 Gm43056-201ENSMUST00000197865 2791 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Vav1P27870 Tmem19-203ENSMUST00000217884 2799 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Vav1P27870 Plxdc1-203ENSMUST00000107565 2439 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Vav1P27870 Lin54-201ENSMUST00000046154 4451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Vav1P27870 Sohlh2-201ENSMUST00000029369 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Vav1P27870 Mfrp-205ENSMUST00000206308 4037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.8 ms