Protein–RNA interactions for Protein: P27661

H2afx, Histone H2AX, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 143 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2afxP27661 Slitrk3-201ENSMUST00000059407 3587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
H2afxP27661 Gm43463-201ENSMUST00000195967 1803 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
H2afxP27661 Micu1-201ENSMUST00000020311 2336 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
H2afxP27661 Elf4-202ENSMUST00000114958 6088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
H2afxP27661 Sass6-206ENSMUST00000198386 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
H2afxP27661 Vmn1r45-207ENSMUST00000228492 2849 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
H2afxP27661 Tjap1-203ENSMUST00000180283 2368 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
H2afxP27661 1700022A21Rik-202ENSMUST00000182910 1448 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
H2afxP27661 Gm38575-203ENSMUST00000215824 1490 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
H2afxP27661 Klhl18-203ENSMUST00000198164 4538 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
H2afxP27661 Sbds-201ENSMUST00000026387 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
H2afxP27661 Atxn7l1-202ENSMUST00000090597 2563 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
H2afxP27661 Cpeb1-201ENSMUST00000098331 3111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
H2afxP27661 Asphd2-201ENSMUST00000031291 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
H2afxP27661 Crhr2-201ENSMUST00000003568 2695 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
H2afxP27661 Chac1-201ENSMUST00000028780 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
H2afxP27661 Blzf1-202ENSMUST00000086032 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
H2afxP27661 Miga2-208ENSMUST00000140075 2196 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
H2afxP27661 Stau1-201ENSMUST00000049412 2840 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
H2afxP27661 Kifc1-201ENSMUST00000114361 2260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
H2afxP27661 Egfem1-201ENSMUST00000118531 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
H2afxP27661 Kcnn1-204ENSMUST00000212086 2964 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
H2afxP27661 Amotl2-201ENSMUST00000035121 4328 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
H2afxP27661 Gm18489-201ENSMUST00000172565 551 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
H2afxP27661 Flg-202ENSMUST00000178008 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
H2afxP27661 Flg-205ENSMUST00000179250 765 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
H2afxP27661 Flg-206ENSMUST00000179477 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
H2afxP27661 Flg-207ENSMUST00000180293 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
H2afxP27661 Mir124-2hg-206ENSMUST00000189754 525 ntTSL 3 BASIC14.81□□□□□ -0.04
H2afxP27661 Gm38575-201ENSMUST00000213881 652 ntTSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
H2afxP27661 Mrps28-201ENSMUST00000042148 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
H2afxP27661 Cdkn2c-201ENSMUST00000063531 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
H2afxP27661 Lhb-201ENSMUST00000072453 678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
H2afxP27661 Srms-201ENSMUST00000016498 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
H2afxP27661 Pla2g15-204ENSMUST00000212963 2578 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
H2afxP27661 Slc39a8-201ENSMUST00000029810 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
H2afxP27661 Net1-201ENSMUST00000091853 2680 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
H2afxP27661 9130019O22Rik-202ENSMUST00000164345 2735 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
H2afxP27661 Tspan5-202ENSMUST00000119993 2107 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
H2afxP27661 Arhgap10-202ENSMUST00000210519 2295 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
H2afxP27661 Ppp1r15a-201ENSMUST00000042105 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
H2afxP27661 Foxd4-201ENSMUST00000058600 2345 ntAPPRIS P1 BASIC14.81□□□□□ -0.04
H2afxP27661 Zfp606-201ENSMUST00000098822 4748 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
H2afxP27661 Ubr7-201ENSMUST00000046404 3261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
H2afxP27661 Pdlim5-208ENSMUST00000196220 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
H2afxP27661 Ptpn14-201ENSMUST00000027898 2666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
H2afxP27661 Col26a1-202ENSMUST00000111103 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
H2afxP27661 Pcsk5-201ENSMUST00000025618 6675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
H2afxP27661 Ptpn7-203ENSMUST00000187985 1990 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
H2afxP27661 Wapl-205ENSMUST00000169910 4066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
H2afxP27661 Slc7a7-202ENSMUST00000195970 2057 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
H2afxP27661 Brinp1-201ENSMUST00000030036 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
H2afxP27661 Gm11738-201ENSMUST00000134069 2158 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
H2afxP27661 Plin3-201ENSMUST00000019726 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
H2afxP27661 9130008F23Rik-201ENSMUST00000068258 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
H2afxP27661 Gm42878-202ENSMUST00000200170 4783 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
H2afxP27661 0610010K14Rik-204ENSMUST00000102569 778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
H2afxP27661 Hist1h2bf-201ENSMUST00000105106 461 ntAPPRIS P1 BASIC14.8□□□□□ -0.04
H2afxP27661 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
H2afxP27661 Jpx-202ENSMUST00000182447 712 ntTSL 3 BASIC14.8□□□□□ -0.04
H2afxP27661 Gm8520-201ENSMUST00000186517 868 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
H2afxP27661 Flt3l-206ENSMUST00000210197 834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
H2afxP27661 1300002E11Rik-207ENSMUST00000211443 767 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
H2afxP27661 Gm6296-201ENSMUST00000222599 943 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
H2afxP27661 Bax-201ENSMUST00000033093 867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
H2afxP27661 Wfdc6b-201ENSMUST00000094346 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
H2afxP27661 Pla2g12b-201ENSMUST00000009790 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
H2afxP27661 Fbxo41-201ENSMUST00000159062 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
H2afxP27661 Sema6c-201ENSMUST00000090821 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
H2afxP27661 Ppt2-205ENSMUST00000169067 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
H2afxP27661 Scamp3-203ENSMUST00000120697 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
H2afxP27661 Dmap1-201ENSMUST00000102687 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
H2afxP27661 Pik3cd-214ENSMUST00000177654 4765 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
H2afxP27661 Rtn3-203ENSMUST00000088169 1709 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
H2afxP27661 AC154747.3-201ENSMUST00000224471 3470 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
H2afxP27661 Bap1-201ENSMUST00000022458 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
H2afxP27661 Trp53-203ENSMUST00000108658 1771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
H2afxP27661 Trp53-201ENSMUST00000005371 1772 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
H2afxP27661 Gm17435-202ENSMUST00000212699 1998 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
H2afxP27661 Gli1-201ENSMUST00000026474 4057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
H2afxP27661 Trpm4-201ENSMUST00000042194 4234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
H2afxP27661 Grk6-202ENSMUST00000099482 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
H2afxP27661 Stx3-203ENSMUST00000075304 2430 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
H2afxP27661 Tgm1-201ENSMUST00000002389 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
H2afxP27661 Cyth1-203ENSMUST00000106302 3119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
H2afxP27661 Phf13-201ENSMUST00000055688 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
H2afxP27661 Dnmt3b-204ENSMUST00000088976 4130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
H2afxP27661 Dhx9-202ENSMUST00000186380 4561 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
H2afxP27661 Muc6-202ENSMUST00000189314 5087 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
H2afxP27661 Pard3-222ENSMUST00000162536 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
H2afxP27661 Mier3-203ENSMUST00000109272 5279 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
H2afxP27661 Gm10013-201ENSMUST00000106074 672 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
H2afxP27661 Tnfsf13-202ENSMUST00000108648 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
H2afxP27661 Oprl1-203ENSMUST00000108766 1241 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
H2afxP27661 Ppara-202ENSMUST00000109422 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
H2afxP27661 Mtif3-203ENSMUST00000110564 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
H2afxP27661 Mtif3-204ENSMUST00000110566 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
H2afxP27661 Adal-204ENSMUST00000110665 2356 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
H2afxP27661 Gmcl1-202ENSMUST00000113679 960 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
H2afxP27661 Gm8668-201ENSMUST00000120559 1447 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.9 ms