Protein–RNA interactions for Protein: P26618

Pdgfra, Platelet-derived growth factor receptor alpha, mousemouse

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Length 1,089 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PdgfraP26618 Gm42934-201ENSMUST00000196920 1345 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
PdgfraP26618 Retreg1-202ENSMUST00000110438 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
PdgfraP26618 Asb16-201ENSMUST00000036467 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
PdgfraP26618 Otop3-202ENSMUST00000106543 2369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
PdgfraP26618 Asphd1-202ENSMUST00000106339 518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
PdgfraP26618 Gm15440-201ENSMUST00000110042 1231 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
PdgfraP26618 Pex11g-202ENSMUST00000111081 666 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
PdgfraP26618 Rnd1-203ENSMUST00000120997 856 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
PdgfraP26618 Gm11025-201ENSMUST00000140773 466 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
PdgfraP26618 Gm11535-201ENSMUST00000145517 778 ntTSL 3 BASIC14.73□□□□□ -0.05
PdgfraP26618 2810408I11Rik-202ENSMUST00000150749 711 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
PdgfraP26618 Ndufa1-201ENSMUST00000016571 419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
PdgfraP26618 Ankrd13d-204ENSMUST00000167215 639 ntTSL 3 BASIC14.73□□□□□ -0.05
PdgfraP26618 Gm18737-201ENSMUST00000173594 937 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
PdgfraP26618 Ighv1-15-201ENSMUST00000192077 351 ntAPPRIS P1 BASIC14.73□□□□□ -0.05
PdgfraP26618 AC166341.4-201ENSMUST00000220625 123 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
PdgfraP26618 Prpf3-201ENSMUST00000015892 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
PdgfraP26618 Ick-203ENSMUST00000117330 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
PdgfraP26618 Rab3a-204ENSMUST00000110093 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
PdgfraP26618 Oscar-202ENSMUST00000108645 1829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
PdgfraP26618 Oscar-201ENSMUST00000039507 1823 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
PdgfraP26618 Tmem211-201ENSMUST00000086615 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
PdgfraP26618 Sipa1-203ENSMUST00000164304 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
PdgfraP26618 9130008F23Rik-201ENSMUST00000068258 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
PdgfraP26618 Gm42872-201ENSMUST00000200026 1967 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
PdgfraP26618 Jpt1-201ENSMUST00000021083 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
PdgfraP26618 Ilkap-201ENSMUST00000027534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
PdgfraP26618 Ccp110-202ENSMUST00000106557 5073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
PdgfraP26618 Hps5-201ENSMUST00000014562 4953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
PdgfraP26618 Nsd3-211ENSMUST00000155861 2834 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
PdgfraP26618 Gins2-201ENSMUST00000034278 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
PdgfraP26618 Gm19461-205ENSMUST00000191207 2566 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
PdgfraP26618 Myocd-202ENSMUST00000102635 4935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
PdgfraP26618 Bnipl-204ENSMUST00000137250 1251 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
PdgfraP26618 A530058N18Rik-205ENSMUST00000143993 550 ntTSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
PdgfraP26618 Gm17251-201ENSMUST00000170103 925 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
PdgfraP26618 Six3os1-205ENSMUST00000175913 791 ntTSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
PdgfraP26618 Gm20036-201ENSMUST00000177547 844 ntTSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
PdgfraP26618 Gm32351-201ENSMUST00000220503 438 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
PdgfraP26618 Caly-201ENSMUST00000026541 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
PdgfraP26618 Cfdp1-201ENSMUST00000034432 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
PdgfraP26618 C1qa-201ENSMUST00000046285 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
PdgfraP26618 Gm10073-201ENSMUST00000073722 496 ntAPPRIS P1 BASIC14.72□□□□□ -0.05
PdgfraP26618 Rplp1-201ENSMUST00000008036 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
PdgfraP26618 Taok2-201ENSMUST00000071268 4720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
PdgfraP26618 Noct-201ENSMUST00000023849 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
PdgfraP26618 Srp68-202ENSMUST00000106425 2330 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
PdgfraP26618 Dhrs3-206ENSMUST00000154208 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
PdgfraP26618 Otop2-201ENSMUST00000055490 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
PdgfraP26618 Tacc3-201ENSMUST00000074849 2669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
PdgfraP26618 Il15-201ENSMUST00000034148 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
PdgfraP26618 Syt1-201ENSMUST00000064054 4745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
PdgfraP26618 Glmn-202ENSMUST00000082121 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
PdgfraP26618 Fzd7-201ENSMUST00000114246 4532 ntAPPRIS P1 BASIC14.72□□□□□ -0.05
PdgfraP26618 Hsph1-211ENSMUST00000202361 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
PdgfraP26618 Arpc1b-201ENSMUST00000085679 3105 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
PdgfraP26618 Dcp1b-201ENSMUST00000073909 1748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
PdgfraP26618 Gcnt2-205ENSMUST00000225759 1366 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
PdgfraP26618 Hnrnpm-202ENSMUST00000114385 2550 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
PdgfraP26618 Gm11190-201ENSMUST00000132487 3414 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
PdgfraP26618 Vps26b-201ENSMUST00000034470 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
PdgfraP26618 Kcnk6-201ENSMUST00000085818 4084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
PdgfraP26618 Zbtb20-203ENSMUST00000114691 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
PdgfraP26618 2410018L13Rik-205ENSMUST00000149246 3370 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
PdgfraP26618 Fbxo41-202ENSMUST00000161078 6562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
PdgfraP26618 Slc16a13-201ENSMUST00000060010 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
PdgfraP26618 Tspan11-201ENSMUST00000032501 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
PdgfraP26618 Slc41a3-201ENSMUST00000032177 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
PdgfraP26618 Rcbtb1-202ENSMUST00000043227 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
PdgfraP26618 Pou2f2-209ENSMUST00000175774 7047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
PdgfraP26618 A230077H06Rik-201ENSMUST00000188579 2918 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
PdgfraP26618 Aldh1a2-201ENSMUST00000034723 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
PdgfraP26618 Timp4-201ENSMUST00000032462 5496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
PdgfraP26618 Il11-201ENSMUST00000094892 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
PdgfraP26618 Stk16-201ENSMUST00000027401 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
PdgfraP26618 Gm12017-201ENSMUST00000122453 1003 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
PdgfraP26618 Dph3-205ENSMUST00000124303 809 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
PdgfraP26618 2410006H16Rik-201ENSMUST00000131787 462 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
PdgfraP26618 Pbx2-205ENSMUST00000183827 1186 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
PdgfraP26618 Trip6-203ENSMUST00000199121 366 ntTSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
PdgfraP26618 Hapln3-202ENSMUST00000205782 930 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
PdgfraP26618 Gm44662-201ENSMUST00000206970 412 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
PdgfraP26618 Gm45612-201ENSMUST00000211320 160 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
PdgfraP26618 Tsfm-201ENSMUST00000040560 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
PdgfraP26618 Atad3aos-201ENSMUST00000067628 971 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
PdgfraP26618 Mfsd1-201ENSMUST00000029344 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
PdgfraP26618 Gm10125-203ENSMUST00000161096 3493 ntTSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
PdgfraP26618 Igha-202ENSMUST00000194738 2540 ntAPPRIS P5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
PdgfraP26618 Fgfr3-210ENSMUST00000169212 4245 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
PdgfraP26618 Ces1h-201ENSMUST00000145041 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
PdgfraP26618 Pfkfb3-203ENSMUST00000100411 2008 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
PdgfraP26618 St6gal2-202ENSMUST00000086878 2606 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
PdgfraP26618 Acaa2-201ENSMUST00000041053 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
PdgfraP26618 Itga3-201ENSMUST00000001548 4861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
PdgfraP26618 Pltp-201ENSMUST00000059954 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
PdgfraP26618 Pbx2-203ENSMUST00000173328 1990 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.06
PdgfraP26618 Fam192a-201ENSMUST00000034226 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
PdgfraP26618 Reep5-201ENSMUST00000006027 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
PdgfraP26618 Jph3-201ENSMUST00000026357 3637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
PdgfraP26618 Syngap1-202ENSMUST00000177932 3927 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.06
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