Protein–RNA interactions for Protein: P26043

Rdx, Radixin, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 583 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RdxP26043 Derl3-202ENSMUST00000217811 1316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
RdxP26043 Esrrb-202ENSMUST00000110203 2363 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
RdxP26043 Cacna2d2-204ENSMUST00000166799 3474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
RdxP26043 Lypd1-205ENSMUST00000162899 1511 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
RdxP26043 Atp6v1c2-201ENSMUST00000020884 1569 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
RdxP26043 Zbtb20-205ENSMUST00000114695 2977 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
RdxP26043 Cad-206ENSMUST00000201838 3153 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
RdxP26043 Dhx37-201ENSMUST00000169485 4760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RdxP26043 Trem1-202ENSMUST00000113251 2077 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RdxP26043 Gm5639-201ENSMUST00000122305 2403 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
RdxP26043 E2f3-203ENSMUST00000221536 4597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RdxP26043 E2f3-204ENSMUST00000222730 4579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RdxP26043 Nsd3-211ENSMUST00000155861 2834 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RdxP26043 Mmp14-206ENSMUST00000225641 3238 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
RdxP26043 Actr1b-201ENSMUST00000043951 3248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RdxP26043 Park7-203ENSMUST00000105674 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
RdxP26043 Nfs1-202ENSMUST00000109600 709 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RdxP26043 Tmem255b-201ENSMUST00000167071 1138 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RdxP26043 Sardhos-201ENSMUST00000170435 265 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
RdxP26043 Coa3-201ENSMUST00000017332 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RdxP26043 Tac4-201ENSMUST00000021242 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RdxP26043 AC161829.1-201ENSMUST00000220298 281 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
RdxP26043 Wfdc6b-201ENSMUST00000094346 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RdxP26043 Gm3928-201ENSMUST00000121141 1307 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
RdxP26043 Gm37500-201ENSMUST00000192059 1443 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
RdxP26043 Rnase10-202ENSMUST00000164632 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RdxP26043 Rad9a-201ENSMUST00000025740 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RdxP26043 Wdr73-201ENSMUST00000026816 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RdxP26043 Acin1-216ENSMUST00000141453 2381 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RdxP26043 Gabpb1-205ENSMUST00000110424 2613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RdxP26043 Tmem38b-201ENSMUST00000030127 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RdxP26043 Il17re-202ENSMUST00000058548 2940 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RdxP26043 Pgghg-201ENSMUST00000079403 2981 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RdxP26043 Dcp1b-202ENSMUST00000112777 3313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RdxP26043 Esr1-204ENSMUST00000105590 6339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
RdxP26043 Dab2ip-206ENSMUST00000112987 6287 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
RdxP26043 Gm35339-201ENSMUST00000208833 5090 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
RdxP26043 Pnkd-201ENSMUST00000027370 2937 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
RdxP26043 Dlst-201ENSMUST00000053811 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
RdxP26043 Slc25a19-212ENSMUST00000178003 2614 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
RdxP26043 Cnot7-201ENSMUST00000034012 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
RdxP26043 Kif3a-208ENSMUST00000173744 2257 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
RdxP26043 Lrrc17-201ENSMUST00000035651 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
RdxP26043 Arhgap40-203ENSMUST00000165398 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
RdxP26043 Fam161a-205ENSMUST00000172602 1935 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
RdxP26043 Trim80-201ENSMUST00000093914 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
RdxP26043 Fuca2-203ENSMUST00000121465 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
RdxP26043 Sv2b-202ENSMUST00000165175 5524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
RdxP26043 Dlk1-205ENSMUST00000109844 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
RdxP26043 Elk3-201ENSMUST00000008542 4212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
RdxP26043 Slc25a5-201ENSMUST00000016463 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
RdxP26043 Saa2-203ENSMUST00000210769 652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
RdxP26043 Saa2-201ENSMUST00000075982 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
RdxP26043 Dgcr6-202ENSMUST00000076757 894 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
RdxP26043 Srsf10-205ENSMUST00000126641 3754 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
RdxP26043 Asap1-217ENSMUST00000177371 6164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
RdxP26043 Rnf152-202ENSMUST00000172299 8406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
RdxP26043 Pank1-201ENSMUST00000036584 3460 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
RdxP26043 Dcaf7-201ENSMUST00000058438 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
RdxP26043 Spsb1-201ENSMUST00000038562 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
RdxP26043 Txlng-203ENSMUST00000112315 2525 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
RdxP26043 Samd11-202ENSMUST00000217934 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
RdxP26043 Mau2-202ENSMUST00000168013 5323 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
RdxP26043 Stip1-201ENSMUST00000025918 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
RdxP26043 Necab1-201ENSMUST00000041606 4922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
RdxP26043 Esm1-201ENSMUST00000038144 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
RdxP26043 Olfr322-202ENSMUST00000213232 4632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
RdxP26043 Gm3373-202ENSMUST00000177556 1955 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
RdxP26043 Gm3500-201ENSMUST00000177986 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
RdxP26043 Smim14-205ENSMUST00000139122 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
RdxP26043 Hid1-201ENSMUST00000044152 3236 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
RdxP26043 Thnsl2-201ENSMUST00000074241 1821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
RdxP26043 Ilvbl-208ENSMUST00000218875 3020 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
RdxP26043 Nr2c2-201ENSMUST00000113460 7647 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
RdxP26043 Tmem169-201ENSMUST00000027380 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
RdxP26043 Snai3-201ENSMUST00000006762 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
RdxP26043 4933426K07Rik-201ENSMUST00000143009 1548 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
RdxP26043 Pccb-201ENSMUST00000035116 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
RdxP26043 Gstt2-201ENSMUST00000038257 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
RdxP26043 4930528D03Rik-201ENSMUST00000181528 1339 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
RdxP26043 Lrrc25-201ENSMUST00000052437 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
RdxP26043 Tmem254c-202ENSMUST00000100819 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
RdxP26043 A3galt2-202ENSMUST00000106077 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
RdxP26043 Gm15655-201ENSMUST00000134649 440 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
RdxP26043 Gm7230-201ENSMUST00000173026 815 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
RdxP26043 Gm10499-201ENSMUST00000174094 934 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
RdxP26043 1600014C10Rik-209ENSMUST00000179992 568 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
RdxP26043 Gm26756-201ENSMUST00000181689 1294 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
RdxP26043 Bag2-203ENSMUST00000187602 378 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
RdxP26043 4930442P19Rik-201ENSMUST00000193163 1240 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
RdxP26043 AC122024.2-201ENSMUST00000220086 871 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
RdxP26043 AC159106.1-201ENSMUST00000224421 690 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
RdxP26043 Cda-201ENSMUST00000030535 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
RdxP26043 Mrpl54-201ENSMUST00000046114 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
RdxP26043 Pfkfb3-203ENSMUST00000100411 2008 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
RdxP26043 Gm12626-201ENSMUST00000117339 1983 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
RdxP26043 Gm12623-201ENSMUST00000119849 1983 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
RdxP26043 Gm26565-201ENSMUST00000181642 1968 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
RdxP26043 Tceanc2-202ENSMUST00000057043 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
RdxP26043 Speg-205ENSMUST00000113590 3393 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58.1 ms