Protein–RNA interactions for Protein: P23812

Hoxd12, Homeobox protein Hox-D12, mousemouse

Predictions only

Length 268 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd12P23812 Nfatc1-204ENSMUST00000170905 4896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
Hoxd12P23812 Sh2b3-204ENSMUST00000122426 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
Hoxd12P23812 Nap1l1-203ENSMUST00000217908 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
Hoxd12P23812 9630013D21Rik-204ENSMUST00000156790 3096 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
Hoxd12P23812 Rsrc1-205ENSMUST00000161726 3213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Hoxd12P23812 Pgbd5-201ENSMUST00000052580 2824 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
Hoxd12P23812 Zfp707-201ENSMUST00000109966 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Hoxd12P23812 Gm6297-201ENSMUST00000181475 2146 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Hoxd12P23812 Nfat5-203ENSMUST00000125721 5899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
Hoxd12P23812 Serf2-204ENSMUST00000139253 3056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Hoxd12P23812 Ralgapa1-201ENSMUST00000085385 7901 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Hoxd12P23812 Gm10676-201ENSMUST00000098778 3221 ntBASIC14.2□□□□□ -0.14
Hoxd12P23812 Syp-201ENSMUST00000069520 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Hoxd12P23812 Lims1-203ENSMUST00000105468 1205 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Hoxd12P23812 Gm12384-201ENSMUST00000119228 919 ntBASIC14.2□□□□□ -0.14
Hoxd12P23812 Gm13612-201ENSMUST00000119276 390 ntBASIC14.2□□□□□ -0.14
Hoxd12P23812 Ccdc24-209ENSMUST00000171052 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
Hoxd12P23812 Gm43403-202ENSMUST00000198830 370 ntTSL 3 BASIC14.2□□□□□ -0.14
Hoxd12P23812 Gm11149-204ENSMUST00000216483 1275 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Hoxd12P23812 Rit1-201ENSMUST00000029692 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Hoxd12P23812 Aym1-201ENSMUST00000066573 528 ntAPPRIS P1 BASIC14.2□□□□□ -0.14
Hoxd12P23812 Mindy4-203ENSMUST00000204842 2211 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Hoxd12P23812 Apmap-201ENSMUST00000046399 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Hoxd12P23812 Kctd18-202ENSMUST00000114410 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Hoxd12P23812 Nt5c2-203ENSMUST00000172239 3148 ntTSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
Hoxd12P23812 Stard5-201ENSMUST00000075418 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Hoxd12P23812 Lrrc7-204ENSMUST00000199890 6326 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Hoxd12P23812 Creld2-201ENSMUST00000024042 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Hoxd12P23812 Edem2-201ENSMUST00000040833 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Hoxd12P23812 Gm26793-201ENSMUST00000180930 2732 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Hoxd12P23812 Rbm15-201ENSMUST00000061772 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Hoxd12P23812 Ttll3-202ENSMUST00000038889 3114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
Hoxd12P23812 Klf15-202ENSMUST00000113530 2374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
Hoxd12P23812 Mcidas-201ENSMUST00000092089 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Hoxd12P23812 Gm13050-201ENSMUST00000122149 1345 ntBASIC14.19□□□□□ -0.14
Hoxd12P23812 Irf3-201ENSMUST00000003284 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Hoxd12P23812 Cd151-202ENSMUST00000106000 1865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
Hoxd12P23812 Pdia2-201ENSMUST00000039113 1721 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Hoxd12P23812 Zfp57-201ENSMUST00000069250 1749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Hoxd12P23812 Camkk2-201ENSMUST00000111668 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Hoxd12P23812 Xylt2-201ENSMUST00000116349 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Hoxd12P23812 1810008I18Rik-201ENSMUST00000185464 2419 ntBASIC14.19□□□□□ -0.14
Hoxd12P23812 Zc3h13-203ENSMUST00000227049 6144 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.19□□□□□ -0.14
Hoxd12P23812 Kif12-201ENSMUST00000030042 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Hoxd12P23812 Chtop-206ENSMUST00000107344 2972 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Hoxd12P23812 Gm16342-201ENSMUST00000124025 1025 ntBASIC14.19□□□□□ -0.14
Hoxd12P23812 Gm16282-201ENSMUST00000162641 451 ntTSL 3 BASIC14.19□□□□□ -0.14
Hoxd12P23812 Gm8801-201ENSMUST00000173255 1064 ntBASIC14.19□□□□□ -0.14
Hoxd12P23812 Gm20036-201ENSMUST00000177547 844 ntTSL 3 BASIC14.19□□□□□ -0.14
Hoxd12P23812 Fcrl1-204ENSMUST00000191666 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Hoxd12P23812 Gm44397-201ENSMUST00000195950 113 ntBASIC14.19□□□□□ -0.14
Hoxd12P23812 Gm5276-201ENSMUST00000196683 1047 ntBASIC14.19□□□□□ -0.14
Hoxd12P23812 Gm43240-201ENSMUST00000198543 630 ntTSL 3 BASIC14.19□□□□□ -0.14
Hoxd12P23812 1700127F24Rik-201ENSMUST00000221685 604 ntBASIC14.19□□□□□ -0.14
Hoxd12P23812 Rrp36-201ENSMUST00000024766 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Hoxd12P23812 Mal-201ENSMUST00000028853 486 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Hoxd12P23812 Wdr83-201ENSMUST00000093357 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Hoxd12P23812 Fut7-203ENSMUST00000114278 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Hoxd12P23812 Fut7-201ENSMUST00000041654 1970 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
Hoxd12P23812 Hnf1b-203ENSMUST00000108114 2659 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Hoxd12P23812 Opn5-201ENSMUST00000068355 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Hoxd12P23812 Mief2-201ENSMUST00000018743 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Hoxd12P23812 Cog8-202ENSMUST00000095517 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Hoxd12P23812 Gm43352-201ENSMUST00000196419 3065 ntBASIC14.19□□□□□ -0.14
Hoxd12P23812 Zfp639-205ENSMUST00000193287 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Hoxd12P23812 Klf15-204ENSMUST00000203607 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Hoxd12P23812 Dpagt1-201ENSMUST00000054708 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Hoxd12P23812 Fam174a-202ENSMUST00000186780 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Hoxd12P23812 Psmb9-204ENSMUST00000174576 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Hoxd12P23812 Spon1-202ENSMUST00000084696 5201 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Hoxd12P23812 Sipa1l1-202ENSMUST00000166429 8215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Hoxd12P23812 Dnajc1-209ENSMUST00000166495 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Hoxd12P23812 Nyx-201ENSMUST00000050434 5183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Hoxd12P23812 Dact1-201ENSMUST00000061273 3650 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Hoxd12P23812 Pgap2-225ENSMUST00000156529 2034 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Hoxd12P23812 Naa50-203ENSMUST00000159514 3756 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Hoxd12P23812 Tmem185b-202ENSMUST00000183952 2824 ntAPPRIS P1 BASIC14.19□□□□□ -0.14
Hoxd12P23812 Fbln1-202ENSMUST00000109432 2273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Hoxd12P23812 Slc7a7-206ENSMUST00000197440 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Hoxd12P23812 AC093043.3-201ENSMUST00000226531 2273 ntBASIC14.18□□□□□ -0.14
Hoxd12P23812 Ovca2-201ENSMUST00000071562 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Hoxd12P23812 Adcyap1r1-208ENSMUST00000172084 1344 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
Hoxd12P23812 Fnbp1-208ENSMUST00000113560 4726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Hoxd12P23812 Zbtb25-205ENSMUST00000176509 1591 ntTSL 2 BASIC14.18□□□□□ -0.14
Hoxd12P23812 Usp38-201ENSMUST00000042724 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Hoxd12P23812 Gnat1-201ENSMUST00000010205 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Hoxd12P23812 2700080J24Rik-201ENSMUST00000205314 1662 ntBASIC14.18□□□□□ -0.14
Hoxd12P23812 Hsph1-209ENSMUST00000202089 3054 ntTSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
Hoxd12P23812 Gm15376-201ENSMUST00000122258 783 ntBASIC14.18□□□□□ -0.14
Hoxd12P23812 Gm42420-201ENSMUST00000126621 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.18□□□□□ -0.14
Hoxd12P23812 Gm13112-201ENSMUST00000138795 1258 ntTSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Hoxd12P23812 Zdhhc4-208ENSMUST00000161915 1216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
Hoxd12P23812 Nudt17-202ENSMUST00000171249 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Hoxd12P23812 Cox6b2-204ENSMUST00000182173 391 ntTSL 2 BASIC14.18□□□□□ -0.14
Hoxd12P23812 Gm5370-201ENSMUST00000187187 574 ntBASIC14.18□□□□□ -0.14
Hoxd12P23812 2310040G24Rik-202ENSMUST00000189386 775 ntTSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Hoxd12P23812 Gm38671-201ENSMUST00000200573 130 ntBASIC14.18□□□□□ -0.14
Hoxd12P23812 Cox7a2-201ENSMUST00000034881 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Hoxd12P23812 Olfr707-201ENSMUST00000088687 924 ntAPPRIS P1 BASIC14.18□□□□□ -0.14
Hoxd12P23812 Olfr1532-ps1-201ENSMUST00000098140 924 ntAPPRIS P1 BASIC14.18□□□□□ -0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 69.2 ms