Protein–RNA interactions for Protein: P23440

Pde6b, Rod cGMP-specific 3',5'-cyclic phosphodiesterase subunit beta, mousemouse

Predictions only

Length 856 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pde6bP23440 1700072B07Rik-201ENSMUST00000191141 445 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Pde6bP23440 Ighv5-13-201ENSMUST00000193550 290 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Pde6bP23440 Inpp4a-213ENSMUST00000193774 1243 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Pde6bP23440 Gm6745-201ENSMUST00000199216 526 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Pde6bP23440 Tbc1d17-209ENSMUST00000207293 692 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Pde6bP23440 Tspan3-203ENSMUST00000215906 842 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Pde6bP23440 Mzt2-201ENSMUST00000023351 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Pde6bP23440 Epo-201ENSMUST00000031723 715 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Pde6bP23440 Ufsp1-201ENSMUST00000052825 1037 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Pde6bP23440 Olfr1412-201ENSMUST00000062964 966 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Pde6bP23440 Ppm1m-201ENSMUST00000076258 1811 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Pde6bP23440 Hacd4-201ENSMUST00000030221 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Pde6bP23440 Ccdc43-205ENSMUST00000164506 2316 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Pde6bP23440 Dek-201ENSMUST00000021807 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Pde6bP23440 Polr3d-202ENSMUST00000180358 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Pde6bP23440 Ntn4-201ENSMUST00000020204 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Pde6bP23440 AI606473-201ENSMUST00000177201 1731 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Pde6bP23440 5730559C18Rik-201ENSMUST00000120339 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Pde6bP23440 Ano10-201ENSMUST00000042546 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Pde6bP23440 Loxl2-201ENSMUST00000022660 5316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Pde6bP23440 Gm37912-201ENSMUST00000191895 3076 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Pde6bP23440 Mospd3-202ENSMUST00000111007 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Pde6bP23440 Fkbp4-201ENSMUST00000032508 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Pde6bP23440 Iws1-206ENSMUST00000212675 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Pde6bP23440 Dnmt3b-201ENSMUST00000056495 4318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Pde6bP23440 Prrx2-202ENSMUST00000113592 1070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Pde6bP23440 Gm14042-201ENSMUST00000120139 833 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Pde6bP23440 Gm7820-201ENSMUST00000121012 1052 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Pde6bP23440 Kxd1-204ENSMUST00000121623 884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Pde6bP23440 1600025M17Rik-202ENSMUST00000151426 547 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Pde6bP23440 Gm12446-202ENSMUST00000152069 713 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Pde6bP23440 Gm23984-201ENSMUST00000157139 203 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Pde6bP23440 Gm29585-201ENSMUST00000185270 514 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Pde6bP23440 Pemt-201ENSMUST00000000310 953 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Pde6bP23440 Hist1h3f-201ENSMUST00000075558 1261 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Pde6bP23440 Kxd1-201ENSMUST00000093456 1216 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Pde6bP23440 Rgs14-201ENSMUST00000063771 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Pde6bP23440 Abcf2-201ENSMUST00000030795 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Pde6bP23440 Kcnc4-201ENSMUST00000009617 3667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Pde6bP23440 Asah1-201ENSMUST00000034000 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Pde6bP23440 Sema3b-204ENSMUST00000102531 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Pde6bP23440 Osbpl8-201ENSMUST00000095310 3622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Pde6bP23440 A330035P11Rik-202ENSMUST00000144926 3074 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pde6bP23440 Tmem40-202ENSMUST00000112946 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pde6bP23440 Amz2-202ENSMUST00000092500 2816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pde6bP23440 Klk8-201ENSMUST00000085461 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pde6bP23440 Pde4d-204ENSMUST00000117879 1724 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pde6bP23440 Ube2d3-210ENSMUST00000197539 2515 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pde6bP23440 1600014C10Rik-205ENSMUST00000178876 3283 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pde6bP23440 Zdhhc7-201ENSMUST00000034280 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pde6bP23440 Mmp28-203ENSMUST00000108137 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pde6bP23440 Nyap1-204ENSMUST00000212152 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pde6bP23440 Gm11555-202ENSMUST00000104929 638 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pde6bP23440 Rnd1-202ENSMUST00000109149 1034 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pde6bP23440 Tpt1-ps6-201ENSMUST00000121768 523 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Pde6bP23440 Pigyl-201ENSMUST00000123680 695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pde6bP23440 Lce1j-202ENSMUST00000186525 703 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pde6bP23440 Mir124-2hg-206ENSMUST00000189754 525 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pde6bP23440 Lamtor1-202ENSMUST00000193465 661 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pde6bP23440 Gm18018-201ENSMUST00000198273 408 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Pde6bP23440 Mpv17-207ENSMUST00000201491 923 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pde6bP23440 0610005C13Rik-201ENSMUST00000209416 856 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pde6bP23440 Cnpy2-201ENSMUST00000026446 763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pde6bP23440 Rps15-201ENSMUST00000062674 572 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pde6bP23440 Hist1h2aa-201ENSMUST00000072391 390 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pde6bP23440 Cox6b1-201ENSMUST00000075738 618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pde6bP23440 Trmt6-201ENSMUST00000039554 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pde6bP23440 Nup88-202ENSMUST00000108530 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pde6bP23440 Oxtr-201ENSMUST00000053306 4704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pde6bP23440 Wdr70-201ENSMUST00000045766 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pde6bP23440 Ciart-202ENSMUST00000159739 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pde6bP23440 Il18r1-203ENSMUST00000167723 1919 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pde6bP23440 Zdhhc23-201ENSMUST00000036321 1380 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pde6bP23440 Bscl2-201ENSMUST00000086058 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pde6bP23440 Nkd2-202ENSMUST00000118096 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pde6bP23440 Mst1-201ENSMUST00000035211 2262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pde6bP23440 Drd5-201ENSMUST00000041646 3152 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pde6bP23440 Gpr155-202ENSMUST00000076463 5061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pde6bP23440 Dhrs1-201ENSMUST00000002403 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pde6bP23440 Tmem59l-201ENSMUST00000045286 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pde6bP23440 Kcnq2-217ENSMUST00000149964 8209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pde6bP23440 Rad51-201ENSMUST00000028795 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pde6bP23440 Ube2j2-206ENSMUST00000118192 922 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pde6bP23440 Tmem219-204ENSMUST00000121532 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pde6bP23440 Cxcl17-202ENSMUST00000200880 760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pde6bP23440 Gm19265-201ENSMUST00000201818 894 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pde6bP23440 AC165157.4-201ENSMUST00000220587 139 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Pde6bP23440 Gm6180-201ENSMUST00000065243 498 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Pde6bP23440 Cxcl17-201ENSMUST00000074040 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pde6bP23440 Map2k7-206ENSMUST00000110998 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pde6bP23440 Spock1-205ENSMUST00000187852 3113 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pde6bP23440 Zfp574-201ENSMUST00000053410 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pde6bP23440 Cers5-202ENSMUST00000109035 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pde6bP23440 Psmd12-201ENSMUST00000021063 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pde6bP23440 Dmxl1-202ENSMUST00000180611 11319 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pde6bP23440 Celf3-201ENSMUST00000029784 2744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pde6bP23440 Lhx3-201ENSMUST00000028302 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pde6bP23440 Camsap2-202ENSMUST00000192001 6329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pde6bP23440 Patz1-202ENSMUST00000093402 3173 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pde6bP23440 Lpar5-201ENSMUST00000088292 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 62.6 ms