Protein–RNA interactions for Protein: P21107

Tpm3, Tropomyosin alpha-3 chain, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 285 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tpm3P21107 Gm38355-201ENSMUST00000192514 1570 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Tpm3P21107 Psph-201ENSMUST00000031399 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Tpm3P21107 Prrc2b-201ENSMUST00000036691 8612 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Tpm3P21107 Evl-203ENSMUST00000109854 1870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Tpm3P21107 Cmpk1-201ENSMUST00000030491 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Tpm3P21107 Rbmx-203ENSMUST00000114730 2019 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Tpm3P21107 Gm13848-201ENSMUST00000130777 2047 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Tpm3P21107 Dmkn-204ENSMUST00000085691 2007 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Tpm3P21107 Eya1-203ENSMUST00000168081 4366 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Tpm3P21107 Rims1-205ENSMUST00000097811 6446 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Tpm3P21107 Ubap2l-204ENSMUST00000195995 3516 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Tpm3P21107 Asap1-217ENSMUST00000177371 6164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Tpm3P21107 2310011J03Rik-201ENSMUST00000020341 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Tpm3P21107 Gm37133-201ENSMUST00000192705 1922 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Tpm3P21107 Fmnl2-205ENSMUST00000155586 3939 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.14
Tpm3P21107 1700037C18Rik-202ENSMUST00000115859 2592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Tpm3P21107 Cd302-202ENSMUST00000074606 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Tpm3P21107 Parp10-202ENSMUST00000165738 3367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Tpm3P21107 Syvn1-201ENSMUST00000025723 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Tpm3P21107 Gm6159-201ENSMUST00000191249 1724 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Tpm3P21107 Gnb2-212ENSMUST00000150063 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Tpm3P21107 Rad17-202ENSMUST00000177848 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Tpm3P21107 Rbm11-201ENSMUST00000046378 1400 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Tpm3P21107 0610010K14Rik-204ENSMUST00000102569 778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Tpm3P21107 Capns2-201ENSMUST00000104947 1005 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Tpm3P21107 Gmnn-202ENSMUST00000110382 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Tpm3P21107 Cops9-202ENSMUST00000112999 653 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Tpm3P21107 Olfr286-202ENSMUST00000205305 969 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Tpm3P21107 Hsd17b14-205ENSMUST00000210300 797 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Tpm3P21107 Rbfox2-207ENSMUST00000227533 1041 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Tpm3P21107 Ifi27-204ENSMUST00000079294 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Tpm3P21107 Gm10190-201ENSMUST00000086549 324 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Tpm3P21107 Speg-205ENSMUST00000113590 3393 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Tpm3P21107 Malt1-202ENSMUST00000224056 4028 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Tpm3P21107 Morc4-202ENSMUST00000087401 3862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Tpm3P21107 B3galnt2-201ENSMUST00000099747 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Tpm3P21107 Spg7-202ENSMUST00000125975 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Tpm3P21107 Pla2g5-204ENSMUST00000102513 2289 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Tpm3P21107 Gm9252-201ENSMUST00000172364 1602 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Tpm3P21107 Cacna1g-204ENSMUST00000107785 7523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Tpm3P21107 Me2-201ENSMUST00000025439 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Tpm3P21107 Ap4b1-207ENSMUST00000200377 1823 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Tpm3P21107 Gcfc2-201ENSMUST00000043195 4192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Tpm3P21107 Kars-203ENSMUST00000164470 2189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Tpm3P21107 Tecpr1-201ENSMUST00000085701 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Tpm3P21107 Dhtkd1-202ENSMUST00000095147 5480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Tpm3P21107 Ahsa1-201ENSMUST00000021425 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Tpm3P21107 Chrnd-202ENSMUST00000186373 2949 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Tpm3P21107 Zfp862-ps-204ENSMUST00000204484 6065 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Tpm3P21107 Mta2-201ENSMUST00000096240 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Tpm3P21107 Cacna1b-205ENSMUST00000114447 6987 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Tpm3P21107 Lingo1-202ENSMUST00000114247 2287 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Tpm3P21107 Pnpla2-203ENSMUST00000164016 2625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Tpm3P21107 Pde4d-203ENSMUST00000117420 1955 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Tpm3P21107 Pip5k1c-201ENSMUST00000045469 4323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Tpm3P21107 Cd3d-201ENSMUST00000034602 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Tpm3P21107 Mfsd4a-205ENSMUST00000144548 3288 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Tpm3P21107 Gm12644-201ENSMUST00000119935 606 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Tpm3P21107 Ly6g6e-204ENSMUST00000172959 501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Tpm3P21107 H2-Bl-201ENSMUST00000173080 1138 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Tpm3P21107 H2-Bl-211ENSMUST00000195838 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Tpm3P21107 Vmn2r-ps89-201ENSMUST00000209195 1010 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Tpm3P21107 Gm35154-202ENSMUST00000217008 1093 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Tpm3P21107 Zfyve21-204ENSMUST00000221375 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Tpm3P21107 Gm9857-201ENSMUST00000050914 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Tpm3P21107 Cacna2d2-204ENSMUST00000166799 3474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Tpm3P21107 Nphp4-201ENSMUST00000056567 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Tpm3P21107 Ptn-202ENSMUST00000201321 2558 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Tpm3P21107 Celf5-203ENSMUST00000120508 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Tpm3P21107 Eif2d-202ENSMUST00000068805 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Tpm3P21107 Scamp3-203ENSMUST00000120697 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Tpm3P21107 Gm32369-201ENSMUST00000222630 1467 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Tpm3P21107 Ikzf1-204ENSMUST00000076700 5163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Tpm3P21107 Mynn-202ENSMUST00000192715 5555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Tpm3P21107 Irak2-202ENSMUST00000089022 2974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Tpm3P21107 Ggnbp1-203ENSMUST00000133257 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Tpm3P21107 Pik3cd-205ENSMUST00000118704 4894 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Tpm3P21107 Ptgr2-208ENSMUST00000147363 1869 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Tpm3P21107 Ush1c-207ENSMUST00000176371 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Tpm3P21107 Kansl3-205ENSMUST00000186470 2801 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Tpm3P21107 Cklf-208ENSMUST00000212433 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Tpm3P21107 Ap4e1-203ENSMUST00000110394 2271 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Tpm3P21107 Mterf4-202ENSMUST00000112942 1525 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Tpm3P21107 Lzts1-204ENSMUST00000185176 5019 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Tpm3P21107 Mknk1-201ENSMUST00000019677 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Tpm3P21107 Stau2-215ENSMUST00000162435 2735 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Tpm3P21107 Nr1i3-203ENSMUST00000111328 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Tpm3P21107 Tmem81-202ENSMUST00000188789 1751 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Tpm3P21107 Dolpp1-202ENSMUST00000113612 1958 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Tpm3P21107 Eef1d-204ENSMUST00000089681 2152 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Tpm3P21107 P4ha1-202ENSMUST00000092512 2387 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Tpm3P21107 Glud1-201ENSMUST00000022322 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Tpm3P21107 Igf2r-201ENSMUST00000024599 8887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Tpm3P21107 Asb3-206ENSMUST00000203878 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Tpm3P21107 Ccdc121-201ENSMUST00000058825 1819 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Tpm3P21107 Rabepk-203ENSMUST00000118108 1431 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Tpm3P21107 Slc26a4-201ENSMUST00000001253 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Tpm3P21107 Tbc1d16-201ENSMUST00000036113 6986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Tpm3P21107 Cep131-201ENSMUST00000106227 3578 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Tpm3P21107 Cep131-202ENSMUST00000106229 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.6 ms