Protein–RNA interactions for Protein: P20489

Fcer1a, High affinity immunoglobulin epsilon receptor subunit alpha, mousemouse

Predictions only

Length 250 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fcer1aP20489 Kif7-204ENSMUST00000184137 4093 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Fcer1aP20489 Sall2-202ENSMUST00000135523 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Fcer1aP20489 Pramel1-201ENSMUST00000037419 2794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Fcer1aP20489 Prok2-202ENSMUST00000032152 1423 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Fcer1aP20489 Grik4-202ENSMUST00000114865 5887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Fcer1aP20489 Ntf3-201ENSMUST00000050484 1483 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Fcer1aP20489 Gm5763-201ENSMUST00000155951 1530 ntBASIC12.77□□□□□ -0.37
Fcer1aP20489 Ilvbl-201ENSMUST00000105384 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Fcer1aP20489 Gm16685-201ENSMUST00000181286 1592 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Fcer1aP20489 Eloa-201ENSMUST00000030427 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Fcer1aP20489 Klhdc4-210ENSMUST00000174717 1662 ntTSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Fcer1aP20489 Adam22-203ENSMUST00000088744 9245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Fcer1aP20489 Aspm-205ENSMUST00000200083 6072 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Fcer1aP20489 Gps1-208ENSMUST00000208737 1843 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Fcer1aP20489 Acox3-204ENSMUST00000114238 2825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Fcer1aP20489 Mob3c-201ENSMUST00000030477 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Fcer1aP20489 Ext1-201ENSMUST00000077273 7663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Fcer1aP20489 Krt20-201ENSMUST00000017743 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Fcer1aP20489 Rbm47-201ENSMUST00000094756 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Fcer1aP20489 Kctd14-205ENSMUST00000206279 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Fcer1aP20489 Slc37a1-201ENSMUST00000165149 3354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Fcer1aP20489 Gm26559-201ENSMUST00000181939 2481 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Fcer1aP20489 Ccp110-202ENSMUST00000106557 5073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Fcer1aP20489 Sfxn5-203ENSMUST00000113787 638 ntTSL 2 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Fcer1aP20489 Lhx1os-201ENSMUST00000126072 589 ntTSL 3 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Fcer1aP20489 Gm11025-201ENSMUST00000140773 466 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
Fcer1aP20489 2810408I11Rik-202ENSMUST00000150749 711 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Fcer1aP20489 A830052D11Rik-201ENSMUST00000181729 1130 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Fcer1aP20489 9130024F11Rik-204ENSMUST00000187927 517 ntTSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Fcer1aP20489 Ybx1-ps2-201ENSMUST00000201305 957 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
Fcer1aP20489 Rpl19-ps10-201ENSMUST00000205555 330 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
Fcer1aP20489 Gm31545-201ENSMUST00000209358 1219 ntTSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Fcer1aP20489 Gm32351-201ENSMUST00000220503 438 ntTSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Fcer1aP20489 Caly-201ENSMUST00000026541 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Fcer1aP20489 Ndufb7-201ENSMUST00000036996 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Fcer1aP20489 BC031181-201ENSMUST00000040284 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Fcer1aP20489 C1qa-201ENSMUST00000046285 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Fcer1aP20489 Timm10b-201ENSMUST00000058333 694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Fcer1aP20489 Gm10073-201ENSMUST00000073722 496 ntAPPRIS P1 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Fcer1aP20489 Rplp1-201ENSMUST00000008036 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Fcer1aP20489 Cxcr5-201ENSMUST00000062215 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Fcer1aP20489 Gm11611-201ENSMUST00000134289 1326 ntTSL 3 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Fcer1aP20489 Coq6-203ENSMUST00000110278 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Fcer1aP20489 Txnrd3-201ENSMUST00000000828 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Fcer1aP20489 Erfe-201ENSMUST00000086861 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Fcer1aP20489 Pax7-201ENSMUST00000030508 5854 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Fcer1aP20489 Hnrnpa2b1-210ENSMUST00000204188 1518 ntTSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Fcer1aP20489 Slfn2-201ENSMUST00000038038 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Fcer1aP20489 Alg10b-201ENSMUST00000100309 3727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Fcer1aP20489 Olfr683-202ENSMUST00000209879 3841 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Fcer1aP20489 Ciart-202ENSMUST00000159739 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Fcer1aP20489 Lrrc8d-201ENSMUST00000060531 3923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Fcer1aP20489 AW822073-202ENSMUST00000204003 1959 ntAPPRIS P1 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Fcer1aP20489 Kdm6a-201ENSMUST00000044484 5918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Fcer1aP20489 Kdm6a-202ENSMUST00000052368 5935 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Fcer1aP20489 Pprc1-202ENSMUST00000099392 3956 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Fcer1aP20489 Grik2-210ENSMUST00000220263 2085 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Fcer1aP20489 Tspan12-202ENSMUST00000120965 2157 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Fcer1aP20489 Eef1d-204ENSMUST00000089681 2152 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Fcer1aP20489 Sf3a2-203ENSMUST00000148665 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Fcer1aP20489 Tbc1d4-210ENSMUST00000162617 4762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Fcer1aP20489 Arhgef17-201ENSMUST00000107032 10190 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Fcer1aP20489 Hoxa3-201ENSMUST00000114434 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Fcer1aP20489 Mocos-201ENSMUST00000068006 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Fcer1aP20489 Apln-201ENSMUST00000039026 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Fcer1aP20489 Miat-205ENSMUST00000182953 9163 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Fcer1aP20489 Pde4a-202ENSMUST00000039413 4653 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Fcer1aP20489 Prmt7-203ENSMUST00000109297 1094 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Fcer1aP20489 Ash2l-202ENSMUST00000110608 2134 ntTSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Fcer1aP20489 Pex11g-202ENSMUST00000111081 666 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Fcer1aP20489 Pbx3-202ENSMUST00000113132 2734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Fcer1aP20489 Rxra-203ENSMUST00000113934 1989 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Fcer1aP20489 Gm11779-201ENSMUST00000118541 368 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
Fcer1aP20489 Edil3-203ENSMUST00000118731 2721 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Fcer1aP20489 Gm16151-201ENSMUST00000129696 639 ntTSL 3 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Fcer1aP20489 Atcayos-202ENSMUST00000129950 1117 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Fcer1aP20489 Hoxa7-202ENSMUST00000134367 807 ntTSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Fcer1aP20489 Gm17271-201ENSMUST00000165535 355 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
Fcer1aP20489 Scyl3-207ENSMUST00000170359 4288 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Fcer1aP20489 Zbtb25-204ENSMUST00000176278 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Fcer1aP20489 Specc1-209ENSMUST00000201671 2523 ntTSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Fcer1aP20489 Gm18206-201ENSMUST00000207027 926 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
Fcer1aP20489 E130317F20Rik-202ENSMUST00000217802 3420 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
Fcer1aP20489 Hadh-201ENSMUST00000029610 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Fcer1aP20489 Crygn-201ENSMUST00000047119 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Fcer1aP20489 Obp2a-201ENSMUST00000077667 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Fcer1aP20489 Cage1-202ENSMUST00000089840 3449 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Fcer1aP20489 Pam-202ENSMUST00000097625 4102 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Fcer1aP20489 Ahdc1-202ENSMUST00000105914 5898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Fcer1aP20489 Pam-201ENSMUST00000058762 4095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Fcer1aP20489 Ntn4-201ENSMUST00000020204 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Fcer1aP20489 Tfe3-211ENSMUST00000137467 3390 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Fcer1aP20489 Chtop-206ENSMUST00000107344 2972 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Fcer1aP20489 Fam53b-203ENSMUST00000097999 5465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Fcer1aP20489 Hnf1b-203ENSMUST00000108114 2659 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Fcer1aP20489 Gnb4-201ENSMUST00000108234 2510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Fcer1aP20489 Gm5639-201ENSMUST00000122305 2403 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Fcer1aP20489 Gcat-201ENSMUST00000006544 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Fcer1aP20489 Ccdc151-201ENSMUST00000044926 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Fcer1aP20489 Gid4-201ENSMUST00000070681 4283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31 ms