Protein–RNA interactions for Protein: P20293

T, Brachyury protein, mousemouse

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Length 436 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TP20293 Ylpm1-201ENSMUST00000021670 7003 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
TP20293 Pcdh10-204ENSMUST00000193252 4638 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
TP20293 Spryd4-201ENSMUST00000061995 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
TP20293 Cradd-201ENSMUST00000053594 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
TP20293 Grin3a-202ENSMUST00000093859 7491 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
TP20293 Wdr31-203ENSMUST00000120095 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
TP20293 Mapk7-202ENSMUST00000101085 3254 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
TP20293 Gm10110-201ENSMUST00000081204 1891 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
TP20293 Pctp-201ENSMUST00000020864 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.27
TP20293 Gm9947-201ENSMUST00000067599 2920 ntBASIC13.4□□□□□ -0.27
TP20293 Gm6018-201ENSMUST00000216090 1306 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
TP20293 Adad1-203ENSMUST00000144629 3101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
TP20293 Krt42-201ENSMUST00000017270 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
TP20293 Hoxa3-201ENSMUST00000114434 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
TP20293 Gm27177-203ENSMUST00000184034 1911 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
TP20293 Olfr1156-203ENSMUST00000216726 3271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
TP20293 Fam198a-204ENSMUST00000215990 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
TP20293 Prickle3-201ENSMUST00000033485 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
TP20293 Fasn-201ENSMUST00000055655 10050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
TP20293 Hsph1-201ENSMUST00000074846 3240 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
TP20293 St8sia3-201ENSMUST00000025477 6282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
TP20293 Igf2-203ENSMUST00000105935 650 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.39□□□□□ -0.27
TP20293 Oprl1-203ENSMUST00000108766 1241 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
TP20293 Gm11795-201ENSMUST00000127180 396 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
TP20293 Gm11788-201ENSMUST00000142520 562 ntTSL 3 BASIC13.39□□□□□ -0.27
TP20293 2810408I11Rik-202ENSMUST00000150749 711 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
TP20293 Gm37230-201ENSMUST00000194491 818 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
TP20293 Gm44335-201ENSMUST00000196879 141 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
TP20293 Gm44297-201ENSMUST00000198304 141 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
TP20293 Gm44346-201ENSMUST00000198851 141 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
TP20293 Cdipt-205ENSMUST00000206450 951 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
TP20293 Gm34397-203ENSMUST00000214991 630 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
TP20293 Prdx4-201ENSMUST00000026328 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
TP20293 Caly-201ENSMUST00000026541 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
TP20293 Rxfp4-201ENSMUST00000063119 1245 ntAPPRIS P1 BASIC13.39□□□□□ -0.27
TP20293 Ilkap-201ENSMUST00000027534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
TP20293 Lpar5-203ENSMUST00000171989 1458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
TP20293 Tmem59l-201ENSMUST00000045286 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
TP20293 Ralgapb-203ENSMUST00000109486 8383 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
TP20293 Pde7b-205ENSMUST00000169404 1697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
TP20293 4930556H04Rik-201ENSMUST00000222451 1675 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
TP20293 Catip-204ENSMUST00000191010 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
TP20293 Sphk1-205ENSMUST00000106387 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
TP20293 Zfp784-201ENSMUST00000062428 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
TP20293 Ttyh2-201ENSMUST00000045779 3486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
TP20293 Klhl12-201ENSMUST00000027725 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
TP20293 Cbln4-201ENSMUST00000087950 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
TP20293 Gm42632-201ENSMUST00000201707 2411 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
TP20293 Tex13b-201ENSMUST00000044179 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
TP20293 Spns1-202ENSMUST00000119754 2001 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
TP20293 Arhgap40-203ENSMUST00000165398 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
TP20293 Zfp57-211ENSMUST00000174524 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
TP20293 3830417A13Rik-201ENSMUST00000033522 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
TP20293 Gm17619-201ENSMUST00000180625 1449 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
TP20293 Ager-209ENSMUST00000174496 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
TP20293 Rassf10-201ENSMUST00000182858 3496 ntAPPRIS P1 BASIC13.38□□□□□ -0.27
TP20293 Ankrd34b-203ENSMUST00000168871 3397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
TP20293 Camta2-203ENSMUST00000108544 4632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
TP20293 Eif1ad-201ENSMUST00000025759 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
TP20293 P4ha2-202ENSMUST00000093107 2263 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
TP20293 Pard3-222ENSMUST00000162536 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
TP20293 Cdt1-201ENSMUST00000006760 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
TP20293 9330182L06Rik-202ENSMUST00000115348 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
TP20293 Slc38a1-201ENSMUST00000088452 7266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
TP20293 Prdm10-202ENSMUST00000117389 1952 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
TP20293 BC006965-201ENSMUST00000124028 1952 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
TP20293 Nkd2-202ENSMUST00000118096 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
TP20293 Nop9-201ENSMUST00000019441 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
TP20293 Frmpd4-204ENSMUST00000112149 8456 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
TP20293 Tex22-202ENSMUST00000109729 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
TP20293 Tmsb4x-201ENSMUST00000112172 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
TP20293 Gm13496-201ENSMUST00000141133 1165 ntTSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
TP20293 Gm26308-201ENSMUST00000157768 69 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
TP20293 Gm17455-201ENSMUST00000164428 855 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.38□□□□□ -0.27
TP20293 Hoga1-204ENSMUST00000172244 631 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
TP20293 Gm43125-201ENSMUST00000201724 730 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
TP20293 Ap4b1-201ENSMUST00000047285 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
TP20293 Abr-205ENSMUST00000108408 3534 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
TP20293 Sept12-201ENSMUST00000170323 2576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
TP20293 Pltp-201ENSMUST00000059954 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
TP20293 Hlcs-202ENSMUST00000163193 5371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
TP20293 Phldb1-212ENSMUST00000138356 5600 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
TP20293 Mapt-203ENSMUST00000106989 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
TP20293 Lap3-201ENSMUST00000046122 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
TP20293 BC026585-201ENSMUST00000046743 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
TP20293 Dnaaf1-201ENSMUST00000093100 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
TP20293 Gm26882-201ENSMUST00000181611 1537 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
TP20293 Gm27198-201ENSMUST00000184172 1517 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
TP20293 Car10-203ENSMUST00000107858 2742 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
TP20293 Ace-202ENSMUST00000001964 2418 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
TP20293 Dapk1-201ENSMUST00000044083 5304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
TP20293 Dpp7-201ENSMUST00000028332 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
TP20293 Fam3a-205ENSMUST00000114142 1586 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
TP20293 Olfr718-ps1-202ENSMUST00000213631 4737 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
TP20293 Ccp110-202ENSMUST00000106557 5073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
TP20293 Ints14-201ENSMUST00000037504 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
TP20293 CT025626.1-201ENSMUST00000223735 1455 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
TP20293 Rbl2-208ENSMUST00000209518 4792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
TP20293 Rxrb-202ENSMUST00000116612 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
TP20293 Gm34016-201ENSMUST00000222678 1384 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
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