Protein–RNA interactions for Protein: P19123

Tnnc1, Troponin C, slow skeletal and cardiac muscles, mousemouse

Predictions only

Length 161 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnnc1P19123 Gata1-201ENSMUST00000033502 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Tnnc1P19123 Dnm1-205ENSMUST00000113365 3257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Tnnc1P19123 Itpk1-201ENSMUST00000046518 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Tnnc1P19123 Maged2-201ENSMUST00000026302 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Tnnc1P19123 Galnt17-201ENSMUST00000086023 8040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Tnnc1P19123 Zbtb20-203ENSMUST00000114691 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Tnnc1P19123 Trim27-201ENSMUST00000021761 4204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Tnnc1P19123 Nat8f3-201ENSMUST00000050780 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Tnnc1P19123 Grm7-201ENSMUST00000071076 3127 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Tnnc1P19123 Rtkn-202ENSMUST00000087938 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Tnnc1P19123 D430041D05Rik-201ENSMUST00000089726 10124 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Tnnc1P19123 Gtf2h1-201ENSMUST00000006774 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Tnnc1P19123 Pdia2-201ENSMUST00000039113 1721 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tnnc1P19123 Lsm12-202ENSMUST00000107156 2015 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tnnc1P19123 Tcf25-208ENSMUST00000212571 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tnnc1P19123 Col9a2-201ENSMUST00000030372 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tnnc1P19123 9930104L06Rik-201ENSMUST00000094769 2911 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tnnc1P19123 Sirt5-211ENSMUST00000223194 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tnnc1P19123 Tbrg4-201ENSMUST00000000394 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tnnc1P19123 Uba3-201ENSMUST00000089287 2257 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tnnc1P19123 Sptb-201ENSMUST00000021458 10394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tnnc1P19123 Tnks1bp1-202ENSMUST00000111605 5747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tnnc1P19123 Gm28182-201ENSMUST00000188354 2477 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Tnnc1P19123 Rabggta-202ENSMUST00000163889 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tnnc1P19123 AC140354.1-201ENSMUST00000219499 2425 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tnnc1P19123 Tnfrsf13b-202ENSMUST00000101103 750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tnnc1P19123 Mir449b-201ENSMUST00000104833 80 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Tnnc1P19123 AC155937.1-202ENSMUST00000156229 621 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tnnc1P19123 Nfya-203ENSMUST00000159063 1255 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tnnc1P19123 U2af1l4-216ENSMUST00000166510 835 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tnnc1P19123 1190007I07Rik-204ENSMUST00000183416 637 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tnnc1P19123 9230114J08Rik-201ENSMUST00000200375 350 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tnnc1P19123 Gm18049-201ENSMUST00000208909 581 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Tnnc1P19123 Tpi-rs5-201ENSMUST00000216947 774 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Tnnc1P19123 Gm32351-201ENSMUST00000220503 438 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tnnc1P19123 Dad1-201ENSMUST00000022781 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tnnc1P19123 Gzma-201ENSMUST00000023897 878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tnnc1P19123 Snrnp25-201ENSMUST00000039601 821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tnnc1P19123 Gm5771-201ENSMUST00000049079 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tnnc1P19123 1600017P15Rik-201ENSMUST00000083427 412 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Tnnc1P19123 Lrif1-202ENSMUST00000098751 929 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tnnc1P19123 Plxdc2-203ENSMUST00000114703 2061 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tnnc1P19123 Uhrf1bp1l-201ENSMUST00000020112 6448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tnnc1P19123 Spon2-201ENSMUST00000046186 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tnnc1P19123 Ptcd2-201ENSMUST00000022153 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tnnc1P19123 Rab3a-204ENSMUST00000110093 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tnnc1P19123 Ptprn2-201ENSMUST00000070733 3201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tnnc1P19123 Fbxo21-206ENSMUST00000202447 3959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tnnc1P19123 Zfp784-201ENSMUST00000062428 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tnnc1P19123 Gak-201ENSMUST00000046603 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tnnc1P19123 4932422M17Rik-201ENSMUST00000195992 2639 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Tnnc1P19123 Map3k9-202ENSMUST00000222322 3303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tnnc1P19123 Tle3-210ENSMUST00000161207 2592 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tnnc1P19123 Ap4b1-201ENSMUST00000047285 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tnnc1P19123 Psmc5-201ENSMUST00000021049 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tnnc1P19123 3110082I17Rik-204ENSMUST00000198474 2030 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tnnc1P19123 Vav1-201ENSMUST00000005889 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tnnc1P19123 Rreb1-202ENSMUST00000110237 4617 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tnnc1P19123 9330182L06Rik-202ENSMUST00000115348 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tnnc1P19123 Zfp57-202ENSMUST00000089968 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tnnc1P19123 Hpca-207ENSMUST00000139450 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tnnc1P19123 Gm8116-201ENSMUST00000182917 1201 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Tnnc1P19123 Gm37230-201ENSMUST00000194491 818 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Tnnc1P19123 1700025J12Rik-201ENSMUST00000205586 630 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tnnc1P19123 AC158529.1-201ENSMUST00000223618 239 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Tnnc1P19123 Rgs10-201ENSMUST00000033133 880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tnnc1P19123 Marveld3-202ENSMUST00000051430 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tnnc1P19123 Zfp568-203ENSMUST00000148442 4005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tnnc1P19123 Srsf10-202ENSMUST00000097844 3055 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tnnc1P19123 Fasn-201ENSMUST00000055655 10050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tnnc1P19123 Dbndd1-201ENSMUST00000176155 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tnnc1P19123 Slc39a3-202ENSMUST00000117276 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tnnc1P19123 Ss18-201ENSMUST00000040924 3090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tnnc1P19123 Farp2-202ENSMUST00000122402 2816 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tnnc1P19123 Nrap-201ENSMUST00000040711 5334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tnnc1P19123 Phyhd1-204ENSMUST00000113645 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tnnc1P19123 Chchd5-201ENSMUST00000035481 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tnnc1P19123 Otop2-201ENSMUST00000055490 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tnnc1P19123 Mtif2-202ENSMUST00000093239 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tnnc1P19123 Spcs2-201ENSMUST00000036274 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tnnc1P19123 Ltbp4-203ENSMUST00000118583 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tnnc1P19123 Nfatc1-202ENSMUST00000078049 4607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tnnc1P19123 Zpbp2-201ENSMUST00000017339 1455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tnnc1P19123 Gm13883-202ENSMUST00000151310 1156 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tnnc1P19123 Gm37171-201ENSMUST00000192636 1185 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Tnnc1P19123 2610318N02Rik-201ENSMUST00000093336 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tnnc1P19123 Rnf144a-201ENSMUST00000020971 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tnnc1P19123 Scp2-201ENSMUST00000030340 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tnnc1P19123 Ankrd6-202ENSMUST00000084748 4354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tnnc1P19123 Tpm1-202ENSMUST00000034928 1824 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tnnc1P19123 Gm26840-201ENSMUST00000180784 2980 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tnnc1P19123 Prkg1-206ENSMUST00000182685 1628 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tnnc1P19123 3830417A13Rik-201ENSMUST00000033522 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tnnc1P19123 Arhgap26-201ENSMUST00000097593 7898 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tnnc1P19123 Kcnc2-201ENSMUST00000092175 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tnnc1P19123 Kpna6-201ENSMUST00000003828 2195 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tnnc1P19123 Olfml2a-201ENSMUST00000057279 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tnnc1P19123 Rnf135-201ENSMUST00000017839 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tnnc1P19123 Fundc1-201ENSMUST00000026016 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tnnc1P19123 Npnt-204ENSMUST00000117164 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.6 ms