Protein–RNA interactions for Protein: P14576

Srp54, Signal recognition particle 54 kDa protein, mousemouse

Predictions only

Length 504 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Srp54P14576 Vapb-201ENSMUST00000067530 7029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Srp54P14576 Ranbp3-201ENSMUST00000002445 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Srp54P14576 Ccdc69-202ENSMUST00000108880 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Srp54P14576 Apoo-203ENSMUST00000113897 1218 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Srp54P14576 Atcayos-202ENSMUST00000129950 1117 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Srp54P14576 4930527A07Rik-201ENSMUST00000130677 559 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Srp54P14576 1700029H14Rik-204ENSMUST00000151400 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Srp54P14576 Wdr45-225ENSMUST00000208443 1172 ntTSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Srp54P14576 Uts2-201ENSMUST00000030803 538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Srp54P14576 2900055J20Rik-201ENSMUST00000096572 723 ntAPPRIS P1 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Srp54P14576 Klf4-201ENSMUST00000107619 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Srp54P14576 Nhlh2-202ENSMUST00000196324 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Srp54P14576 Tor1aip1-201ENSMUST00000027738 1952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Srp54P14576 Cadps2-213ENSMUST00000166458 4598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.18
Srp54P14576 Irak1-206ENSMUST00000114354 3835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Srp54P14576 Kcnip1-202ENSMUST00000101368 2322 ntTSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.18
Srp54P14576 Gm10010-201ENSMUST00000071101 2346 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Srp54P14576 Mrps35-201ENSMUST00000036111 4162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Srp54P14576 6030408B16Rik-202ENSMUST00000191426 1947 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Srp54P14576 Gm13034-201ENSMUST00000121342 3177 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
Srp54P14576 Loxl4-203ENSMUST00000164786 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Srp54P14576 4930429P21Rik-202ENSMUST00000194547 2061 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Srp54P14576 Ppp2r1a-201ENSMUST00000007708 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Srp54P14576 Ints3-202ENSMUST00000071488 4038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Srp54P14576 Sumo3-202ENSMUST00000099538 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Srp54P14576 Pde10a-202ENSMUST00000089085 7717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Srp54P14576 Tbx3-201ENSMUST00000018748 4856 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Srp54P14576 Gm6263-201ENSMUST00000120029 1342 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
Srp54P14576 Otop3-202ENSMUST00000106543 2369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Srp54P14576 Serp1-201ENSMUST00000029385 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Srp54P14576 Spag1-202ENSMUST00000171205 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Srp54P14576 B3gnt8-201ENSMUST00000076034 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Srp54P14576 Taf1a-201ENSMUST00000097043 1472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Srp54P14576 Txndc11-203ENSMUST00000118679 3523 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Srp54P14576 Prrxl1-203ENSMUST00000187377 1629 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Srp54P14576 Gamt-202ENSMUST00000105363 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Srp54P14576 Mafg-203ENSMUST00000106181 840 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Srp54P14576 Crip3-202ENSMUST00000113465 1035 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Srp54P14576 Gm14042-201ENSMUST00000120139 833 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
Srp54P14576 Rpl34-203ENSMUST00000133802 711 ntTSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Srp54P14576 Sf3a2-204ENSMUST00000151928 781 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Srp54P14576 Gm17344-202ENSMUST00000173980 621 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Srp54P14576 Gltpd2-202ENSMUST00000179000 794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Srp54P14576 Ascl5-201ENSMUST00000180436 567 ntAPPRIS P1 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Srp54P14576 AC135669.1-201ENSMUST00000213585 412 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
Srp54P14576 Gm20445-201ENSMUST00000061905 565 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
Srp54P14576 Hist1h2aa-201ENSMUST00000072391 390 ntAPPRIS P1 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Srp54P14576 Cox6b1-201ENSMUST00000075738 618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Srp54P14576 Tdrd12-205ENSMUST00000205407 1412 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Srp54P14576 Igf2os-203ENSMUST00000141681 4778 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Srp54P14576 Phka1-201ENSMUST00000043596 5938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Srp54P14576 Rspry1-202ENSMUST00000121101 3092 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Srp54P14576 Fkbp10-201ENSMUST00000001595 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Srp54P14576 Thnsl2-202ENSMUST00000160918 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Srp54P14576 Ren1-201ENSMUST00000094556 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Srp54P14576 Rassf5-203ENSMUST00000112442 3388 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Srp54P14576 Cacna1g-203ENSMUST00000103166 8104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Srp54P14576 Loxl2-201ENSMUST00000022660 5316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Srp54P14576 Chaf1b-202ENSMUST00000117099 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Srp54P14576 Trappc12-203ENSMUST00000170994 2818 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Srp54P14576 Gm5763-201ENSMUST00000155951 1530 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
Srp54P14576 Gm11946-201ENSMUST00000123459 3941 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Srp54P14576 Slc43a1-203ENSMUST00000111625 2487 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Srp54P14576 Cct4-204ENSMUST00000173867 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Srp54P14576 Elovl1-201ENSMUST00000006557 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Srp54P14576 Cdkl3-201ENSMUST00000063303 2765 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Srp54P14576 Unc93b1-204ENSMUST00000165711 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Srp54P14576 St8sia3-201ENSMUST00000025477 6282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Srp54P14576 Ski-202ENSMUST00000084103 5309 ntTSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Srp54P14576 Hnf4a-202ENSMUST00000109411 4362 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Srp54P14576 Grb2-203ENSMUST00000106497 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Srp54P14576 Gm16425-201ENSMUST00000118143 3130 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
Srp54P14576 Hlcs-205ENSMUST00000227141 4021 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Srp54P14576 Dusp14-203ENSMUST00000108101 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Srp54P14576 Crybb3-205ENSMUST00000120506 804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Srp54P14576 Gm12212-201ENSMUST00000141032 378 ntTSL 3 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Srp54P14576 Cpsf4l-205ENSMUST00000173655 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Srp54P14576 Gm6916-202ENSMUST00000205523 195 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
Srp54P14576 Aurkc-204ENSMUST00000208049 1401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Srp54P14576 Luc7l3-201ENSMUST00000021226 3373 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Srp54P14576 Gm7390-201ENSMUST00000212452 1216 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
Srp54P14576 Tex12-202ENSMUST00000217236 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Srp54P14576 Top3b-201ENSMUST00000023465 3073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Srp54P14576 Cd302-201ENSMUST00000028356 1257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Srp54P14576 Gabra4-201ENSMUST00000031121 4108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Srp54P14576 Ufsp1-201ENSMUST00000052825 1037 ntAPPRIS P1 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Srp54P14576 Setd1b-206ENSMUST00000174836 7515 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Srp54P14576 Grik5-201ENSMUST00000003468 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Srp54P14576 Gpr88-201ENSMUST00000090473 3469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Srp54P14576 Rnf114-202ENSMUST00000109214 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Srp54P14576 Vps26a-202ENSMUST00000105447 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Srp54P14576 Ushbp1-201ENSMUST00000049184 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Srp54P14576 Aldh1b1-201ENSMUST00000044384 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Srp54P14576 Clcn2-201ENSMUST00000007207 3128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Srp54P14576 Cant1-202ENSMUST00000092378 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Srp54P14576 Ube2d3-210ENSMUST00000197539 2515 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Srp54P14576 Arhgef25-201ENSMUST00000019611 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Srp54P14576 Secisbp2l-201ENSMUST00000053699 6797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Srp54P14576 Cntfr-204ENSMUST00000102962 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Srp54P14576 Ftcd-201ENSMUST00000001183 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 102.5 ms