Protein–RNA interactions for Protein: P13372

Vpreb1, Immunoglobulin iota chain, mousemouse

Predictions only

Length 142 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vpreb1P13372 Wnt3a-201ENSMUST00000010044 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
Vpreb1P13372 Ubxn10-201ENSMUST00000105809 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
Vpreb1P13372 Bcl7b-203ENSMUST00000111188 1434 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.19□□□□□ -0.94
Vpreb1P13372 Pqlc2-205ENSMUST00000172747 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.19□□□□□ -0.94
Vpreb1P13372 Klhl8-203ENSMUST00000112815 2898 ntTSL 5 BASIC9.19□□□□□ -0.94
Vpreb1P13372 Rnf14-202ENSMUST00000170811 2886 ntTSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
Vpreb1P13372 Tmem164-202ENSMUST00000101198 4443 ntTSL 3 BASIC9.19□□□□□ -0.94
Vpreb1P13372 Lgi3-201ENSMUST00000047331 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
Vpreb1P13372 Aqp3-201ENSMUST00000055327 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
Vpreb1P13372 Rbmx-203ENSMUST00000114730 2019 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.19□□□□□ -0.94
Vpreb1P13372 Nptn-201ENSMUST00000085651 2024 ntTSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
Vpreb1P13372 Map2k6-202ENSMUST00000100260 2088 ntTSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
Vpreb1P13372 Map2k6-201ENSMUST00000020949 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
Vpreb1P13372 Mbp-204ENSMUST00000080658 2063 ntTSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
Vpreb1P13372 Rtl6-201ENSMUST00000069476 4426 ntAPPRIS P1 BASIC9.19□□□□□ -0.94
Vpreb1P13372 Klhl18-201ENSMUST00000068025 4530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
Vpreb1P13372 Anks1b-213ENSMUST00000182284 2607 ntTSL 5 BASIC9.18□□□□□ -0.94
Vpreb1P13372 Pak4-201ENSMUST00000032823 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.18□□□□□ -0.94
Vpreb1P13372 Mob3c-201ENSMUST00000030477 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.18□□□□□ -0.94
Vpreb1P13372 Itpk1-201ENSMUST00000046518 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.18□□□□□ -0.94
Vpreb1P13372 Skida1-201ENSMUST00000066885 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.18□□□□□ -0.94
Vpreb1P13372 Chst3-201ENSMUST00000068690 5985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.18□□□□□ -0.94
Vpreb1P13372 Trim32-201ENSMUST00000050850 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.18□□□□□ -0.94
Vpreb1P13372 Vwc2-202ENSMUST00000109681 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.18□□□□□ -0.94
Vpreb1P13372 Pelp1-201ENSMUST00000019065 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.18□□□□□ -0.94
Vpreb1P13372 Gsg1l-201ENSMUST00000073935 3923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.18□□□□□ -0.94
Vpreb1P13372 Malt1-202ENSMUST00000224056 4028 ntAPPRIS ALT2 BASIC9.18□□□□□ -0.94
Vpreb1P13372 Cic-212ENSMUST00000169266 8221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.18□□□□□ -0.94
Vpreb1P13372 Dennd4b-201ENSMUST00000098914 5423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.18□□□□□ -0.94
Vpreb1P13372 Nat9-203ENSMUST00000103040 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.18□□□□□ -0.94
Vpreb1P13372 Nat9-204ENSMUST00000103041 953 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.18□□□□□ -0.94
Vpreb1P13372 Adal-203ENSMUST00000110662 1231 ntTSL 5 BASIC9.18□□□□□ -0.94
Vpreb1P13372 Grk4-201ENSMUST00000001112 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.18□□□□□ -0.94
Vpreb1P13372 Sugp1-201ENSMUST00000011450 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.18□□□□□ -0.94
Vpreb1P13372 Gm7153-201ENSMUST00000117092 455 ntBASIC9.18□□□□□ -0.94
Vpreb1P13372 Kcnd3-203ENSMUST00000118360 2668 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC9.18□□□□□ -0.94
Vpreb1P13372 Smim12-201ENSMUST00000142029 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.18□□□□□ -0.94
Vpreb1P13372 Nsd3-207ENSMUST00000143445 2416 ntTSL 1 (best) BASIC9.18□□□□□ -0.94
Vpreb1P13372 Nedd9-202ENSMUST00000163623 4626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.18□□□□□ -0.94
Vpreb1P13372 Rad51b-202ENSMUST00000171210 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.18□□□□□ -0.94
Vpreb1P13372 Rab10os-202ENSMUST00000177896 2872 ntTSL 1 (best) BASIC9.18□□□□□ -0.94
Vpreb1P13372 4921514A10Rik-201ENSMUST00000181450 2114 ntTSL 5 BASIC9.18□□□□□ -0.94
Vpreb1P13372 Hnrnpa2b1-204ENSMUST00000203220 1638 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.18□□□□□ -0.94
Vpreb1P13372 Gm44981-201ENSMUST00000205549 1943 ntBASIC9.18□□□□□ -0.94
Vpreb1P13372 Serpinh1-205ENSMUST00000208119 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.18□□□□□ -0.94
Vpreb1P13372 Grk6-203ENSMUST00000224118 1997 ntAPPRIS ALT2 BASIC9.18□□□□□ -0.94
Vpreb1P13372 Adprh-201ENSMUST00000002923 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.18□□□□□ -0.94
Vpreb1P13372 Pnmt-201ENSMUST00000041301 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.18□□□□□ -0.94
Vpreb1P13372 Elmod1-201ENSMUST00000048409 2605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.18□□□□□ -0.94
Vpreb1P13372 Socs3-201ENSMUST00000054002 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.18□□□□□ -0.94
Vpreb1P13372 Aqp12-201ENSMUST00000059676 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.18□□□□□ -0.94
Vpreb1P13372 Wbp2-201ENSMUST00000074628 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.18□□□□□ -0.94
Vpreb1P13372 2410002F23Rik-203ENSMUST00000084937 2092 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC9.18□□□□□ -0.94
Vpreb1P13372 Grk6-202ENSMUST00000099482 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.18□□□□□ -0.94
Vpreb1P13372 Cramp1l-201ENSMUST00000073337 7517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.18□□□□□ -0.94
Vpreb1P13372 Prrc2a-201ENSMUST00000025253 6888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.18□□□□□ -0.94
Vpreb1P13372 Runx1t1-204ENSMUST00000105566 6090 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.18□□□□□ -0.94
Vpreb1P13372 Srebf2-201ENSMUST00000023100 4989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.18□□□□□ -0.94
Vpreb1P13372 Wasl-201ENSMUST00000031695 4352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.18□□□□□ -0.94
Vpreb1P13372 Emp2-201ENSMUST00000078357 3440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.18□□□□□ -0.94
Vpreb1P13372 Psd-210ENSMUST00000225323 3398 ntAPPRIS ALT2 BASIC9.18□□□□□ -0.94
Vpreb1P13372 Lnx1-201ENSMUST00000039744 2727 ntTSL 1 (best) BASIC9.18□□□□□ -0.94
Vpreb1P13372 Cacna1c-225ENSMUST00000219223 7483 ntTSL 5 BASIC9.17□□□□□ -0.94
Vpreb1P13372 Celf4-203ENSMUST00000223704 2492 ntAPPRIS ALT1 BASIC9.17□□□□□ -0.94
Vpreb1P13372 Ppp1r3g-201ENSMUST00000132661 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.17□□□□□ -0.94
Vpreb1P13372 Tesmin-203ENSMUST00000142193 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.17□□□□□ -0.94
Vpreb1P13372 Gsdmcl2-203ENSMUST00000185431 1911 ntBASIC9.17□□□□□ -0.94
Vpreb1P13372 Ccer1-201ENSMUST00000060703 1865 ntAPPRIS P1 BASIC9.17□□□□□ -0.94
Vpreb1P13372 Ccdc103-201ENSMUST00000021307 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.17□□□□□ -0.94
Vpreb1P13372 9330182L06Rik-202ENSMUST00000115348 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.17□□□□□ -0.94
Vpreb1P13372 CT010456.1-201ENSMUST00000222465 1688 ntTSL 5 BASIC9.17□□□□□ -0.94
Vpreb1P13372 Ntng1-205ENSMUST00000106575 1620 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.17□□□□□ -0.94
Vpreb1P13372 Ntng1-202ENSMUST00000072596 1620 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.17□□□□□ -0.94
Vpreb1P13372 Zfp341-202ENSMUST00000109702 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.17□□□□□ -0.94
Vpreb1P13372 Eldr-203ENSMUST00000130392 1540 ntTSL 2 BASIC9.17□□□□□ -0.94
Vpreb1P13372 Jade2-203ENSMUST00000109091 6099 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.17□□□□□ -0.94
Vpreb1P13372 Prpf3-201ENSMUST00000015892 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.17□□□□□ -0.94
Vpreb1P13372 Prrc2b-201ENSMUST00000036691 8612 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.17□□□□□ -0.94
Vpreb1P13372 Zfp385c-201ENSMUST00000103119 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.17□□□□□ -0.94
Vpreb1P13372 Kcnk10-203ENSMUST00000221305 1357 ntTSL 1 (best) BASIC9.17□□□□□ -0.94
Vpreb1P13372 Med25-211ENSMUST00000208551 2678 ntTSL 2 BASIC9.17□□□□□ -0.94
Vpreb1P13372 Plcxd1-201ENSMUST00000086687 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.17□□□□□ -0.94
Vpreb1P13372 Smpd3-202ENSMUST00000212896 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.17□□□□□ -0.94
Vpreb1P13372 Olfr482-202ENSMUST00000217304 2612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.17□□□□□ -0.94
Vpreb1P13372 Cobl-208ENSMUST00000172919 2566 ntTSL 1 (best) BASIC9.17□□□□□ -0.94
Vpreb1P13372 Olfr55-201ENSMUST00000112168 948 ntAPPRIS P1 BASIC9.17□□□□□ -0.94
Vpreb1P13372 Gm12216-201ENSMUST00000117316 1152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.17□□□□□ -0.94
Vpreb1P13372 Snx15-207ENSMUST00000154601 767 ntTSL 5 BASIC9.17□□□□□ -0.94
Vpreb1P13372 Gm28033-201ENSMUST00000184224 96 ntBASIC9.17□□□□□ -0.94
Vpreb1P13372 Ten1-201ENSMUST00000021130 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.17□□□□□ -0.94
Vpreb1P13372 AC153889.1-201ENSMUST00000219257 330 ntBASIC9.17□□□□□ -0.94
Vpreb1P13372 Tomm22-201ENSMUST00000023062 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.17□□□□□ -0.94
Vpreb1P13372 Ank1-201ENSMUST00000033947 1030 ntTSL 1 (best) BASIC9.17□□□□□ -0.94
Vpreb1P13372 Ccdc182-201ENSMUST00000037268 1204 ntAPPRIS P1 BASIC9.17□□□□□ -0.94
Vpreb1P13372 Hacd1-201ENSMUST00000074854 926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.17□□□□□ -0.94
Vpreb1P13372 Prr18-201ENSMUST00000069742 3407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.17□□□□□ -0.94
Vpreb1P13372 Tpm3-201ENSMUST00000029549 2230 ntTSL 1 (best) BASIC9.17□□□□□ -0.94
Vpreb1P13372 Dnm1-203ENSMUST00000113350 3258 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.17□□□□□ -0.94
Vpreb1P13372 Cfap69-205ENSMUST00000135252 2188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.17□□□□□ -0.94
Vpreb1P13372 Trmt1-205ENSMUST00000125370 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.17□□□□□ -0.94
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.6 ms