Protein–RNA interactions for Protein: P0C0A3

Chmp6, Charged multivesicular body protein 6, mousemouse

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Length 200 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chmp6P0C0A3 Ubc-202ENSMUST00000136312 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Chmp6P0C0A3 Cep164-204ENSMUST00000213154 6105 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Chmp6P0C0A3 Scp2-201ENSMUST00000030340 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Chmp6P0C0A3 Fbrs-202ENSMUST00000205432 4166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Chmp6P0C0A3 Dnmt3b-204ENSMUST00000088976 4130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Chmp6P0C0A3 0610009E02Rik-201ENSMUST00000133463 1609 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Chmp6P0C0A3 Prkg1-206ENSMUST00000182685 1628 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Chmp6P0C0A3 Hic2-201ENSMUST00000090190 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Chmp6P0C0A3 Repin1-201ENSMUST00000009420 3145 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Chmp6P0C0A3 Gm33195-201ENSMUST00000220827 2337 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Chmp6P0C0A3 Plod2-201ENSMUST00000070522 3649 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Chmp6P0C0A3 Adamts7-202ENSMUST00000113060 5098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Chmp6P0C0A3 4930429P21Rik-202ENSMUST00000194547 2061 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Chmp6P0C0A3 Dimt1-201ENSMUST00000022203 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Chmp6P0C0A3 Ush1c-207ENSMUST00000176371 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Chmp6P0C0A3 Prox1-201ENSMUST00000010319 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Chmp6P0C0A3 Adck5-214ENSMUST00000162503 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Chmp6P0C0A3 Ildr2-201ENSMUST00000111416 8251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Chmp6P0C0A3 Ppp1r1b-206ENSMUST00000150762 1801 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Chmp6P0C0A3 Ap4b1-207ENSMUST00000200377 1823 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Chmp6P0C0A3 Cldn14-204ENSMUST00000169391 1456 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Chmp6P0C0A3 Kcnip1-202ENSMUST00000101368 2322 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Chmp6P0C0A3 Palld-203ENSMUST00000121493 5445 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Chmp6P0C0A3 Spcs2-210ENSMUST00000209032 1610 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Chmp6P0C0A3 Nrd1-202ENSMUST00000102736 4179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Chmp6P0C0A3 Gm13616-201ENSMUST00000120600 222 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Chmp6P0C0A3 Gm20444-201ENSMUST00000174014 648 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Chmp6P0C0A3 Gm37171-201ENSMUST00000192636 1185 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Chmp6P0C0A3 Gm42560-201ENSMUST00000201216 1023 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Chmp6P0C0A3 Tmem38a-203ENSMUST00000212763 882 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Chmp6P0C0A3 Stard3nl-209ENSMUST00000221380 1268 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Chmp6P0C0A3 1600017P15Rik-201ENSMUST00000083427 412 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Chmp6P0C0A3 G430095P16Rik-201ENSMUST00000098571 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Chmp6P0C0A3 Lrif1-202ENSMUST00000098751 929 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Chmp6P0C0A3 Pnn-201ENSMUST00000021381 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Chmp6P0C0A3 Mapt-203ENSMUST00000106989 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Chmp6P0C0A3 Arpin-201ENSMUST00000048731 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Chmp6P0C0A3 Rtn4-205ENSMUST00000102843 4618 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Chmp6P0C0A3 Rab3a-204ENSMUST00000110093 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Chmp6P0C0A3 Tgif2-202ENSMUST00000081335 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Chmp6P0C0A3 Ulk1-211ENSMUST00000200299 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Chmp6P0C0A3 Prkcsh-205ENSMUST00000216344 2228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Chmp6P0C0A3 Atp2a2-202ENSMUST00000177974 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Chmp6P0C0A3 Taf3-201ENSMUST00000026888 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Chmp6P0C0A3 Zscan22-204ENSMUST00000120809 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Chmp6P0C0A3 Tmem204-201ENSMUST00000024984 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Chmp6P0C0A3 Csnk1g2-202ENSMUST00000085435 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Chmp6P0C0A3 Aldh1b1-201ENSMUST00000044384 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Chmp6P0C0A3 Psmc5-201ENSMUST00000021049 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Chmp6P0C0A3 Map2k7-211ENSMUST00000145165 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Chmp6P0C0A3 Fars2-208ENSMUST00000224611 1750 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Chmp6P0C0A3 Ftcd-201ENSMUST00000001183 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Chmp6P0C0A3 Hdac8-201ENSMUST00000087916 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Chmp6P0C0A3 Sh2b2-201ENSMUST00000005188 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Chmp6P0C0A3 Sema3b-201ENSMUST00000073448 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Chmp6P0C0A3 Ltbp4-201ENSMUST00000038618 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Chmp6P0C0A3 Grid2ip-202ENSMUST00000110733 3825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Chmp6P0C0A3 Wdr38-202ENSMUST00000112872 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Chmp6P0C0A3 Atf7ip2-203ENSMUST00000117220 1230 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Chmp6P0C0A3 Abhd11os-201ENSMUST00000136022 604 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Chmp6P0C0A3 Gm11615-201ENSMUST00000156205 818 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Chmp6P0C0A3 Nfya-203ENSMUST00000159063 1255 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Chmp6P0C0A3 Gm37230-201ENSMUST00000194491 818 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Chmp6P0C0A3 Fbxo21-206ENSMUST00000202447 3959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Chmp6P0C0A3 Olfr683-202ENSMUST00000209879 3841 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Chmp6P0C0A3 5430427M07Rik-202ENSMUST00000221524 1023 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Chmp6P0C0A3 Npb-201ENSMUST00000061309 418 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Chmp6P0C0A3 Cbs-201ENSMUST00000067801 2497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Chmp6P0C0A3 Retreg3-201ENSMUST00000017946 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Chmp6P0C0A3 Naa15-205ENSMUST00000193266 7480 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Chmp6P0C0A3 9330182L06Rik-201ENSMUST00000069538 4688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Chmp6P0C0A3 Bcl11b-201ENSMUST00000066060 8111 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Chmp6P0C0A3 Ap1s2-202ENSMUST00000069041 2226 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Chmp6P0C0A3 Arid5a-208ENSMUST00000137906 5504 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Chmp6P0C0A3 Selenon-201ENSMUST00000060435 3445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Chmp6P0C0A3 Rnf180-203ENSMUST00000224662 2734 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Chmp6P0C0A3 Spon2-201ENSMUST00000046186 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Chmp6P0C0A3 Pprc1-202ENSMUST00000099392 3956 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Chmp6P0C0A3 Snx14-204ENSMUST00000165315 3109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Chmp6P0C0A3 Tpr-203ENSMUST00000124973 7430 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Chmp6P0C0A3 Pth2r-201ENSMUST00000027083 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Chmp6P0C0A3 Sh2b1-205ENSMUST00000205733 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Chmp6P0C0A3 Gm38391-201ENSMUST00000191720 4069 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Chmp6P0C0A3 Pdia2-201ENSMUST00000039113 1721 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Chmp6P0C0A3 Rspry1-207ENSMUST00000212729 2800 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Chmp6P0C0A3 Mcur1-201ENSMUST00000021800 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Chmp6P0C0A3 Syngr1-201ENSMUST00000009727 4180 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Chmp6P0C0A3 Usp51-201ENSMUST00000095755 2204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Chmp6P0C0A3 Epb41-208ENSMUST00000105981 5303 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Chmp6P0C0A3 Ssbp2-201ENSMUST00000004094 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Chmp6P0C0A3 Gm8116-201ENSMUST00000182917 1201 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Chmp6P0C0A3 Plscr3-201ENSMUST00000019605 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Chmp6P0C0A3 Cfap45-201ENSMUST00000085894 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Chmp6P0C0A3 Thap2-202ENSMUST00000218842 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Chmp6P0C0A3 Fhad1-202ENSMUST00000105779 4263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Chmp6P0C0A3 Gckr-201ENSMUST00000072228 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Chmp6P0C0A3 Marveld2-203ENSMUST00000168772 1888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Chmp6P0C0A3 Il1rn-204ENSMUST00000114487 2474 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Chmp6P0C0A3 Ppp2r5b-201ENSMUST00000025695 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Chmp6P0C0A3 Dnajb1-201ENSMUST00000005620 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
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