Protein–RNA interactions for Protein: P08122

Col4a2, Collagen alpha-2(IV) chain, mousemouse

Predictions only

Length 1,707 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col4a2P08122 Ttc34-203ENSMUST00000207854 4733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Col4a2P08122 Egln3-201ENSMUST00000039516 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Col4a2P08122 E230013L22Rik-201ENSMUST00000180408 1856 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Col4a2P08122 Pex5-201ENSMUST00000035861 3139 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Col4a2P08122 Mxd4-201ENSMUST00000042701 3872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Col4a2P08122 Psma3-202ENSMUST00000160027 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Col4a2P08122 Ak1-203ENSMUST00000113278 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Col4a2P08122 Gm26880-201ENSMUST00000181610 1318 ntTSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Col4a2P08122 Osm-201ENSMUST00000075221 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Col4a2P08122 Galnt14-201ENSMUST00000024858 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Col4a2P08122 Clcnkb-202ENSMUST00000105788 2490 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Col4a2P08122 Slc6a11-201ENSMUST00000032451 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Col4a2P08122 Txn2-202ENSMUST00000100486 676 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Col4a2P08122 Folr1-205ENSMUST00000106986 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Col4a2P08122 Gm15371-201ENSMUST00000117057 784 ntBASIC12.96□□□□□ -0.33
Col4a2P08122 Fzr1-202ENSMUST00000118812 1215 ntTSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Col4a2P08122 Rpl9-203ENSMUST00000120094 680 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Col4a2P08122 Gm12050-201ENSMUST00000127483 615 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Col4a2P08122 Sbk3-201ENSMUST00000133272 1086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Col4a2P08122 Gm4271-201ENSMUST00000174444 973 ntBASIC12.96□□□□□ -0.33
Col4a2P08122 AC153845.2-201ENSMUST00000217535 673 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Col4a2P08122 Gm11562-201ENSMUST00000073853 817 ntAPPRIS P1 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Col4a2P08122 Rpl10l-201ENSMUST00000081908 1023 ntAPPRIS P1 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Col4a2P08122 Alkbh4-202ENSMUST00000100568 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Col4a2P08122 Sh3bp5-202ENSMUST00000100730 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Col4a2P08122 Papd7-201ENSMUST00000044081 3994 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Col4a2P08122 Ppp1r15a-202ENSMUST00000167273 2809 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Col4a2P08122 Sh2b2-201ENSMUST00000005188 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Col4a2P08122 Brsk2-204ENSMUST00000105989 2149 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Col4a2P08122 Cacul1-201ENSMUST00000081790 5790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Col4a2P08122 Lrrc14-210ENSMUST00000155735 2286 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Col4a2P08122 Cflar-204ENSMUST00000114309 2010 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Col4a2P08122 Gm12020-201ENSMUST00000119030 2042 ntBASIC12.96□□□□□ -0.33
Col4a2P08122 Tmem159-202ENSMUST00000118737 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Col4a2P08122 Lipo3-202ENSMUST00000112508 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Col4a2P08122 Mfsd12-201ENSMUST00000044844 3971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Col4a2P08122 Tmem254b-202ENSMUST00000100806 1108 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Col4a2P08122 Tmem254a-201ENSMUST00000100811 1108 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Col4a2P08122 Litaf-202ENSMUST00000117360 763 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.96□□□□□ -0.34
Col4a2P08122 Gm8213-201ENSMUST00000118191 441 ntBASIC12.96□□□□□ -0.34
Col4a2P08122 Gm11557-201ENSMUST00000120200 1008 ntBASIC12.96□□□□□ -0.34
Col4a2P08122 Tspan17-208ENSMUST00000163915 459 ntTSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.34
Col4a2P08122 Gm8927-201ENSMUST00000181978 981 ntBASIC12.96□□□□□ -0.34
Col4a2P08122 Gm27331-201ENSMUST00000183705 60 ntBASIC12.96□□□□□ -0.34
Col4a2P08122 Gm40466-201ENSMUST00000212174 422 ntBASIC12.96□□□□□ -0.34
Col4a2P08122 CT009713.10-202ENSMUST00000225734 696 ntBASIC12.96□□□□□ -0.34
Col4a2P08122 Gm3222-201ENSMUST00000071282 990 ntBASIC12.96□□□□□ -0.34
Col4a2P08122 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Col4a2P08122 Lrrc10-201ENSMUST00000073834 1428 ntAPPRIS P1 BASIC12.96□□□□□ -0.34
Col4a2P08122 Npas3-204ENSMUST00000223358 3143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Col4a2P08122 Eef2kmt-201ENSMUST00000064635 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Col4a2P08122 Olfr533-203ENSMUST00000215308 2345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Col4a2P08122 Ap4b1-202ENSMUST00000076599 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Col4a2P08122 Acap3-201ENSMUST00000079031 4301 ntTSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Col4a2P08122 Slk-202ENSMUST00000051691 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Col4a2P08122 Mto1-201ENSMUST00000034896 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Col4a2P08122 Fam171a1-204ENSMUST00000115099 4149 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Col4a2P08122 Gm5187-201ENSMUST00000117317 991 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
Col4a2P08122 Gm15317-201ENSMUST00000129569 699 ntTSL 3 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Col4a2P08122 4930407G08Rik-201ENSMUST00000145831 698 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Col4a2P08122 Gm13070-201ENSMUST00000146532 768 ntTSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Col4a2P08122 Mb-202ENSMUST00000166179 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Col4a2P08122 Mb-203ENSMUST00000169226 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Col4a2P08122 2310040G24Rik-202ENSMUST00000189386 775 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Col4a2P08122 1700018B08Rik-201ENSMUST00000034265 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Col4a2P08122 Cox7a2-201ENSMUST00000034881 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Col4a2P08122 Gm9823-201ENSMUST00000051212 327 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
Col4a2P08122 Gemin7-201ENSMUST00000051364 763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Col4a2P08122 Sphk2-201ENSMUST00000072836 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Col4a2P08122 Stx5a-202ENSMUST00000073430 2112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Col4a2P08122 Ncf1-201ENSMUST00000016094 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Col4a2P08122 Ap4b1-201ENSMUST00000047285 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Col4a2P08122 Top3b-201ENSMUST00000023465 3073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Col4a2P08122 Abhd3-202ENSMUST00000117726 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Col4a2P08122 Mbp-202ENSMUST00000062446 2186 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Col4a2P08122 Slc35b1-201ENSMUST00000021243 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Col4a2P08122 Phka2-202ENSMUST00000112376 2310 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Col4a2P08122 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Col4a2P08122 Pcnx-204ENSMUST00000221721 8318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Col4a2P08122 Gm10605-202ENSMUST00000183019 3198 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
Col4a2P08122 Glmn-202ENSMUST00000082121 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Col4a2P08122 Slc7a7-202ENSMUST00000195970 2057 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Col4a2P08122 Gm12203-201ENSMUST00000118235 598 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
Col4a2P08122 Gm12209-201ENSMUST00000120089 596 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
Col4a2P08122 Cdk4-202ENSMUST00000120226 714 ntTSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Col4a2P08122 Ptgr2-205ENSMUST00000135001 1286 ntTSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Col4a2P08122 Cables1-202ENSMUST00000171109 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Col4a2P08122 Gm8801-201ENSMUST00000173255 1064 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
Col4a2P08122 1700120C18Rik-201ENSMUST00000182952 985 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Col4a2P08122 Gm29649-201ENSMUST00000185649 419 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
Col4a2P08122 Gm867-202ENSMUST00000219979 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Col4a2P08122 Gm13199-201ENSMUST00000071016 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Col4a2P08122 Tpd52-204ENSMUST00000094381 1074 ntTSL 3 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Col4a2P08122 Olfr554-201ENSMUST00000098221 954 ntAPPRIS P1 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Col4a2P08122 Cadps2-202ENSMUST00000069074 3935 ntTSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Col4a2P08122 Erc1-207ENSMUST00000183911 3865 ntTSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Col4a2P08122 Ints14-201ENSMUST00000037504 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Col4a2P08122 Klf5-201ENSMUST00000005279 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Col4a2P08122 1810013L24Rik-201ENSMUST00000023150 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Col4a2P08122 Derl1-201ENSMUST00000022993 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.3 ms