Protein–RNA interactions for Protein: P08032

Spta1, Spectrin alpha chain, erythrocytic 1, mousemouse

Predictions only

Length 2,415 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Spta1P08032 Dars-201ENSMUST00000027602 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Spta1P08032 Oas1b-203ENSMUST00000183291 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Spta1P08032 Oas1b-201ENSMUST00000086377 1832 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Spta1P08032 Chst10-206ENSMUST00000194361 2996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Spta1P08032 App-204ENSMUST00000227021 3264 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Spta1P08032 Pam-201ENSMUST00000058762 4095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Spta1P08032 Gm10327-201ENSMUST00000105222 1002 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Spta1P08032 Zfp414-204ENSMUST00000166627 1211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Spta1P08032 Gm10766-202ENSMUST00000194123 606 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Spta1P08032 Net1-207ENSMUST00000223258 597 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Spta1P08032 Zfp414-201ENSMUST00000073570 1197 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Spta1P08032 Cyp27a1-201ENSMUST00000027356 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Spta1P08032 Slc8a3-201ENSMUST00000064594 4379 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Spta1P08032 Oas1a-201ENSMUST00000080322 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Spta1P08032 Dsg2-201ENSMUST00000059787 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Spta1P08032 Unc5d-202ENSMUST00000209401 3081 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Spta1P08032 Unc5d-203ENSMUST00000210298 3060 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Spta1P08032 Unc5d-205ENSMUST00000211448 3087 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Spta1P08032 Gpam-201ENSMUST00000061856 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Spta1P08032 Bscl2-201ENSMUST00000086058 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Spta1P08032 Ldha-214ENSMUST00000210815 1535 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Spta1P08032 Atp2a3-207ENSMUST00000163326 4606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Spta1P08032 Tmem30a-201ENSMUST00000034878 3658 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Spta1P08032 Cyp2ab1-201ENSMUST00000023513 2720 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Spta1P08032 Rxrb-202ENSMUST00000116612 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Spta1P08032 Tmem219-203ENSMUST00000120007 1087 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Spta1P08032 Gm6460-202ENSMUST00000163787 821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Spta1P08032 Gm8879-201ENSMUST00000170260 1125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Spta1P08032 4933402N22Rik-202ENSMUST00000170301 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Spta1P08032 Gm6244-201ENSMUST00000178732 841 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Spta1P08032 Gm43403-202ENSMUST00000198830 370 ntTSL 3 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Spta1P08032 Wdr45-225ENSMUST00000208443 1172 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Spta1P08032 1810062G17Rik-201ENSMUST00000029268 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Spta1P08032 Rpl10-201ENSMUST00000008826 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Spta1P08032 Gm10570-201ENSMUST00000097865 513 ntAPPRIS P1 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Spta1P08032 Pi4kb-201ENSMUST00000072287 3692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Spta1P08032 Aggf1-201ENSMUST00000022189 3249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Spta1P08032 Sp2-203ENSMUST00000107624 3055 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Spta1P08032 Ccnf-201ENSMUST00000115390 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
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Spta1P08032 Gm28230-201ENSMUST00000053932 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Spta1P08032 Josd1-201ENSMUST00000023061 3394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Spta1P08032 Tbr1-201ENSMUST00000048934 3977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Spta1P08032 Hic2-202ENSMUST00000115698 2765 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Spta1P08032 Ube2g1-201ENSMUST00000021148 3815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Spta1P08032 Sesn1-202ENSMUST00000099931 3809 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Spta1P08032 Fbxl19-204ENSMUST00000188580 2601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Spta1P08032 Chit1-201ENSMUST00000086475 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Spta1P08032 Krt20-201ENSMUST00000017743 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
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Spta1P08032 Gm32926-202ENSMUST00000215162 1176 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Spta1P08032 Tmem40-201ENSMUST00000072933 1272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Spta1P08032 Tmem87b-201ENSMUST00000110325 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
Spta1P08032 Akirin1-201ENSMUST00000102636 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
Spta1P08032 Mob1a-201ENSMUST00000038658 4119 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
Spta1P08032 B3galt4-201ENSMUST00000087543 1569 ntAPPRIS P1 BASIC13.08□□□□□ -0.31
Spta1P08032 Flt1-202ENSMUST00000031653 6895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
Spta1P08032 Terf1-203ENSMUST00000188371 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
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Spta1P08032 Actr1b-201ENSMUST00000043951 3248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Spta1P08032 Endov-203ENSMUST00000106245 5126 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
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Spta1P08032 Arhgap42-201ENSMUST00000093893 6116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Spta1P08032 Nsg2-201ENSMUST00000020537 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Spta1P08032 Fscn1-201ENSMUST00000031565 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
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Spta1P08032 C430014B12Rik-201ENSMUST00000181720 1001 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Spta1P08032 AC165157.4-201ENSMUST00000220587 139 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Spta1P08032 4930596D02Rik-201ENSMUST00000043266 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Spta1P08032 Plpp6-201ENSMUST00000045674 2859 ntAPPRIS P1 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Spta1P08032 Actg1-204ENSMUST00000106215 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Spta1P08032 Fam120c-201ENSMUST00000073364 5463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Spta1P08032 Sipa1-201ENSMUST00000071857 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Spta1P08032 Tmem101-201ENSMUST00000021296 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Spta1P08032 Nipa2-204ENSMUST00000119201 3925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Spta1P08032 Nop9-201ENSMUST00000019441 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Spta1P08032 Hsd3b2-201ENSMUST00000107021 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Spta1P08032 Fbxw17-201ENSMUST00000046974 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Spta1P08032 Nrd1-201ENSMUST00000065977 4311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Spta1P08032 Vcan-201ENSMUST00000109543 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Spta1P08032 Adamts8-201ENSMUST00000068135 3631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Spta1P08032 Pcbp3-201ENSMUST00000001148 2013 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Spta1P08032 CN725425-202ENSMUST00000190436 2041 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Spta1P08032 Smim14-205ENSMUST00000139122 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Spta1P08032 Kctd17-202ENSMUST00000159771 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Spta1P08032 AC153527.1-201ENSMUST00000220412 602 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Spta1P08032 Nfkbie-201ENSMUST00000024742 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Spta1P08032 Ispd-202ENSMUST00000220519 3122 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Spta1P08032 N6amt1-202ENSMUST00000118115 1951 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Spta1P08032 Gatm-201ENSMUST00000028624 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Spta1P08032 Dusp23-201ENSMUST00000027826 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Spta1P08032 Prkg1-206ENSMUST00000182685 1628 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Spta1P08032 Necap2-201ENSMUST00000030760 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
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