Protein–RNA interactions for Protein: P04342

Crygd, Gamma-crystallin D, mousemouse

Predictions only

Length 174 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CrygdP04342 D030068K23Rik-201ENSMUST00000180382 2617 ntTSL 2 BASIC10.55□□□□□ -0.72
CrygdP04342 Adk-207ENSMUST00000224069 1818 ntAPPRIS ALT1 BASIC10.55□□□□□ -0.72
CrygdP04342 Pex3-202ENSMUST00000105539 1961 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
CrygdP04342 Coro1c-201ENSMUST00000004646 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
CrygdP04342 Arhgef17-201ENSMUST00000107032 10190 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
CrygdP04342 Nfkbia-201ENSMUST00000021413 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
CrygdP04342 Fbn1-201ENSMUST00000028633 9847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
CrygdP04342 Tle3-201ENSMUST00000034820 4646 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
CrygdP04342 Zmym3-208ENSMUST00000121429 1890 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
CrygdP04342 Vash1-201ENSMUST00000021681 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
CrygdP04342 Ceacam16-201ENSMUST00000014830 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
CrygdP04342 Gm9252-201ENSMUST00000172364 1602 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
CrygdP04342 Srpx-201ENSMUST00000044789 2477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
CrygdP04342 Rusc1-201ENSMUST00000052539 3316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
CrygdP04342 Rreb1-202ENSMUST00000110237 4617 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
CrygdP04342 Jakmip1-212ENSMUST00000174629 1941 ntTSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
CrygdP04342 Fbxl8-201ENSMUST00000036221 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
CrygdP04342 Eaf1-201ENSMUST00000022446 4918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
CrygdP04342 Phka1-201ENSMUST00000043596 5938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
CrygdP04342 Sec24a-203ENSMUST00000109092 2094 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
CrygdP04342 Gm10676-201ENSMUST00000098778 3221 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
CrygdP04342 Lancl3-201ENSMUST00000069763 3991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
CrygdP04342 Zdhhc23-201ENSMUST00000036321 1380 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
CrygdP04342 Nt5c3b-201ENSMUST00000092688 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
CrygdP04342 Nupr1l-201ENSMUST00000178355 1827 ntAPPRIS P1 BASIC10.54□□□□□ -0.72
CrygdP04342 Miip-201ENSMUST00000030886 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
CrygdP04342 Gm10406-202ENSMUST00000170738 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
CrygdP04342 Gm6297-201ENSMUST00000181475 2146 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
CrygdP04342 Abraxas1-202ENSMUST00000055245 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
CrygdP04342 Pld3-202ENSMUST00000117611 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
CrygdP04342 Fam219a-202ENSMUST00000108050 3321 ntTSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
CrygdP04342 Szrd1-203ENSMUST00000102487 3244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
CrygdP04342 Rnaseh2a-203ENSMUST00000109738 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
CrygdP04342 Rpl34-203ENSMUST00000133802 711 ntTSL 2 BASIC10.54□□□□□ -0.72
CrygdP04342 Gm12212-201ENSMUST00000141032 378 ntTSL 3 BASIC10.54□□□□□ -0.72
CrygdP04342 Ccdc158-204ENSMUST00000151180 3352 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
CrygdP04342 Sf3a2-204ENSMUST00000151928 781 ntTSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
CrygdP04342 Ift27-201ENSMUST00000016781 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
CrygdP04342 4833428L15Rik-201ENSMUST00000181230 1259 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
CrygdP04342 Gm29667-201ENSMUST00000190817 490 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
CrygdP04342 Gm20743-201ENSMUST00000191735 1576 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
CrygdP04342 AC151828.1-201ENSMUST00000219552 661 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
CrygdP04342 Cd302-201ENSMUST00000028356 1257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
CrygdP04342 Nphp4-202ENSMUST00000081393 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
CrygdP04342 Rnf151-201ENSMUST00000008626 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
CrygdP04342 Tbkbp1-205ENSMUST00000118375 3288 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
CrygdP04342 Zfp639-205ENSMUST00000193287 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
CrygdP04342 Usp51-201ENSMUST00000095755 2204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
CrygdP04342 P2ry6-201ENSMUST00000060174 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
CrygdP04342 Dnase1l2-202ENSMUST00000119932 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
CrygdP04342 P3h1-204ENSMUST00000121111 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
CrygdP04342 Cep164-204ENSMUST00000213154 6105 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
CrygdP04342 Usp4-201ENSMUST00000035237 3662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
CrygdP04342 Hnrnpm-205ENSMUST00000139302 2428 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
CrygdP04342 Rhpn1-202ENSMUST00000121137 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
CrygdP04342 Pttg1ip-201ENSMUST00000009435 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
CrygdP04342 Spag1-202ENSMUST00000171205 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
CrygdP04342 Ubxn11-201ENSMUST00000070246 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
CrygdP04342 Fuca1-201ENSMUST00000030434 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
CrygdP04342 Tex44-201ENSMUST00000046004 1724 ntAPPRIS P1 BASIC10.53□□□□□ -0.72
CrygdP04342 Lhx3-201ENSMUST00000028302 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
CrygdP04342 Dlg1-201ENSMUST00000023454 3725 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
CrygdP04342 E2f3-203ENSMUST00000221536 4597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
CrygdP04342 E2f3-204ENSMUST00000222730 4579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
CrygdP04342 Ndst2-202ENSMUST00000223679 3907 ntAPPRIS P1 BASIC10.53□□□□□ -0.72
CrygdP04342 Aurkc-204ENSMUST00000208049 1401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
CrygdP04342 Lats2-210ENSMUST00000174694 3287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.53□□□□□ -0.72
CrygdP04342 Cadm2-203ENSMUST00000120898 2768 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
CrygdP04342 Eif2a-201ENSMUST00000029387 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
CrygdP04342 Sptb-201ENSMUST00000021458 10394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
CrygdP04342 Pmpca-201ENSMUST00000076431 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
CrygdP04342 Hadh-201ENSMUST00000029610 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
CrygdP04342 Ppp1r14d-202ENSMUST00000110820 790 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
CrygdP04342 Crip3-202ENSMUST00000113465 1035 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
CrygdP04342 Apoo-203ENSMUST00000113897 1218 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
CrygdP04342 Pou2f3-rs1-201ENSMUST00000120271 1046 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
CrygdP04342 Gm13994-201ENSMUST00000137397 513 ntTSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
CrygdP04342 Gm13568-201ENSMUST00000156099 446 ntTSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
CrygdP04342 Il11-202ENSMUST00000163481 990 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
CrygdP04342 Gm10275-202ENSMUST00000168697 495 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
CrygdP04342 H2-Pa-201ENSMUST00000182803 626 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
CrygdP04342 Gm5745-201ENSMUST00000183748 313 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
CrygdP04342 AC121598.1-201ENSMUST00000228224 1019 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
CrygdP04342 Uts2-201ENSMUST00000030803 538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
CrygdP04342 Cox6b1-201ENSMUST00000075738 618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
CrygdP04342 Gm4559-201ENSMUST00000080669 600 ntAPPRIS P1 BASIC10.53□□□□□ -0.72
CrygdP04342 Gm10275-201ENSMUST00000092620 635 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
CrygdP04342 Gm10322-201ENSMUST00000095646 336 ntAPPRIS P1 BASIC10.53□□□□□ -0.72
CrygdP04342 Taf2-201ENSMUST00000041733 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
CrygdP04342 Ccnt2-202ENSMUST00000112570 4511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
CrygdP04342 Gm996-201ENSMUST00000114217 4881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.53□□□□□ -0.72
CrygdP04342 Prrxl1-203ENSMUST00000187377 1629 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
CrygdP04342 Lpcat2-201ENSMUST00000046290 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
CrygdP04342 Tor1aip1-201ENSMUST00000027738 1952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
CrygdP04342 Pcdhga12-201ENSMUST00000044851 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
CrygdP04342 Mast2-201ENSMUST00000003908 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
CrygdP04342 Mtss1-201ENSMUST00000080371 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
CrygdP04342 Plcd3-201ENSMUST00000103077 3023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
CrygdP04342 Ppia-206ENSMUST00000213200 1450 ntTSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
CrygdP04342 Sorbs1-203ENSMUST00000165212 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56 ms