Protein–RNA interactions for Protein: P01791

Ig heavy chain V region HPCM6, mousemouse

Predictions only

Length 123 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01791 Lypla1-208ENSMUST00000150971 877 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
P01791 Gm18489-201ENSMUST00000172565 551 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
P01791 Tppp3-202ENSMUST00000176419 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
P01791 4930445N18Rik-202ENSMUST00000181345 1033 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
P01791 Gm42456-201ENSMUST00000196840 387 ntTSL 3 BASIC10.44□□□□□ -0.74
P01791 9230114J08Rik-201ENSMUST00000200375 350 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
P01791 Wdr74-202ENSMUST00000210512 1078 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
P01791 Mrpl28-201ENSMUST00000025014 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
P01791 Ydjc-201ENSMUST00000069064 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
P01791 Hist1h2af-201ENSMUST00000073261 399 ntAPPRIS P1 BASIC10.44□□□□□ -0.74
P01791 Dupd1-201ENSMUST00000073870 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
P01791 Rplp2-201ENSMUST00000084434 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
P01791 Hist1h3c-201ENSMUST00000091752 630 ntAPPRIS P1 BASIC10.44□□□□□ -0.74
P01791 Rhog-201ENSMUST00000098230 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
P01791 Cdx4-201ENSMUST00000033689 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
P01791 Actn4-211ENSMUST00000217157 3530 ntTSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
P01791 Ap2a1-201ENSMUST00000085399 3442 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
P01791 Ints1-201ENSMUST00000072607 7102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
P01791 4931440F15Rik-201ENSMUST00000104962 3274 ntAPPRIS P1 BASIC10.44□□□□□ -0.74
P01791 Enc1-201ENSMUST00000041623 4737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
P01791 Sde2-201ENSMUST00000038091 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
P01791 Bscl2-206ENSMUST00000160556 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
P01791 Nrp2-203ENSMUST00000075144 6723 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
P01791 Klc2-204ENSMUST00000116563 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
P01791 Smim14-205ENSMUST00000139122 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
P01791 Xrcc3-201ENSMUST00000021715 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
P01791 Gpc5-201ENSMUST00000022707 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
P01791 Vrtn-201ENSMUST00000095551 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
P01791 Trpm4-209ENSMUST00000211743 3673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
P01791 Twistnb-201ENSMUST00000020877 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
P01791 Dmrtc2-201ENSMUST00000011493 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
P01791 Slitrk3-201ENSMUST00000059407 3587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
P01791 Eml6-201ENSMUST00000058902 8083 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
P01791 Pias3-202ENSMUST00000107076 2858 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
P01791 Car7-201ENSMUST00000056051 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
P01791 4933434E20Rik-203ENSMUST00000068798 1500 ntTSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
P01791 Maged2-204ENSMUST00000112700 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
P01791 Togaram2-205ENSMUST00000153445 3302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
P01791 Gnaz-202ENSMUST00000159991 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
P01791 Zfp236-201ENSMUST00000171071 9626 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
P01791 Wnt7a-201ENSMUST00000032180 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
P01791 Olfr71-202ENSMUST00000107862 2587 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.43□□□□□ -0.74
P01791 A530013C23Rik-201ENSMUST00000130679 2555 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
P01791 Tm6sf2-202ENSMUST00000110160 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
P01791 Il11ra1-203ENSMUST00000108041 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
P01791 Gm13305-201ENSMUST00000098121 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
P01791 Oxa1l-201ENSMUST00000000985 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
P01791 Miat-205ENSMUST00000182953 9163 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
P01791 Ate1-202ENSMUST00000035458 4685 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
P01791 Chrdl1-203ENSMUST00000112878 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
P01791 A530072M11Rik-201ENSMUST00000151122 1852 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
P01791 Bap1-201ENSMUST00000022458 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
P01791 Dcaf11-204ENSMUST00000121622 2379 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
P01791 Dlgap1-208ENSMUST00000135938 2895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
P01791 Samd4b-204ENSMUST00000208199 4391 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
P01791 Spint2-202ENSMUST00000108236 1211 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
P01791 Zkscan8-202ENSMUST00000110481 728 ntTSL 2 BASIC10.43□□□□□ -0.74
P01791 Lamtor2-202ENSMUST00000119002 568 ntTSL 2 BASIC10.43□□□□□ -0.74
P01791 Gm2308-201ENSMUST00000166539 1004 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
P01791 Gm5914-202ENSMUST00000182863 375 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
P01791 Tecr-201ENSMUST00000019382 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
P01791 Vmn2r-ps89-201ENSMUST00000209195 1010 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
P01791 Coa6-201ENSMUST00000059093 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
P01791 Psmb4-201ENSMUST00000005923 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
P01791 Lamtor4-201ENSMUST00000062067 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
P01791 Prdm5-203ENSMUST00000081219 984 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
P01791 Olfr632-201ENSMUST00000098189 954 ntAPPRIS P1 BASIC10.43□□□□□ -0.74
P01791 Atp6v0c-202ENSMUST00000098862 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.43□□□□□ -0.74
P01791 Trnt1-201ENSMUST00000057578 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
P01791 Gpr153-203ENSMUST00000105651 3777 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
P01791 Gpr153-201ENSMUST00000055754 3757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
P01791 Stk25-201ENSMUST00000027498 4249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
P01791 Ankrd61-201ENSMUST00000079624 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
P01791 Cyp1b1-201ENSMUST00000024894 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
P01791 Pnkp-201ENSMUST00000003044 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
P01791 Morn1-201ENSMUST00000030915 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
P01791 A430093F15Rik-204ENSMUST00000186596 2115 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
P01791 Lsm14b-202ENSMUST00000058764 2566 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
P01791 Fgfr3-215ENSMUST00000202138 3960 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
P01791 Prkce-202ENSMUST00000097275 6254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
P01791 Ccdc185-201ENSMUST00000060041 2055 ntAPPRIS P1 BASIC10.43□□□□□ -0.74
P01791 Gm13848-201ENSMUST00000130777 2047 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
P01791 Dph5-204ENSMUST00000189799 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
P01791 Gm37795-201ENSMUST00000194216 2459 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
P01791 Gm10305-201ENSMUST00000195331 2475 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
P01791 Tmem41b-201ENSMUST00000094097 3840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
P01791 Cbs-203ENSMUST00000118504 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
P01791 Ptk2-201ENSMUST00000110036 4184 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
P01791 Pbx2-203ENSMUST00000173328 1990 ntTSL 2 BASIC10.43□□□□□ -0.74
P01791 Ubr7-201ENSMUST00000046404 3261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
P01791 Gm26547-201ENSMUST00000181186 1508 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
P01791 Olah-201ENSMUST00000027955 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
P01791 Alox8-202ENSMUST00000094078 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
P01791 Dnmt3a-205ENSMUST00000172689 2328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
P01791 Zyg11a-203ENSMUST00000223127 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
P01791 Prr33-201ENSMUST00000054910 2251 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
P01791 Hdac11-201ENSMUST00000041736 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
P01791 Aida-201ENSMUST00000109166 4279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
P01791 Ccdc69-201ENSMUST00000055040 1402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
P01791 Cuedc2-201ENSMUST00000051234 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
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