Protein–RNA interactions for Protein: O88255

Gm10509, Mszf57 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 85 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm10509O88255 Trem1-202ENSMUST00000113251 2077 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm10509O88255 Zfp57-211ENSMUST00000174524 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm10509O88255 Msh2-201ENSMUST00000024967 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm10509O88255 Lancl1-202ENSMUST00000113979 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm10509O88255 Egfl7-212ENSMUST00000166920 1391 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm10509O88255 Dnajb2-210ENSMUST00000188931 3066 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm10509O88255 Fam126b-201ENSMUST00000038372 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gm10509O88255 Creg2-201ENSMUST00000053355 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gm10509O88255 Tbx3-201ENSMUST00000018748 4856 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gm10509O88255 Myo1d-201ENSMUST00000041065 5354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gm10509O88255 Tacc3-201ENSMUST00000074849 2669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gm10509O88255 Csnk1d-201ENSMUST00000018274 3675 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
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Gm10509O88255 Pprc1-202ENSMUST00000099392 3956 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gm10509O88255 Nfatc1-202ENSMUST00000078049 4607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gm10509O88255 Gpr137b-202ENSMUST00000220628 3634 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gm10509O88255 CT025626.1-201ENSMUST00000223735 1455 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Gm10509O88255 Spidr-201ENSMUST00000040248 3279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gm10509O88255 Wdr70-201ENSMUST00000045766 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gm10509O88255 Ate1-201ENSMUST00000033139 4735 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gm10509O88255 Ptprk-201ENSMUST00000166468 6177 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gm10509O88255 Samd4b-204ENSMUST00000208199 4391 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gm10509O88255 Col5a1-201ENSMUST00000028280 8406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gm10509O88255 Trim80-201ENSMUST00000093914 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gm10509O88255 Slc13a3-201ENSMUST00000029208 3524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gm10509O88255 Fam192a-201ENSMUST00000034226 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
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Gm10509O88255 Pex11g-202ENSMUST00000111081 666 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
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Gm10509O88255 2810408I11Rik-202ENSMUST00000150749 711 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
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Gm10509O88255 4930573H18Rik-201ENSMUST00000197696 906 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
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Gm10509O88255 Hsd17b14-205ENSMUST00000210300 797 ntTSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
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Gm10509O88255 Lypd1-201ENSMUST00000027582 1447 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gm10509O88255 Galt-201ENSMUST00000084695 1595 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
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Gm10509O88255 Serpinh1-205ENSMUST00000208119 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gm10509O88255 Tmed5-202ENSMUST00000061203 2194 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
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Gm10509O88255 Pramel1-201ENSMUST00000037419 2794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gm10509O88255 Prkcb-202ENSMUST00000064989 2911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gm10509O88255 Jpt1-201ENSMUST00000021083 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gm10509O88255 Atpaf2-201ENSMUST00000108721 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gm10509O88255 Gm26576-201ENSMUST00000181018 1977 ntTSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gm10509O88255 Rbmx-202ENSMUST00000114726 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gm10509O88255 Kcnq2-207ENSMUST00000103050 2713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gm10509O88255 Ctps-201ENSMUST00000030381 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gm10509O88255 Atp2a3-202ENSMUST00000108484 4467 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Gm10509O88255 Klhdc8b-207ENSMUST00000193286 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Gm10509O88255 Cybrd1-201ENSMUST00000028403 5339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Gm10509O88255 Esyt1-201ENSMUST00000026427 3981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Gm10509O88255 Kbtbd7-201ENSMUST00000061222 4526 ntAPPRIS P1 BASIC10.11□□□□□ -0.79
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Gm10509O88255 Gm45612-201ENSMUST00000211320 160 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
Gm10509O88255 Ppcdc-205ENSMUST00000214144 724 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Gm10509O88255 Olfr572-203ENSMUST00000215782 1233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Gm10509O88255 Gm32351-201ENSMUST00000220503 438 ntTSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Gm10509O88255 AC166341.4-201ENSMUST00000220625 123 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
Gm10509O88255 Tmod4-201ENSMUST00000005769 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Gm10509O88255 Rnf152-201ENSMUST00000058688 8492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Gm10509O88255 Cdh7-206ENSMUST00000137092 2681 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
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Gm10509O88255 Plch2-207ENSMUST00000139976 5322 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Gm10509O88255 Fam122b-203ENSMUST00000114841 3074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Gm10509O88255 Rbbp7-201ENSMUST00000033720 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Gm10509O88255 Nfic-207ENSMUST00000221817 1531 ntTSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Gm10509O88255 Ckmt1-202ENSMUST00000078222 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Gm10509O88255 Hp1bp3-204ENSMUST00000105826 3348 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
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