Protein–RNA interactions for Protein: O54988

Slk, STE20-like serine/threonine-protein kinase, mousemouse

Predictions only

Length 1,233 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SlkO54988 D630023F18Rik-201ENSMUST00000050047 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SlkO54988 Arid5a-201ENSMUST00000097778 2270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SlkO54988 Aco1-201ENSMUST00000102973 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SlkO54988 Prss36-202ENSMUST00000118755 3028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SlkO54988 Gm9754-201ENSMUST00000031305 3004 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SlkO54988 Gm38575-203ENSMUST00000215824 1490 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SlkO54988 Casp6-201ENSMUST00000029626 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SlkO54988 Armc8-201ENSMUST00000035043 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SlkO54988 5330406M23Rik-201ENSMUST00000195672 2094 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
SlkO54988 Gm20465-201ENSMUST00000174768 1932 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SlkO54988 Clns1a-201ENSMUST00000026506 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SlkO54988 Twistnb-201ENSMUST00000020877 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SlkO54988 1700108N11Rik-201ENSMUST00000153051 917 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SlkO54988 Gm28051-201ENSMUST00000179306 445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SlkO54988 4930445N18Rik-202ENSMUST00000181345 1033 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SlkO54988 Gm27357-201ENSMUST00000183754 135 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
SlkO54988 Tm4sf5-201ENSMUST00000019063 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SlkO54988 Gm20383-201ENSMUST00000203799 1227 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SlkO54988 Rfc4-201ENSMUST00000023598 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SlkO54988 Ifi27-204ENSMUST00000079294 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SlkO54988 Kars-202ENSMUST00000093120 2131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SlkO54988 Lzts3-202ENSMUST00000089561 4169 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SlkO54988 Tdrp-201ENSMUST00000062613 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SlkO54988 Vrtn-202ENSMUST00000166772 3098 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SlkO54988 Efr3a-205ENSMUST00000173858 2848 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SlkO54988 Lmbr1-203ENSMUST00000196321 3422 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SlkO54988 Fam49b-201ENSMUST00000063838 3797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SlkO54988 A530013C23Rik-201ENSMUST00000130679 2555 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SlkO54988 Emc3-201ENSMUST00000032425 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SlkO54988 Fhod3-201ENSMUST00000037097 5408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SlkO54988 Fgd6-201ENSMUST00000020208 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SlkO54988 Phka1-203ENSMUST00000113611 6064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SlkO54988 Phka1-205ENSMUST00000120270 6064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SlkO54988 Grk6-202ENSMUST00000099482 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SlkO54988 Slc22a18-202ENSMUST00000105917 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SlkO54988 Clcn6-201ENSMUST00000030879 3306 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SlkO54988 Rgs12-202ENSMUST00000087684 4713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SlkO54988 Taf7l-201ENSMUST00000009740 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SlkO54988 4933416C03Rik-201ENSMUST00000099261 2254 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SlkO54988 Etfdh-201ENSMUST00000029386 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SlkO54988 Gad2-201ENSMUST00000028123 5744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SlkO54988 Nit1-202ENSMUST00000111295 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SlkO54988 Slc25a3-206ENSMUST00000170810 1341 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
SlkO54988 Ablim1-202ENSMUST00000099294 6232 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
SlkO54988 1700051A21Rik-201ENSMUST00000147937 1516 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
SlkO54988 Rnf14-202ENSMUST00000170811 2886 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SlkO54988 Fnbp4-201ENSMUST00000013759 4691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SlkO54988 Dnajc6-204ENSMUST00000106930 5127 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SlkO54988 Arl6ip1-201ENSMUST00000032888 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SlkO54988 Nat9-203ENSMUST00000103040 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SlkO54988 Nat9-204ENSMUST00000103041 953 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
SlkO54988 Gm13836-201ENSMUST00000121159 501 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
SlkO54988 Spata33-204ENSMUST00000212346 715 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
SlkO54988 Gm38575-201ENSMUST00000213881 652 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
SlkO54988 Nmu-201ENSMUST00000031146 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SlkO54988 Spem1-201ENSMUST00000045771 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SlkO54988 Apol7d-201ENSMUST00000097699 826 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
SlkO54988 Mtif3-202ENSMUST00000066675 4927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SlkO54988 Cog7-201ENSMUST00000057576 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SlkO54988 Psmd12-201ENSMUST00000021063 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SlkO54988 Pag1-204ENSMUST00000161949 8256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SlkO54988 Gm9920-204ENSMUST00000148544 2752 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
SlkO54988 Pou2f3-202ENSMUST00000176636 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
SlkO54988 Prkce-202ENSMUST00000097275 6254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
SlkO54988 Gnao1-203ENSMUST00000125716 3462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
SlkO54988 Tcf4-253ENSMUST00000202610 1959 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.22
SlkO54988 Elp6-205ENSMUST00000199592 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SlkO54988 Hdgfl2-201ENSMUST00000002911 2264 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SlkO54988 Mcm9-206ENSMUST00000220007 3513 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SlkO54988 Mest-202ENSMUST00000124665 2665 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SlkO54988 Atp6v0d1-201ENSMUST00000013304 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SlkO54988 Chtf8-202ENSMUST00000175940 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SlkO54988 Gm45638-201ENSMUST00000211507 2878 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
SlkO54988 Lrrc29-203ENSMUST00000210412 2304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SlkO54988 Mllt6-201ENSMUST00000044730 7274 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SlkO54988 Setdb2-201ENSMUST00000095775 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SlkO54988 Dbndd2-204ENSMUST00000109350 1055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SlkO54988 Rasgrp2-205ENSMUST00000113471 535 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SlkO54988 Tppp3-201ENSMUST00000014990 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SlkO54988 BC022687-202ENSMUST00000177808 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SlkO54988 Dusp13-213ENSMUST00000184703 902 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SlkO54988 Gm40457-201ENSMUST00000205319 1174 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SlkO54988 D530014G21Rik-201ENSMUST00000208416 587 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SlkO54988 Krt10-202ENSMUST00000211768 557 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SlkO54988 Gm4316-202ENSMUST00000212490 1115 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SlkO54988 Zfyve21-204ENSMUST00000221375 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SlkO54988 Ifi27l2b-201ENSMUST00000044687 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SlkO54988 Gm5617-201ENSMUST00000048824 531 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SlkO54988 Megf6-201ENSMUST00000030897 6851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SlkO54988 Scamp3-203ENSMUST00000120697 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SlkO54988 Npcd-202ENSMUST00000089299 1453 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SlkO54988 Cacna2d2-208ENSMUST00000170737 5332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SlkO54988 Zbtb7b-203ENSMUST00000107433 3650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SlkO54988 Smim13-201ENSMUST00000165561 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SlkO54988 Dido1-207ENSMUST00000130986 4898 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SlkO54988 Zfp618-203ENSMUST00000107415 8826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SlkO54988 Spg7-202ENSMUST00000125975 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SlkO54988 Stra8-201ENSMUST00000031876 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SlkO54988 Ift74-202ENSMUST00000107104 1713 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SlkO54988 Thegl-202ENSMUST00000117880 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.2 ms