Protein–RNA interactions for Protein: O35955

Psmb10, Proteasome subunit beta type-10, mousemouse

Predictions only

Length 273 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Psmb10O35955 Nynrin-202ENSMUST00000168479 7511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Psmb10O35955 Gm3928-201ENSMUST00000121141 1307 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
Psmb10O35955 Desi1-206ENSMUST00000152227 2934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Psmb10O35955 A230077H06Rik-201ENSMUST00000188579 2918 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Psmb10O35955 AC131743.5-201ENSMUST00000220775 1618 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
Psmb10O35955 Chac1-201ENSMUST00000028780 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Psmb10O35955 Fxyd3-205ENSMUST00000167369 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Psmb10O35955 9430038I01Rik-202ENSMUST00000117404 699 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Psmb10O35955 Slbp-205ENSMUST00000139518 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Psmb10O35955 Gm15635-203ENSMUST00000148972 554 ntTSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Psmb10O35955 Gm11455-201ENSMUST00000149285 733 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Psmb10O35955 Tmprss5-204ENSMUST00000167095 1146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Psmb10O35955 Saa2-203ENSMUST00000210769 652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Psmb10O35955 Rhoc-201ENSMUST00000002303 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Psmb10O35955 Magohb-201ENSMUST00000032307 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Psmb10O35955 Ppib-201ENSMUST00000034947 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Psmb10O35955 Saa2-201ENSMUST00000075982 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Psmb10O35955 Otop2-202ENSMUST00000106544 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Psmb10O35955 Gm26688-201ENSMUST00000181176 1568 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Psmb10O35955 Cacna1g-203ENSMUST00000103166 8104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Psmb10O35955 Camk2b-208ENSMUST00000109812 1875 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Psmb10O35955 Arl4a-205ENSMUST00000146905 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Psmb10O35955 Igf2-201ENSMUST00000000033 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Psmb10O35955 Ly9-202ENSMUST00000068878 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Psmb10O35955 Diaph3-202ENSMUST00000168889 4582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Psmb10O35955 E2f3-203ENSMUST00000221536 4597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Psmb10O35955 E2f3-204ENSMUST00000222730 4579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Psmb10O35955 Diaph3-201ENSMUST00000022599 4582 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Psmb10O35955 Olah-201ENSMUST00000027955 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Psmb10O35955 Mycbpap-201ENSMUST00000040692 1512 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Psmb10O35955 Ptpn1-201ENSMUST00000029053 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Psmb10O35955 Atxn7l3b-201ENSMUST00000099276 3566 ntAPPRIS P1 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Psmb10O35955 Nfatc4-201ENSMUST00000024179 3267 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Psmb10O35955 Cant1-202ENSMUST00000092378 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Psmb10O35955 Gm14812-201ENSMUST00000156494 1794 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Psmb10O35955 Eya1-203ENSMUST00000168081 4366 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Psmb10O35955 Efemp1-201ENSMUST00000020759 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Psmb10O35955 Ppp1r8-201ENSMUST00000030702 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Psmb10O35955 Fam192a-201ENSMUST00000034226 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Psmb10O35955 Ptn-202ENSMUST00000201321 2558 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Psmb10O35955 Gm37500-201ENSMUST00000192059 1443 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
Psmb10O35955 Pla2g5-204ENSMUST00000102513 2289 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Psmb10O35955 Muc20-201ENSMUST00000041123 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Psmb10O35955 Fam131b-202ENSMUST00000095974 3992 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Psmb10O35955 Arhgef2-229ENSMUST00000177303 3000 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Psmb10O35955 4930556M19Rik-201ENSMUST00000180604 2468 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Psmb10O35955 1600002D24Rik-202ENSMUST00000136744 1854 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Psmb10O35955 Bap1-201ENSMUST00000022458 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Psmb10O35955 Nit1-202ENSMUST00000111295 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Psmb10O35955 Acin1-216ENSMUST00000141453 2381 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Psmb10O35955 Ltbp4-204ENSMUST00000118961 3444 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Psmb10O35955 Sipa1-201ENSMUST00000071857 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Psmb10O35955 0610025J13Rik-201ENSMUST00000131324 652 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Psmb10O35955 Gm21887-203ENSMUST00000180251 531 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Psmb10O35955 0610025J13Rik-203ENSMUST00000180374 713 ntTSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Psmb10O35955 Gm6089-201ENSMUST00000197666 938 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
Psmb10O35955 Gm13830-205ENSMUST00000201195 1155 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
Psmb10O35955 AC159301.1-201ENSMUST00000225130 1182 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
Psmb10O35955 Inmt-201ENSMUST00000003569 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Psmb10O35955 Gm20708-201ENSMUST00000132298 1780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Psmb10O35955 Pja1-203ENSMUST00000113792 3038 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Psmb10O35955 Sf3a2-203ENSMUST00000148665 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Psmb10O35955 Shmt2-206ENSMUST00000219239 2238 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Psmb10O35955 Srgn-204ENSMUST00000160987 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.21□□□□□ -0.3
Psmb10O35955 Foxj2-202ENSMUST00000177927 4620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.3
Psmb10O35955 Arhgef17-201ENSMUST00000107032 10190 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.3
Psmb10O35955 Mier3-203ENSMUST00000109272 5279 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Psmb10O35955 Psmc4-201ENSMUST00000032824 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Psmb10O35955 Chrm4-201ENSMUST00000045537 1440 ntAPPRIS P1 BASIC13.21□□□□□ -0.3
Psmb10O35955 Galns-203ENSMUST00000212319 2111 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Psmb10O35955 Naa15-205ENSMUST00000193266 7480 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Psmb10O35955 Esm1-201ENSMUST00000038144 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Psmb10O35955 P2rx6-203ENSMUST00000171002 1353 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Psmb10O35955 Snupn-201ENSMUST00000068856 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Psmb10O35955 Eln-201ENSMUST00000015138 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Psmb10O35955 Gnb2-212ENSMUST00000150063 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Psmb10O35955 Rnf10-202ENSMUST00000112096 3112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Psmb10O35955 Marveld3-201ENSMUST00000001722 1330 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Psmb10O35955 Gm2155-201ENSMUST00000181581 1974 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Psmb10O35955 Arnt-201ENSMUST00000015666 2603 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Psmb10O35955 Iqck-201ENSMUST00000098087 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Psmb10O35955 Pnoc-201ENSMUST00000059339 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Psmb10O35955 Larp4b-202ENSMUST00000188211 5610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Psmb10O35955 Slc8b1-204ENSMUST00000111890 2775 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Psmb10O35955 Nme1-202ENSMUST00000107844 452 ntTSL 3 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Psmb10O35955 Gm8584-201ENSMUST00000171982 758 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Psmb10O35955 Gm4691-201ENSMUST00000182339 1000 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Psmb10O35955 4930500L23Rik-201ENSMUST00000198000 747 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Psmb10O35955 Gm2451-201ENSMUST00000199447 999 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Psmb10O35955 Gm10290-201ENSMUST00000200451 999 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Psmb10O35955 Gm43935-201ENSMUST00000203569 1050 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Psmb10O35955 Gm45167-201ENSMUST00000208007 322 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Psmb10O35955 Ilvbl-203ENSMUST00000218215 2331 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Psmb10O35955 Zmym3-208ENSMUST00000121429 1890 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Psmb10O35955 Wdr5-201ENSMUST00000113952 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Psmb10O35955 Tbc1d16-201ENSMUST00000036113 6986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Psmb10O35955 Miip-201ENSMUST00000030886 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Psmb10O35955 Inhba-201ENSMUST00000042603 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Psmb10O35955 Ifnlr1-201ENSMUST00000074408 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Psmb10O35955 Axdnd1-204ENSMUST00000178036 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.8 ms