Protein–RNA interactions for Protein: O35864

Cops5, COP9 signalosome complex subunit 5, mousemouse

Predictions only

Length 334 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cops5O35864 Trim15-201ENSMUST00000025329 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cops5O35864 Slc6a8-203ENSMUST00000114465 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cops5O35864 Unc50-202ENSMUST00000114925 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cops5O35864 Gm11425-201ENSMUST00000119608 498 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Cops5O35864 Rpl12-203ENSMUST00000126610 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cops5O35864 Ly6g6e-203ENSMUST00000172678 750 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cops5O35864 Gm27892-201ENSMUST00000185017 106 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Cops5O35864 Gm7067-201ENSMUST00000207698 1249 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Cops5O35864 Gm32926-202ENSMUST00000215162 1176 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cops5O35864 Olfr373-201ENSMUST00000074540 945 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cops5O35864 Gm9396-201ENSMUST00000076703 567 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Cops5O35864 Tex13c3-201ENSMUST00000089246 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cops5O35864 Tpm3-201ENSMUST00000029549 2230 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cops5O35864 Derl1-201ENSMUST00000022993 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cops5O35864 Smarcc1-204ENSMUST00000197984 3538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cops5O35864 Anapc7-203ENSMUST00000122010 2950 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cops5O35864 Itgb4-201ENSMUST00000021107 6014 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cops5O35864 Mpped1-201ENSMUST00000046168 3265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cops5O35864 Tfap2c-201ENSMUST00000030391 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cops5O35864 Fzd7-201ENSMUST00000114246 4532 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cops5O35864 Gm45630-201ENSMUST00000210243 1911 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Cops5O35864 AC115735.4-201ENSMUST00000227460 1944 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Cops5O35864 Tspan32-205ENSMUST00000105924 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cops5O35864 Orc6-202ENSMUST00000170141 1466 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cops5O35864 Syn2-201ENSMUST00000009538 2708 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cops5O35864 Plekhn1-201ENSMUST00000105569 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cops5O35864 Tbk1-201ENSMUST00000020316 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cops5O35864 Mfsd2a-201ENSMUST00000030408 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cops5O35864 Gm15557-201ENSMUST00000109629 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cops5O35864 Mbtd1-201ENSMUST00000063645 2138 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cops5O35864 Tmbim6-201ENSMUST00000023749 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cops5O35864 Hhat-201ENSMUST00000044190 2839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cops5O35864 Eif4g1-202ENSMUST00000073840 5394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cops5O35864 Hadhb-201ENSMUST00000026841 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cops5O35864 Sipa1l1-202ENSMUST00000166429 8215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cops5O35864 Gm11557-201ENSMUST00000120200 1008 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Cops5O35864 Gm13385-201ENSMUST00000121089 220 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Cops5O35864 Gm8927-201ENSMUST00000181978 981 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Cops5O35864 Gm5425-201ENSMUST00000214125 459 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Cops5O35864 Rsph9-201ENSMUST00000024762 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cops5O35864 Duoxa1-201ENSMUST00000028653 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cops5O35864 Gm3222-201ENSMUST00000071282 990 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Cops5O35864 Wdr83-201ENSMUST00000093357 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cops5O35864 Ssr1-204ENSMUST00000225319 1610 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Cops5O35864 Med14-202ENSMUST00000096495 6963 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Cops5O35864 Syt3-201ENSMUST00000118831 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Cops5O35864 Csnk1d-201ENSMUST00000018274 3675 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Cops5O35864 AC114543.1-201ENSMUST00000226451 1558 ntBASIC15.52■□□□□ 0.07
Cops5O35864 Hoxb8-201ENSMUST00000052650 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Cops5O35864 Poli-201ENSMUST00000043286 2591 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Cops5O35864 Sgce-202ENSMUST00000090686 1547 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Cops5O35864 Tmem211-201ENSMUST00000086615 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Cops5O35864 Ckmt2-201ENSMUST00000022122 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Cops5O35864 Sirt3-201ENSMUST00000026559 1461 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Cops5O35864 Chst4-202ENSMUST00000211894 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Cops5O35864 Tbp-202ENSMUST00000117593 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Cops5O35864 Pum2-202ENSMUST00000111122 6311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cops5O35864 Fbln7-201ENSMUST00000028864 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cops5O35864 Gm16796-201ENSMUST00000126086 3172 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cops5O35864 Pccb-204ENSMUST00000149322 2188 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cops5O35864 Tbc1d1-203ENSMUST00000119756 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cops5O35864 Pycr1-201ENSMUST00000026133 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cops5O35864 Slc22a20-201ENSMUST00000041827 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cops5O35864 Mir692-1-201ENSMUST00000102263 109 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Cops5O35864 Rab1a-202ENSMUST00000109601 1200 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cops5O35864 Gm15376-201ENSMUST00000122258 783 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Cops5O35864 Prn-201ENSMUST00000124100 2132 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cops5O35864 Gm20036-201ENSMUST00000177547 844 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cops5O35864 Selenoh-205ENSMUST00000189636 499 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cops5O35864 Gm11427-203ENSMUST00000215482 1203 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cops5O35864 Elane-201ENSMUST00000046091 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cops5O35864 Tmem107-201ENSMUST00000075980 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cops5O35864 Gm5356-201ENSMUST00000093326 615 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Cops5O35864 Mir497b-201ENSMUST00000093601 125 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Cops5O35864 Ythdf3-202ENSMUST00000108346 4929 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cops5O35864 Acr-201ENSMUST00000023295 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cops5O35864 Gm9768-201ENSMUST00000206007 2861 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Cops5O35864 Gopc-201ENSMUST00000020008 4216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cops5O35864 Bdh1-202ENSMUST00000115226 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cops5O35864 Gm29358-201ENSMUST00000186510 1734 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cops5O35864 Gm6159-201ENSMUST00000191249 1724 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Cops5O35864 Abhd14b-201ENSMUST00000048527 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cops5O35864 Esrp1-202ENSMUST00000108310 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cops5O35864 Hist1h1e-201ENSMUST00000062045 1930 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cops5O35864 AC140354.1-201ENSMUST00000219499 2425 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cops5O35864 Mvk-202ENSMUST00000112239 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cops5O35864 Klhl11-201ENSMUST00000056665 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cops5O35864 Npr3-201ENSMUST00000066529 6892 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cops5O35864 Rbm15-201ENSMUST00000061772 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cops5O35864 Ppp2r2c-201ENSMUST00000031003 4088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cops5O35864 Slc20a2-201ENSMUST00000067786 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cops5O35864 Usp27x-203ENSMUST00000191497 4273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cops5O35864 Map2k6-202ENSMUST00000100260 2088 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cops5O35864 Pdpn-201ENSMUST00000030317 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cops5O35864 Keap1-205ENSMUST00000194542 3151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cops5O35864 Adck5-207ENSMUST00000160784 1998 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cops5O35864 Slc33a1-202ENSMUST00000160883 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cops5O35864 Tbl1x-201ENSMUST00000088217 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cops5O35864 Mrps10-202ENSMUST00000119841 1113 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cops5O35864 C430049B03Rik-201ENSMUST00000129764 868 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.6 ms