Protein–RNA interactions for Protein: O35134

Polr1a, DNA-directed RNA polymerase I subunit RPA1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,717 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Polr1aO35134 Polr3c-202ENSMUST00000125183 923 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Polr1aO35134 2900093K20Rik-201ENSMUST00000190930 567 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
Polr1aO35134 Gm45233-201ENSMUST00000203633 898 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Polr1aO35134 Gm45930-201ENSMUST00000221330 292 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
Polr1aO35134 Syt7-203ENSMUST00000169121 6834 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Polr1aO35134 Map4k5-201ENSMUST00000049239 4452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Polr1aO35134 Slc27a4-201ENSMUST00000080065 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Polr1aO35134 Rwdd2b-201ENSMUST00000039101 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Polr1aO35134 Fpr1-201ENSMUST00000061516 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Polr1aO35134 Pef1-202ENSMUST00000118199 1915 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Polr1aO35134 Gm8337-201ENSMUST00000187358 1938 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
Polr1aO35134 Ndufs5-202ENSMUST00000106206 599 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Polr1aO35134 Gm5741-201ENSMUST00000177563 328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Polr1aO35134 Gm4610-201ENSMUST00000198222 905 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Polr1aO35134 Tyms-ps-201ENSMUST00000219550 915 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
Polr1aO35134 Trappc12-203ENSMUST00000170994 2818 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Polr1aO35134 Sbno2-204ENSMUST00000217972 2462 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Polr1aO35134 Nhs-201ENSMUST00000081569 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Polr1aO35134 Gas8-201ENSMUST00000093043 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Polr1aO35134 Mapt-203ENSMUST00000106989 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Polr1aO35134 Chd1l-201ENSMUST00000029730 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Polr1aO35134 Ly9-201ENSMUST00000004827 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Polr1aO35134 Dlk1-204ENSMUST00000109843 1300 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Polr1aO35134 Meis2-204ENSMUST00000110906 3229 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Polr1aO35134 Fastk-203ENSMUST00000115043 3056 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Polr1aO35134 Gypc-203ENSMUST00000174459 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Polr1aO35134 Pip4k2a-201ENSMUST00000006912 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Polr1aO35134 Dda1-206ENSMUST00000138892 1738 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Polr1aO35134 Mad2l2-203ENSMUST00000105707 949 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Polr1aO35134 Toe1-202ENSMUST00000106455 1209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Polr1aO35134 Agbl3-202ENSMUST00000115012 790 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Polr1aO35134 Agbl3-203ENSMUST00000115014 805 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Polr1aO35134 Gm13350-201ENSMUST00000120519 479 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
Polr1aO35134 Cd180-203ENSMUST00000170878 842 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Polr1aO35134 Cd180-205ENSMUST00000172138 518 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Polr1aO35134 Gm18827-201ENSMUST00000188341 790 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
Polr1aO35134 AC131777.1-201ENSMUST00000214749 387 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Polr1aO35134 Snora73a-201ENSMUST00000082453 205 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
Polr1aO35134 H2afv-201ENSMUST00000093346 519 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Polr1aO35134 Oscar-202ENSMUST00000108645 1829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Polr1aO35134 Oscar-201ENSMUST00000039507 1823 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Polr1aO35134 Gm12404-201ENSMUST00000122839 1661 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Polr1aO35134 Myrf-202ENSMUST00000186056 3636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Polr1aO35134 Ube2j2-204ENSMUST00000105582 1394 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Polr1aO35134 AC140354.1-201ENSMUST00000219499 2425 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Polr1aO35134 Klf3-201ENSMUST00000165536 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Polr1aO35134 Gm20632-201ENSMUST00000176760 2427 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
Polr1aO35134 Pde4b-210ENSMUST00000172616 823 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Polr1aO35134 Gm43758-201ENSMUST00000199500 367 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
Polr1aO35134 Gm45880-201ENSMUST00000213041 853 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
Polr1aO35134 Kitl-204ENSMUST00000218200 564 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Polr1aO35134 Gli1-201ENSMUST00000026474 4057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Polr1aO35134 Gspt2-201ENSMUST00000096368 2491 ntAPPRIS P1 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Polr1aO35134 Htr7-202ENSMUST00000164639 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Polr1aO35134 D930015M05Rik-201ENSMUST00000126002 1190 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Polr1aO35134 Drap1-209ENSMUST00000136579 734 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Polr1aO35134 E130006D01Rik-203ENSMUST00000137398 906 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Polr1aO35134 Olfr284-202ENSMUST00000206647 966 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
Polr1aO35134 Lrch1-205ENSMUST00000228252 3125 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Polr1aO35134 Zfand4-202ENSMUST00000112900 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Polr1aO35134 Sbf1-201ENSMUST00000123791 6190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Polr1aO35134 Tbc1d9-201ENSMUST00000034145 4631 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Polr1aO35134 Cdc37l1-204ENSMUST00000224511 2944 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Polr1aO35134 Smg9-201ENSMUST00000002280 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Polr1aO35134 Tbc1d9b-202ENSMUST00000101270 5213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Polr1aO35134 Sart3-201ENSMUST00000019118 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Polr1aO35134 Fgfr1op2-204ENSMUST00000111663 2880 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Polr1aO35134 Gm6203-201ENSMUST00000209575 1342 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
Polr1aO35134 Cep57-201ENSMUST00000034398 2523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Polr1aO35134 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Polr1aO35134 Arhgef1-218ENSMUST00000206508 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Polr1aO35134 Pdhx-202ENSMUST00000111183 2078 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Polr1aO35134 Pcp2-206ENSMUST00000144977 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Polr1aO35134 Gm16124-201ENSMUST00000146938 516 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Polr1aO35134 Gm38266-201ENSMUST00000194931 421 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
Polr1aO35134 Hax1-207ENSMUST00000198782 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Polr1aO35134 Gm43597-201ENSMUST00000201650 1057 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Polr1aO35134 Exosc7-201ENSMUST00000026891 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Polr1aO35134 Apaf1-208ENSMUST00000162618 5151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Polr1aO35134 Tmbim6-201ENSMUST00000023749 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Polr1aO35134 Zbtb20-202ENSMUST00000114690 2759 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Polr1aO35134 Gpr19-208ENSMUST00000165392 1643 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.02
Polr1aO35134 Gpr19-202ENSMUST00000066107 1647 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Polr1aO35134 Cyb561d1-202ENSMUST00000106654 1914 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Polr1aO35134 2410002F23Rik-218ENSMUST00000188382 2301 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
Polr1aO35134 Rell1-204ENSMUST00000154169 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Polr1aO35134 Wipi1-201ENSMUST00000047186 3338 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Polr1aO35134 Slc22a3-201ENSMUST00000024595 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Polr1aO35134 Rbm26-202ENSMUST00000100327 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Polr1aO35134 Nab1-205ENSMUST00000186764 3640 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
Polr1aO35134 Lrig1-201ENSMUST00000032105 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Polr1aO35134 Yes1-205ENSMUST00000202543 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Polr1aO35134 Gypc-202ENSMUST00000174000 2072 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Polr1aO35134 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Polr1aO35134 Celrr-202ENSMUST00000181433 1561 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Polr1aO35134 Rpl38-204ENSMUST00000106602 371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Polr1aO35134 Fam71f2-201ENSMUST00000115286 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Polr1aO35134 Ecscr-204ENSMUST00000133064 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Polr1aO35134 Pced1c-ps-201ENSMUST00000187740 751 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
Polr1aO35134 Gabarapl1-204ENSMUST00000204956 539 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.4 ms