Protein–RNA interactions for Protein: O35071

Kif1c, Kinesin-like protein KIF1C, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,100 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kif1cO35071 Arl6ip1-201ENSMUST00000032888 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Kif1cO35071 Ankrd34b-203ENSMUST00000168871 3397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Kif1cO35071 Kif3a-201ENSMUST00000057330 2290 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Kif1cO35071 Iws1-201ENSMUST00000025243 9613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Kif1cO35071 Ace-202ENSMUST00000001964 2418 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Kif1cO35071 Cdk2-202ENSMUST00000026416 2406 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Kif1cO35071 Mdga1-201ENSMUST00000073556 7566 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Kif1cO35071 Rerg-203ENSMUST00000119610 890 ntTSL 3 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Kif1cO35071 Gm13616-201ENSMUST00000120600 222 ntBASIC13.78□□□□□ -0.2
Kif1cO35071 Ercc8-202ENSMUST00000120672 1144 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Kif1cO35071 Rpl34-ps1-201ENSMUST00000121998 354 ntBASIC13.78□□□□□ -0.2
Kif1cO35071 1700025N23Rik-201ENSMUST00000186189 915 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Kif1cO35071 Nckipsd-206ENSMUST00000195323 467 ntTSL 3 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Kif1cO35071 Irs3-202ENSMUST00000196511 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Kif1cO35071 Gm45091-201ENSMUST00000205799 504 ntTSL 3 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Kif1cO35071 CT009510.1-201ENSMUST00000227972 270 ntBASIC13.78□□□□□ -0.2
Kif1cO35071 Mrpl20-201ENSMUST00000030942 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Kif1cO35071 March3-201ENSMUST00000035278 860 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Kif1cO35071 Rpl34-ps2-201ENSMUST00000081679 354 ntBASIC13.78□□□□□ -0.2
Kif1cO35071 Gm10154-201ENSMUST00000084445 354 ntBASIC13.78□□□□□ -0.2
Kif1cO35071 Pcna-ps2-201ENSMUST00000088040 1257 ntAPPRIS P1 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Kif1cO35071 Gm34016-201ENSMUST00000222678 1384 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Kif1cO35071 Zbtb20-203ENSMUST00000114691 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Kif1cO35071 Zbtb20-205ENSMUST00000114695 2977 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Kif1cO35071 Arl6-202ENSMUST00000099646 1554 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Kif1cO35071 Ybx1-201ENSMUST00000079644 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Kif1cO35071 Actg1-204ENSMUST00000106215 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Kif1cO35071 Klhl34-201ENSMUST00000087157 1935 ntAPPRIS P1 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Kif1cO35071 Wbscr25-202ENSMUST00000148729 2075 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Kif1cO35071 G3bp2-203ENSMUST00000167918 4232 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Kif1cO35071 P4ha2-201ENSMUST00000019050 2230 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Kif1cO35071 Rragb-201ENSMUST00000039720 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Kif1cO35071 Zfp236-201ENSMUST00000171071 9626 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Kif1cO35071 A530083I20Rik-201ENSMUST00000180486 2421 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Kif1cO35071 Hdac5-203ENSMUST00000107151 4852 ntTSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Kif1cO35071 Nupl1-207ENSMUST00000225311 2475 ntBASIC13.78□□□□□ -0.2
Kif1cO35071 Plcb2-202ENSMUST00000102524 5145 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Kif1cO35071 Vps26a-202ENSMUST00000105447 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Kif1cO35071 Ythdf2-203ENSMUST00000152796 4129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
Kif1cO35071 Eif4g1-205ENSMUST00000115461 5507 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.2
Kif1cO35071 Pitpnm2-205ENSMUST00000161273 6792 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.2
Kif1cO35071 Dcun1d3-203ENSMUST00000106519 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Kif1cO35071 Ntng1-205ENSMUST00000106575 1620 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Kif1cO35071 Acvr1c-203ENSMUST00000112607 1266 ntTSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Kif1cO35071 Tmsb10-203ENSMUST00000114050 570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Kif1cO35071 Pld3-202ENSMUST00000117611 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Kif1cO35071 Tdrd5-201ENSMUST00000121146 3759 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Kif1cO35071 Rasal3-207ENSMUST00000137458 3272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Kif1cO35071 Gm13344-201ENSMUST00000137714 1557 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Kif1cO35071 Gm18889-201ENSMUST00000174284 929 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
Kif1cO35071 Retreg3-201ENSMUST00000017946 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Kif1cO35071 Mir6956-201ENSMUST00000183598 62 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
Kif1cO35071 Gm19461-205ENSMUST00000191207 2566 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Kif1cO35071 Sh2b1-205ENSMUST00000205733 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Kif1cO35071 Ccdc103-201ENSMUST00000021307 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Kif1cO35071 Gm5628-201ENSMUST00000222318 1049 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
Kif1cO35071 Zfyve21-206ENSMUST00000222843 705 ntTSL 3 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Kif1cO35071 Hnrnpa1l2-ps2-201ENSMUST00000022493 963 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
Kif1cO35071 CT025555.1-201ENSMUST00000225901 1217 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
Kif1cO35071 Chodl-201ENSMUST00000023568 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Kif1cO35071 Trem2-201ENSMUST00000024791 1088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Kif1cO35071 Cyp1b1-201ENSMUST00000024894 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Kif1cO35071 Cyb5r1-201ENSMUST00000027726 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Kif1cO35071 Hmgcl-201ENSMUST00000030432 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Kif1cO35071 Pnkp-201ENSMUST00000003044 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Kif1cO35071 Xylb-201ENSMUST00000039610 3383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Kif1cO35071 Otx1-201ENSMUST00000006071 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Kif1cO35071 Ntng1-202ENSMUST00000072596 1620 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Kif1cO35071 Gm10073-201ENSMUST00000073722 496 ntAPPRIS P1 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Kif1cO35071 Rplp1-201ENSMUST00000008036 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Kif1cO35071 Stat3-201ENSMUST00000092671 2927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Kif1cO35071 C530008M17Rik-204ENSMUST00000121160 6921 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Kif1cO35071 Caprin1-201ENSMUST00000028607 6169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Kif1cO35071 Lrp8os2-204ENSMUST00000188737 3078 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Kif1cO35071 Bst1-201ENSMUST00000101237 2856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Kif1cO35071 Ltbp4-201ENSMUST00000038618 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Kif1cO35071 Epb41-208ENSMUST00000105981 5303 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Kif1cO35071 Micu1-204ENSMUST00000165563 2442 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Kif1cO35071 Pik3cd-214ENSMUST00000177654 4765 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Kif1cO35071 Tm9sf1-201ENSMUST00000002391 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Kif1cO35071 Zyg11a-203ENSMUST00000223127 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Kif1cO35071 Syndig1-201ENSMUST00000109934 2081 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Kif1cO35071 Nptn-201ENSMUST00000085651 2024 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Kif1cO35071 Ssbp2-201ENSMUST00000004094 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Kif1cO35071 Pigg-201ENSMUST00000031189 3427 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Kif1cO35071 Dlg4-204ENSMUST00000108589 3271 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Kif1cO35071 Tpi1-205ENSMUST00000172132 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Kif1cO35071 Fbxo34-203ENSMUST00000163324 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Kif1cO35071 Gk5-202ENSMUST00000122383 4455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Kif1cO35071 Sftpb-204ENSMUST00000183018 1490 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Kif1cO35071 Dnmt3b-203ENSMUST00000081628 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Kif1cO35071 Rhbdl1-202ENSMUST00000183929 1349 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Kif1cO35071 Vangl1-201ENSMUST00000029453 6531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Kif1cO35071 Plekhb1-202ENSMUST00000107043 931 ntTSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Kif1cO35071 Gm11788-201ENSMUST00000142520 562 ntTSL 3 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Kif1cO35071 Rprl2-201ENSMUST00000157150 290 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
Kif1cO35071 Runx2os2-201ENSMUST00000161664 818 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Kif1cO35071 Gm17455-201ENSMUST00000164428 855 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Kif1cO35071 Tmprss5-204ENSMUST00000167095 1146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Kif1cO35071 Mir6990-201ENSMUST00000183724 91 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.3 ms