Protein–RNA interactions for Protein: O09005

Degs1, Sphingolipid delta(4)-desaturase DES1, mousemouse

Predictions only

Length 323 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Degs1O09005 Ap4b1-201ENSMUST00000047285 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Degs1O09005 Spg20-204ENSMUST00000118118 3981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Degs1O09005 Zfp707-202ENSMUST00000109967 1703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Degs1O09005 Efnb1-201ENSMUST00000052839 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Degs1O09005 Adprhl1-201ENSMUST00000033825 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Degs1O09005 Tspyl1-201ENSMUST00000061372 3086 ntAPPRIS P1 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Degs1O09005 Gramd1b-201ENSMUST00000045682 7488 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Degs1O09005 Pcdha11-203ENSMUST00000192447 4583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Degs1O09005 Nfkb1-206ENSMUST00000164430 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Degs1O09005 Kpna6-201ENSMUST00000003828 2195 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Degs1O09005 Zfp784-201ENSMUST00000062428 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Degs1O09005 Retreg3-201ENSMUST00000017946 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Degs1O09005 Bicd1-202ENSMUST00000086829 9667 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Degs1O09005 Hdac10-202ENSMUST00000109347 1824 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Degs1O09005 Tpm1-202ENSMUST00000034928 1824 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Degs1O09005 Plagl1-202ENSMUST00000121646 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Degs1O09005 Necab1-201ENSMUST00000041606 4922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Degs1O09005 Snai3-201ENSMUST00000006762 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Degs1O09005 Angel2-202ENSMUST00000066632 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Degs1O09005 Map3k12-201ENSMUST00000023812 5182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Degs1O09005 Trafd1-202ENSMUST00000120784 2425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Degs1O09005 Tcf21-202ENSMUST00000218002 1788 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Degs1O09005 Mtif3-203ENSMUST00000110564 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Degs1O09005 Mtif3-204ENSMUST00000110566 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Degs1O09005 Naa10-203ENSMUST00000114387 979 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Degs1O09005 Hoxb8-203ENSMUST00000168043 1141 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Degs1O09005 Gm28577-201ENSMUST00000176106 741 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Degs1O09005 Retsat-204ENSMUST00000176168 1203 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Degs1O09005 Cyhr1-204ENSMUST00000177359 1110 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Degs1O09005 Ino80dos-204ENSMUST00000188602 678 ntTSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Degs1O09005 Gm29520-201ENSMUST00000191209 1067 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Degs1O09005 Olfr286-202ENSMUST00000205305 969 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Degs1O09005 Psmb5-202ENSMUST00000227257 622 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Degs1O09005 Mfsd1-201ENSMUST00000029344 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Degs1O09005 Nfe2l1-204ENSMUST00000107659 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Degs1O09005 Gm17619-201ENSMUST00000180625 1449 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Degs1O09005 B4galnt1-201ENSMUST00000006914 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Degs1O09005 Yeats2-201ENSMUST00000090052 5997 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Degs1O09005 Dnm1-205ENSMUST00000113365 3257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Degs1O09005 Ppp1r8-201ENSMUST00000030702 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Degs1O09005 Tars2-204ENSMUST00000163530 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Degs1O09005 Krt71-201ENSMUST00000023710 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Degs1O09005 Dennd6b-201ENSMUST00000078953 4607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Degs1O09005 Gpr137-205ENSMUST00000166115 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Degs1O09005 Cdk11b-203ENSMUST00000105600 3170 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.55
Degs1O09005 Casc4-203ENSMUST00000089915 3475 ntTSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.55
Degs1O09005 Heatr3-201ENSMUST00000034079 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Degs1O09005 Grm6-201ENSMUST00000000631 4291 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Degs1O09005 Stxbp2-207ENSMUST00000160708 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Degs1O09005 Slc25a19-212ENSMUST00000178003 2614 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Degs1O09005 Jph3-201ENSMUST00000026357 3637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Degs1O09005 Mtus2-203ENSMUST00000085558 7543 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Degs1O09005 Pgap2-225ENSMUST00000156529 2034 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Degs1O09005 Ush1c-207ENSMUST00000176371 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Degs1O09005 Oser1-202ENSMUST00000104954 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Degs1O09005 Rgs12-202ENSMUST00000087684 4713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Degs1O09005 Nosip-202ENSMUST00000107829 972 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Degs1O09005 Olfr1564-201ENSMUST00000112162 1091 ntAPPRIS P2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Degs1O09005 Gm13597-201ENSMUST00000121239 375 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Degs1O09005 Kctd14-202ENSMUST00000121987 1210 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Degs1O09005 Mpc1-205ENSMUST00000142594 961 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Degs1O09005 Cox6c-205ENSMUST00000156915 606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Degs1O09005 Olfr1344-201ENSMUST00000168341 1061 ntAPPRIS P1 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Degs1O09005 Gm6944-201ENSMUST00000182449 1006 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Degs1O09005 Sox2ot-202ENSMUST00000196058 753 ntTSL 3 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Degs1O09005 Gm5364-201ENSMUST00000216789 889 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Degs1O09005 Prss29-201ENSMUST00000024993 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Degs1O09005 Yif1b-201ENSMUST00000032809 1111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Degs1O09005 Gpr85-201ENSMUST00000060442 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Degs1O09005 Tgif2-201ENSMUST00000073352 2690 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Degs1O09005 Ptprn2-201ENSMUST00000070733 3201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Degs1O09005 Cramp1l-201ENSMUST00000073337 7517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Degs1O09005 Tmc8-202ENSMUST00000106334 2644 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Degs1O09005 Pcyox1-201ENSMUST00000032065 4295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Degs1O09005 Plekhn1-201ENSMUST00000105569 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Degs1O09005 Adra1b-204ENSMUST00000167574 3047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Degs1O09005 Celf4-203ENSMUST00000223704 2492 ntAPPRIS ALT1 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Degs1O09005 Slc9a3-201ENSMUST00000036208 2490 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Degs1O09005 Vdac3-201ENSMUST00000009036 1354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Degs1O09005 Pigg-201ENSMUST00000031189 3427 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Degs1O09005 Phykpl-201ENSMUST00000020625 1609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Degs1O09005 Sem1-201ENSMUST00000041111 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Degs1O09005 Rufy3-203ENSMUST00000196894 3703 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Degs1O09005 Gbe1-207ENSMUST00000171132 3303 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Degs1O09005 Gm17315-201ENSMUST00000181408 2504 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Degs1O09005 Fam221a-202ENSMUST00000121903 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Degs1O09005 Gm5069-201ENSMUST00000050581 1328 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Degs1O09005 Echdc2-201ENSMUST00000052999 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Degs1O09005 Prkcd-207ENSMUST00000112210 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Degs1O09005 Gbf1-201ENSMUST00000026254 6450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Degs1O09005 Samhd1-202ENSMUST00000088523 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Degs1O09005 Six4-202ENSMUST00000175693 6817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Degs1O09005 Nfkbia-201ENSMUST00000021413 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Degs1O09005 Mpped1-203ENSMUST00000109470 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Degs1O09005 Vamp2-201ENSMUST00000021273 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Degs1O09005 Sesn3-201ENSMUST00000034507 1827 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Degs1O09005 Lsm11-202ENSMUST00000129820 6453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Degs1O09005 Ubiad1-201ENSMUST00000051633 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Degs1O09005 Ist1-201ENSMUST00000034164 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Degs1O09005 8430429K09Rik-204ENSMUST00000146456 1675 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40 ms