Protein–RNA interactions for Protein: J3QQ27

Ccdc191, Coiled-coil domain-containing 191, mousemouse

Predictions only

Length 883 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc191J3QQ27 4933433G15Rik-201ENSMUST00000180533 1481 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ccdc191J3QQ27 Gamt-202ENSMUST00000105363 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ccdc191J3QQ27 Zglp1-201ENSMUST00000115494 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ccdc191J3QQ27 Slc38a6-204ENSMUST00000126488 589 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ccdc191J3QQ27 Lgals3-204ENSMUST00000150290 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ccdc191J3QQ27 Grtp1-201ENSMUST00000165605 1271 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ccdc191J3QQ27 Erdr1-202ENSMUST00000177671 708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ccdc191J3QQ27 Ccer2-201ENSMUST00000178767 1054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ccdc191J3QQ27 Ndufb9-201ENSMUST00000022980 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ccdc191J3QQ27 Rab33a-201ENSMUST00000033430 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ccdc191J3QQ27 4931422A03Rik-201ENSMUST00000056170 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ccdc191J3QQ27 Il1rapl2-202ENSMUST00000113063 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ccdc191J3QQ27 Dpysl5-203ENSMUST00000114729 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ccdc191J3QQ27 Lgals8-202ENSMUST00000099821 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ccdc191J3QQ27 Ate1-202ENSMUST00000035458 4685 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ccdc191J3QQ27 Zfp276-201ENSMUST00000001092 4071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ccdc191J3QQ27 Zfp740-201ENSMUST00000118729 4241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ccdc191J3QQ27 Parp16-202ENSMUST00000213396 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ccdc191J3QQ27 Eno1b-201ENSMUST00000076155 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ccdc191J3QQ27 Pgr-201ENSMUST00000070463 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ccdc191J3QQ27 Pgr-202ENSMUST00000098986 3068 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ccdc191J3QQ27 Adal-205ENSMUST00000119031 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ccdc191J3QQ27 AI467606-201ENSMUST00000056288 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ccdc191J3QQ27 Nr4a3-201ENSMUST00000030025 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ccdc191J3QQ27 Samd4b-204ENSMUST00000208199 4391 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ccdc191J3QQ27 Otop2-202ENSMUST00000106544 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ccdc191J3QQ27 Duxf3-202ENSMUST00000176875 2025 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ccdc191J3QQ27 Ntrk2-208ENSMUST00000225583 2719 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Ccdc191J3QQ27 Nr1d1-201ENSMUST00000064941 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ccdc191J3QQ27 Wac-201ENSMUST00000074919 3070 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ccdc191J3QQ27 Oscar-202ENSMUST00000108645 1829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ccdc191J3QQ27 Oscar-201ENSMUST00000039507 1823 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ccdc191J3QQ27 Gm37844-201ENSMUST00000192473 4097 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Ccdc191J3QQ27 Trim68-205ENSMUST00000210855 2301 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ccdc191J3QQ27 Gli2-201ENSMUST00000062483 6637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ccdc191J3QQ27 Dis3l-203ENSMUST00000120760 3661 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ccdc191J3QQ27 Fam53b-204ENSMUST00000106165 1232 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ccdc191J3QQ27 Fam53b-205ENSMUST00000106166 1270 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ccdc191J3QQ27 Yif1b-203ENSMUST00000108238 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ccdc191J3QQ27 Gm26620-201ENSMUST00000180542 817 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ccdc191J3QQ27 Mir124-2hg-206ENSMUST00000189754 525 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ccdc191J3QQ27 Prrt3-202ENSMUST00000204134 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ccdc191J3QQ27 Rassf5-201ENSMUST00000027688 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ccdc191J3QQ27 Disp1-205ENSMUST00000195372 4901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ccdc191J3QQ27 Ccdc151-201ENSMUST00000044926 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ccdc191J3QQ27 Gm14371-201ENSMUST00000138925 1518 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Ccdc191J3QQ27 Emc7-201ENSMUST00000069747 5826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ccdc191J3QQ27 Nr4a2-203ENSMUST00000112629 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ccdc191J3QQ27 B3gat1-206ENSMUST00000161431 3858 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ccdc191J3QQ27 Acat3-201ENSMUST00000043923 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ccdc191J3QQ27 Stra8-203ENSMUST00000114999 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ccdc191J3QQ27 Strip2-201ENSMUST00000046028 5370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ccdc191J3QQ27 Teddm2-202ENSMUST00000123490 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ccdc191J3QQ27 Blvrb-204ENSMUST00000133750 509 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ccdc191J3QQ27 U2af1l4-216ENSMUST00000166510 835 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ccdc191J3QQ27 Lyzl6-201ENSMUST00000021328 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ccdc191J3QQ27 Pdgfc-201ENSMUST00000029652 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ccdc191J3QQ27 Slc22a20-201ENSMUST00000041827 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ccdc191J3QQ27 Aurkaip1-201ENSMUST00000084097 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ccdc191J3QQ27 Spr-ps1-201ENSMUST00000089584 605 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Ccdc191J3QQ27 Dst-213ENSMUST00000183302 8788 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ccdc191J3QQ27 Gm43156-201ENSMUST00000202338 2127 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ccdc191J3QQ27 Ap2a1-203ENSMUST00000166972 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ccdc191J3QQ27 Slc4a5-201ENSMUST00000039212 5123 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ccdc191J3QQ27 Hapln4-201ENSMUST00000007738 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ccdc191J3QQ27 Gm13294-201ENSMUST00000121757 1330 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Ccdc191J3QQ27 Fut9-202ENSMUST00000108199 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ccdc191J3QQ27 Dhx57-201ENSMUST00000038166 4918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ccdc191J3QQ27 Oser1-202ENSMUST00000104954 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ccdc191J3QQ27 Ptcd2-201ENSMUST00000022153 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ccdc191J3QQ27 Acox3-204ENSMUST00000114238 2825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ccdc191J3QQ27 Gm34376-201ENSMUST00000218529 2107 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ccdc191J3QQ27 Gm42688-201ENSMUST00000101253 3628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ccdc191J3QQ27 A230077H06Rik-201ENSMUST00000188579 2918 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ccdc191J3QQ27 Prrxl1-202ENSMUST00000186452 2371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ccdc191J3QQ27 Il6ra-201ENSMUST00000029559 3343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ccdc191J3QQ27 Atpaf2-201ENSMUST00000108721 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ccdc191J3QQ27 Rbbp7-201ENSMUST00000033720 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ccdc191J3QQ27 Scyl3-201ENSMUST00000027876 4368 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ccdc191J3QQ27 Twf1-201ENSMUST00000023087 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ccdc191J3QQ27 Klhl12-201ENSMUST00000027725 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ccdc191J3QQ27 Apip-201ENSMUST00000011055 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ccdc191J3QQ27 Znhit1-204ENSMUST00000111091 1070 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ccdc191J3QQ27 4933405L10Rik-201ENSMUST00000013302 1214 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ccdc191J3QQ27 Gm37230-201ENSMUST00000194491 818 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Ccdc191J3QQ27 Dcdc2c-201ENSMUST00000020963 1041 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ccdc191J3QQ27 Klk14-201ENSMUST00000056329 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ccdc191J3QQ27 Glud1-201ENSMUST00000022322 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ccdc191J3QQ27 1700037C18Rik-202ENSMUST00000115859 2592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ccdc191J3QQ27 Leo1-201ENSMUST00000048937 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ccdc191J3QQ27 Ccdc24-201ENSMUST00000106422 1365 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ccdc191J3QQ27 Zpbp2-204ENSMUST00000107511 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ccdc191J3QQ27 Adamts20-204ENSMUST00000155907 6886 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ccdc191J3QQ27 Atp4b-201ENSMUST00000033826 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ccdc191J3QQ27 Myef2-207ENSMUST00000147105 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Ccdc191J3QQ27 Susd2-201ENSMUST00000077610 2275 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Ccdc191J3QQ27 Dlst-201ENSMUST00000053811 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Ccdc191J3QQ27 Lrig2-205ENSMUST00000198332 3946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Ccdc191J3QQ27 Sgo2a-201ENSMUST00000027202 4939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Ccdc191J3QQ27 Gnai1-201ENSMUST00000074694 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.4 ms