Protein–RNA interactions for Protein: J3QQ23

Gm21310, Predicted gene, 21310, mousemouse

Predictions only

Length 232 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm21310J3QQ23 Nphs2-201ENSMUST00000027896 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Gm21310J3QQ23 Cep164-201ENSMUST00000117194 5541 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Gm21310J3QQ23 Asb3-206ENSMUST00000203878 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Gm21310J3QQ23 Llgl2-212ENSMUST00000177736 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Gm21310J3QQ23 Gas7-201ENSMUST00000041611 2968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Gm21310J3QQ23 Gtf2i-206ENSMUST00000172715 4114 ntTSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Gm21310J3QQ23 P2rx6-201ENSMUST00000023441 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Gm21310J3QQ23 Kif1c-202ENSMUST00000094499 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Gm21310J3QQ23 Tecpr1-201ENSMUST00000085701 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Gm21310J3QQ23 Zyg11a-203ENSMUST00000223127 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Gm21310J3QQ23 4933416C03Rik-201ENSMUST00000099261 2254 ntAPPRIS P1 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Gm21310J3QQ23 Prss36-201ENSMUST00000094026 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Gm21310J3QQ23 Ctbp1-212ENSMUST00000202962 3595 ntTSL 2 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Gm21310J3QQ23 Slc19a2-201ENSMUST00000044021 3571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Gm21310J3QQ23 Spsb1-203ENSMUST00000105685 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Gm21310J3QQ23 Gm26547-201ENSMUST00000181186 1508 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Gm21310J3QQ23 Map10-201ENSMUST00000053078 3542 ntAPPRIS P1 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Gm21310J3QQ23 Gm10305-201ENSMUST00000195331 2475 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
Gm21310J3QQ23 Tdrp-201ENSMUST00000062613 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Gm21310J3QQ23 H2-T23-201ENSMUST00000102678 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Gm21310J3QQ23 Hnrnpa1-201ENSMUST00000036004 1918 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Gm21310J3QQ23 Kifc3-202ENSMUST00000169353 2898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Gm21310J3QQ23 Kif1c-204ENSMUST00000137119 6596 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Gm21310J3QQ23 Prkca-202ENSMUST00000100302 2265 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Gm21310J3QQ23 Map7d1-202ENSMUST00000106132 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Gm21310J3QQ23 Gm20708-201ENSMUST00000132298 1780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Gm21310J3QQ23 1500011B03Rik-202ENSMUST00000112160 1333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Gm21310J3QQ23 Cyp26b1-203ENSMUST00000204109 1340 ntTSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Gm21310J3QQ23 Lcat-201ENSMUST00000038896 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Gm21310J3QQ23 Prdm5-202ENSMUST00000031976 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Gm21310J3QQ23 Eef1d-204ENSMUST00000089681 2152 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Gm21310J3QQ23 Zkscan8-202ENSMUST00000110481 728 ntTSL 2 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Gm21310J3QQ23 Gm15565-201ENSMUST00000118890 427 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
Gm21310J3QQ23 4930412M03Rik-201ENSMUST00000130746 1111 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Gm21310J3QQ23 A930006K02Rik-201ENSMUST00000149172 776 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Gm21310J3QQ23 Cabp2-205ENSMUST00000162908 911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Gm21310J3QQ23 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Gm21310J3QQ23 Gm9182-201ENSMUST00000217829 639 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
Gm21310J3QQ23 Mrpl28-201ENSMUST00000025014 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Gm21310J3QQ23 Slc25a43-201ENSMUST00000047655 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Gm21310J3QQ23 Ahnak-201ENSMUST00000092955 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Gm21310J3QQ23 Cops9-201ENSMUST00000097642 438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Gm21310J3QQ23 Serf2-201ENSMUST00000099475 525 ntTSL 2 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Gm21310J3QQ23 Dlgap3-203ENSMUST00000106094 4207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Gm21310J3QQ23 Guca1b-201ENSMUST00000024774 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Gm21310J3QQ23 Ifi47-201ENSMUST00000046704 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Gm21310J3QQ23 Cfap69-201ENSMUST00000054865 4956 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Gm21310J3QQ23 Cmpk2-201ENSMUST00000020969 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Gm21310J3QQ23 Cggbp1-201ENSMUST00000067744 4425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Gm21310J3QQ23 Gm26688-201ENSMUST00000181176 1568 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Gm21310J3QQ23 Ankrd13c-201ENSMUST00000040787 3903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
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Gm21310J3QQ23 Nwd2-201ENSMUST00000159584 8534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Gm21310J3QQ23 Gm853-201ENSMUST00000023884 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Gm21310J3QQ23 Ggn-202ENSMUST00000098609 2653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Gm21310J3QQ23 Car7-201ENSMUST00000056051 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Gm21310J3QQ23 Lingo1-202ENSMUST00000114247 2287 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Gm21310J3QQ23 Susd2-201ENSMUST00000077610 2275 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Gm21310J3QQ23 Obsl1-201ENSMUST00000113565 3379 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
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Gm21310J3QQ23 Wrap53-201ENSMUST00000048139 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Gm21310J3QQ23 Cbarp-214ENSMUST00000169546 2980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
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Gm21310J3QQ23 Jazf1-201ENSMUST00000074541 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Gm21310J3QQ23 Pitx2-206ENSMUST00000174623 1493 ntTSL 2 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Gm21310J3QQ23 Ptn-202ENSMUST00000201321 2558 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Gm21310J3QQ23 Angel2-203ENSMUST00000110899 3673 ntTSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Gm21310J3QQ23 Rhot1-204ENSMUST00000092857 3687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Gm21310J3QQ23 Mknk1-201ENSMUST00000019677 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Gm21310J3QQ23 Olfr322-202ENSMUST00000213232 4632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Gm21310J3QQ23 Atp8a1-201ENSMUST00000037380 8178 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Gm21310J3QQ23 Gm26604-201ENSMUST00000180926 1766 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Gm21310J3QQ23 Il20ra-201ENSMUST00000020185 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Gm21310J3QQ23 Hist1h2be-202ENSMUST00000091704 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Gm21310J3QQ23 Necab1-201ENSMUST00000041606 4922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Gm21310J3QQ23 Dpp6-201ENSMUST00000071500 3826 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Gm21310J3QQ23 Gm14752-201ENSMUST00000120719 2075 ntBASIC11.18□□□□□ -0.62
Gm21310J3QQ23 Pqbp1-202ENSMUST00000115654 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Gm21310J3QQ23 G2e3-201ENSMUST00000054308 6803 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Gm21310J3QQ23 4833439L19Rik-201ENSMUST00000026989 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Gm21310J3QQ23 Men1-202ENSMUST00000078137 2738 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Gm21310J3QQ23 Zfp142-203ENSMUST00000113737 7473 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Gm21310J3QQ23 Ctdspl2-204ENSMUST00000110578 3386 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Gm21310J3QQ23 Mok-202ENSMUST00000070565 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Gm21310J3QQ23 Mau2-202ENSMUST00000168013 5323 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Gm21310J3QQ23 Marveld3-201ENSMUST00000001722 1330 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Gm21310J3QQ23 Mtg2-201ENSMUST00000087563 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Gm21310J3QQ23 Dolpp1-202ENSMUST00000113612 1958 ntTSL 3 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Gm21310J3QQ23 Zfp629-207ENSMUST00000134446 670 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Gm21310J3QQ23 Gm13496-201ENSMUST00000141133 1165 ntTSL 2 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Gm21310J3QQ23 Erdr1-203ENSMUST00000179077 887 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Gm21310J3QQ23 D530014G21Rik-201ENSMUST00000208416 587 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Gm21310J3QQ23 Fgf8-201ENSMUST00000026240 1117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Gm21310J3QQ23 Neurl2-201ENSMUST00000042775 1014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Gm21310J3QQ23 Zc3h4-201ENSMUST00000098789 6039 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Gm21310J3QQ23 Acox3-204ENSMUST00000114238 2825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Gm21310J3QQ23 Ly9-202ENSMUST00000068878 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Gm21310J3QQ23 Snph-202ENSMUST00000094456 4607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Gm21310J3QQ23 Zfp707-201ENSMUST00000109966 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Gm21310J3QQ23 Nol10-201ENSMUST00000046011 3021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
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