Protein–RNA interactions for Protein: J3QNN2

Gm21976, Predicted gene 21976, mousemouse

Predictions only

Length 249 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm21976J3QNN2 Smarcc1-204ENSMUST00000197984 3538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Gm21976J3QNN2 Nedd4l-202ENSMUST00000163516 8163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.28
Gm21976J3QNN2 Mypn-202ENSMUST00000218978 1833 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Gm21976J3QNN2 Dnajc28-201ENSMUST00000049244 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Gm21976J3QNN2 Atxn7-202ENSMUST00000223714 2954 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.27□□□□□ -0.28
Gm21976J3QNN2 Sirpa-203ENSMUST00000103202 3982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Gm21976J3QNN2 Slc30a2-201ENSMUST00000081094 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Gm21976J3QNN2 4921514A10Rik-201ENSMUST00000181450 2114 ntTSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.28
Gm21976J3QNN2 Sybu-201ENSMUST00000090057 3230 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Gm21976J3QNN2 AC168058.1-201ENSMUST00000219521 2282 ntBASIC13.27□□□□□ -0.28
Gm21976J3QNN2 Gm2762-202ENSMUST00000201517 2339 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Gm21976J3QNN2 Tbx3-202ENSMUST00000079719 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Gm21976J3QNN2 Nt5c2-202ENSMUST00000168536 3769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Gm21976J3QNN2 Gm11524-201ENSMUST00000119349 807 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
Gm21976J3QNN2 Gm15948-201ENSMUST00000150616 403 ntTSL 3 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Gm21976J3QNN2 Fbxw4-209ENSMUST00000162433 789 ntTSL 3 BASIC13.27□□□□□ -0.29
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Gm21976J3QNN2 Gm18187-201ENSMUST00000196476 984 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
Gm21976J3QNN2 Hddc3-208ENSMUST00000206122 696 ntTSL 3 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Gm21976J3QNN2 Ccdc159-204ENSMUST00000216710 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Gm21976J3QNN2 Ngf-201ENSMUST00000035952 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Gm21976J3QNN2 Tex13c3-201ENSMUST00000089246 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Gm21976J3QNN2 Chfr-207ENSMUST00000198633 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Gm21976J3QNN2 AI849053-201ENSMUST00000181021 2658 ntTSL 3 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Gm21976J3QNN2 Slco3a1-202ENSMUST00000098371 2709 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Gm21976J3QNN2 Braf-201ENSMUST00000002487 9728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Gm21976J3QNN2 Sec14l1-201ENSMUST00000021177 2866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Gm21976J3QNN2 Kdr-201ENSMUST00000113516 5924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Gm21976J3QNN2 Tor1b-201ENSMUST00000028199 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Gm21976J3QNN2 Kcnq1-202ENSMUST00000185383 1535 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Gm21976J3QNN2 C130080G10Rik-203ENSMUST00000154140 1564 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Gm21976J3QNN2 Rgs20-201ENSMUST00000002533 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Gm21976J3QNN2 Vangl2-201ENSMUST00000027837 5698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Gm21976J3QNN2 Atat1-201ENSMUST00000056034 1930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Gm21976J3QNN2 Gm12620-201ENSMUST00000119791 1986 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
Gm21976J3QNN2 Gm12612-201ENSMUST00000140182 1986 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
Gm21976J3QNN2 Nsmce3-201ENSMUST00000094331 5946 ntAPPRIS P1 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Gm21976J3QNN2 Trp73-201ENSMUST00000097762 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Gm21976J3QNN2 Muc20-201ENSMUST00000041123 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Gm21976J3QNN2 Scarf1-202ENSMUST00000118243 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Gm21976J3QNN2 Tmtc3-202ENSMUST00000099318 2794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Gm21976J3QNN2 Rnf138-201ENSMUST00000052396 3110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Gm21976J3QNN2 Slc6a9-201ENSMUST00000030269 3479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Gm21976J3QNN2 Pdcl3-201ENSMUST00000027247 3914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Gm21976J3QNN2 Wipi2-201ENSMUST00000036872 5171 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Gm21976J3QNN2 Arhgef18-201ENSMUST00000004684 5271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Gm21976J3QNN2 Alkbh4-202ENSMUST00000100568 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Gm21976J3QNN2 Mir698-201ENSMUST00000102164 109 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
Gm21976J3QNN2 Plod1-202ENSMUST00000105712 1059 ntTSL 2 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Gm21976J3QNN2 Galnt18-202ENSMUST00000106663 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Gm21976J3QNN2 Crybb2-202ENSMUST00000112336 906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Gm21976J3QNN2 Eogt-202ENSMUST00000113387 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Gm21976J3QNN2 Snrnp27-202ENSMUST00000113683 1005 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Gm21976J3QNN2 Slc6a8-203ENSMUST00000114465 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
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Gm21976J3QNN2 Wdr74-201ENSMUST00000049424 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Gm21976J3QNN2 Ntf3-201ENSMUST00000050484 1483 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Gm21976J3QNN2 Wdyhv1-201ENSMUST00000067563 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Gm21976J3QNN2 Nanos3-201ENSMUST00000070102 730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Gm21976J3QNN2 Ctnnb1-201ENSMUST00000007130 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Gm21976J3QNN2 Slc12a5-201ENSMUST00000099092 6028 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Gm21976J3QNN2 Pds5b-208ENSMUST00000202170 6598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Gm21976J3QNN2 Fen1-204ENSMUST00000156291 2373 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Gm21976J3QNN2 Tmem116-204ENSMUST00000111795 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Gm21976J3QNN2 Isoc2a-201ENSMUST00000125249 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Gm21976J3QNN2 Cpne6-201ENSMUST00000074225 2201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Gm21976J3QNN2 Gnas-210ENSMUST00000109095 2059 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Gm21976J3QNN2 Arid4b-204ENSMUST00000110536 5783 ntTSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Gm21976J3QNN2 Gm38102-201ENSMUST00000192791 1935 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
Gm21976J3QNN2 Il11-201ENSMUST00000094892 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Gm21976J3QNN2 Gpc5-201ENSMUST00000022707 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Gm21976J3QNN2 Ncoa1-201ENSMUST00000085814 7329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Gm21976J3QNN2 Kcnq2-202ENSMUST00000049792 2920 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Gm21976J3QNN2 Tmem86b-202ENSMUST00000205360 1344 ntTSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Gm21976J3QNN2 Shf-202ENSMUST00000110530 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Gm21976J3QNN2 Gm12960-201ENSMUST00000120017 1066 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
Gm21976J3QNN2 Meg3-208ENSMUST00000143847 706 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Gm21976J3QNN2 Cpne8-201ENSMUST00000014777 697 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Gm21976J3QNN2 Ucma-204ENSMUST00000167607 785 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Gm21976J3QNN2 Gm8584-201ENSMUST00000171982 758 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
Gm21976J3QNN2 Gm9002-201ENSMUST00000178437 499 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
Gm21976J3QNN2 Asb1-205ENSMUST00000188081 1272 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Gm21976J3QNN2 Gm29417-201ENSMUST00000188160 571 ntTSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Gm21976J3QNN2 Asb1-206ENSMUST00000188879 1299 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Gm21976J3QNN2 Gm11149-204ENSMUST00000216483 1275 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
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Gm21976J3QNN2 AC192088.1-201ENSMUST00000227561 301 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34 ms