Protein–RNA interactions for Protein: J3QNE4

Ccdc180, Coiled-coil domain-containing 180, mousemouse

Predictions only

Length 1,664 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc180J3QNE4 Zfp90-203ENSMUST00000212606 2685 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Ccdc180J3QNE4 Gm13730-201ENSMUST00000121036 1462 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
Ccdc180J3QNE4 Ppp1r18-204ENSMUST00000144382 2536 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Ccdc180J3QNE4 Sybu-201ENSMUST00000090057 3230 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Ccdc180J3QNE4 Pdcl3-201ENSMUST00000027247 3914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Ccdc180J3QNE4 Zbtb33-202ENSMUST00000115142 2567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Ccdc180J3QNE4 Glis1-202ENSMUST00000106738 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.67
Ccdc180J3QNE4 Gm13886-201ENSMUST00000117876 1183 ntBASIC25.45■■□□□ 1.67
Ccdc180J3QNE4 Rps2-ps9-201ENSMUST00000121414 817 ntBASIC25.45■■□□□ 1.67
Ccdc180J3QNE4 Gm26927-201ENSMUST00000182385 965 ntBASIC25.45■■□□□ 1.67
Ccdc180J3QNE4 Gm38002-201ENSMUST00000193255 180 ntBASIC25.45■■□□□ 1.67
Ccdc180J3QNE4 Gm38671-201ENSMUST00000200573 130 ntBASIC25.45■■□□□ 1.67
Ccdc180J3QNE4 Spata33-205ENSMUST00000212523 486 ntTSL 3 BASIC25.45■■□□□ 1.67
Ccdc180J3QNE4 Gm18934-201ENSMUST00000216671 1044 ntBASIC25.45■■□□□ 1.67
Ccdc180J3QNE4 Mrto4-ps1-201ENSMUST00000220565 721 ntBASIC25.45■■□□□ 1.67
Ccdc180J3QNE4 Prss2-201ENSMUST00000070380 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
Ccdc180J3QNE4 Gm45133-201ENSMUST00000207548 2773 ntBASIC25.45■■□□□ 1.67
Ccdc180J3QNE4 Chtf18-201ENSMUST00000048054 3214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
Ccdc180J3QNE4 Arhgef2-202ENSMUST00000107510 4390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
Ccdc180J3QNE4 Gjd2-201ENSMUST00000090275 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
Ccdc180J3QNE4 Mis12-201ENSMUST00000048807 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Ccdc180J3QNE4 Ap1s2-202ENSMUST00000069041 2226 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Ccdc180J3QNE4 Ttc13-210ENSMUST00000214828 3301 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
Ccdc180J3QNE4 Foxq1-201ENSMUST00000042118 4843 ntAPPRIS P1 BASIC25.45■■□□□ 1.66
Ccdc180J3QNE4 Rgs6-216ENSMUST00000200911 2626 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Ccdc180J3QNE4 Gm15317-201ENSMUST00000129569 699 ntTSL 3 BASIC25.45■■□□□ 1.66
Ccdc180J3QNE4 6030498E09Rik-202ENSMUST00000168144 510 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
Ccdc180J3QNE4 Gm27682-201ENSMUST00000183930 110 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
Ccdc180J3QNE4 Psmc3ip-201ENSMUST00000019447 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Ccdc180J3QNE4 Gm7172-201ENSMUST00000218047 1152 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
Ccdc180J3QNE4 Lsm7-208ENSMUST00000220225 1129 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Ccdc180J3QNE4 Cox7a2-201ENSMUST00000034881 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Ccdc180J3QNE4 Fxyd1-202ENSMUST00000071697 522 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.45■■□□□ 1.66
Ccdc180J3QNE4 Wbp2-201ENSMUST00000074628 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Ccdc180J3QNE4 Gm5620-201ENSMUST00000077991 1348 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
Ccdc180J3QNE4 Gstt3-201ENSMUST00000001715 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Ccdc180J3QNE4 Klhl26-202ENSMUST00000166976 2734 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Ccdc180J3QNE4 Oprm1-214ENSMUST00000105605 1503 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Ccdc180J3QNE4 Oprm1-201ENSMUST00000000783 1500 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Ccdc180J3QNE4 Map2k7-211ENSMUST00000145165 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Ccdc180J3QNE4 Neil1-203ENSMUST00000190245 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Ccdc180J3QNE4 Ppt2-210ENSMUST00000171376 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Ccdc180J3QNE4 Fars2-208ENSMUST00000224611 1750 ntAPPRIS P1 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Ccdc180J3QNE4 Tex13c2-201ENSMUST00000197237 1834 ntAPPRIS P1 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Ccdc180J3QNE4 Gm5187-201ENSMUST00000117317 991 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
Ccdc180J3QNE4 Gm15948-201ENSMUST00000150616 403 ntTSL 3 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Ccdc180J3QNE4 Cebpe-201ENSMUST00000064290 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Ccdc180J3QNE4 Bcor-206ENSMUST00000124033 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Ccdc180J3QNE4 Tchp-201ENSMUST00000094441 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Ccdc180J3QNE4 Mbd6-201ENSMUST00000026476 4165 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Ccdc180J3QNE4 Trip4-201ENSMUST00000117083 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Ccdc180J3QNE4 Srp68-202ENSMUST00000106425 2330 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
Ccdc180J3QNE4 Ikzf1-203ENSMUST00000065433 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
Ccdc180J3QNE4 Gm42420-201ENSMUST00000126621 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.43■■□□□ 1.66
Ccdc180J3QNE4 Ppm1h-208ENSMUST00000162969 811 ntTSL 3 BASIC25.43■■□□□ 1.66
Ccdc180J3QNE4 Dnm3os-203ENSMUST00000185878 557 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
Ccdc180J3QNE4 Gm5069-202ENSMUST00000192714 1011 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
Ccdc180J3QNE4 Car5a-201ENSMUST00000057653 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Ccdc180J3QNE4 Ppt2-209ENSMUST00000171121 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
Ccdc180J3QNE4 Hacd4-201ENSMUST00000030221 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Ccdc180J3QNE4 Fam189b-203ENSMUST00000119707 2415 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
Ccdc180J3QNE4 Hoxb8-201ENSMUST00000052650 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Ccdc180J3QNE4 Kbtbd2-202ENSMUST00000114323 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Ccdc180J3QNE4 Strap-201ENSMUST00000064910 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Ccdc180J3QNE4 Tcf4-258ENSMUST00000202937 2103 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
Ccdc180J3QNE4 Fam171b-201ENSMUST00000051454 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Ccdc180J3QNE4 Npnt-204ENSMUST00000117164 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Ccdc180J3QNE4 Tesmin-202ENSMUST00000127142 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Ccdc180J3QNE4 Gm10339-203ENSMUST00000225409 1671 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
Ccdc180J3QNE4 Gm12537-201ENSMUST00000119266 1002 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
Ccdc180J3QNE4 Gm12070-201ENSMUST00000119551 1002 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
Ccdc180J3QNE4 Gm12671-201ENSMUST00000119978 1002 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
Ccdc180J3QNE4 Gm13292-201ENSMUST00000120014 1000 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
Ccdc180J3QNE4 Gm12403-201ENSMUST00000121384 959 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
Ccdc180J3QNE4 Glo1-202ENSMUST00000167624 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Ccdc180J3QNE4 Gm7029-201ENSMUST00000173226 450 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
Ccdc180J3QNE4 Smco4-202ENSMUST00000178999 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Ccdc180J3QNE4 Gm10359-201ENSMUST00000180167 1002 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
Ccdc180J3QNE4 Gm12033-201ENSMUST00000180654 1002 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
Ccdc180J3QNE4 Gm5559-201ENSMUST00000180755 1002 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
Ccdc180J3QNE4 Gm4335-201ENSMUST00000182581 1004 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
Ccdc180J3QNE4 2810047C21Rik1-202ENSMUST00000210322 1179 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Ccdc180J3QNE4 Smco4-201ENSMUST00000045620 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Ccdc180J3QNE4 Coro6-203ENSMUST00000079770 1298 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Ccdc180J3QNE4 Dsg2-202ENSMUST00000120102 3590 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Ccdc180J3QNE4 Pcsk5-202ENSMUST00000050715 5783 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Ccdc180J3QNE4 Kcnj8-202ENSMUST00000203945 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Ccdc180J3QNE4 Vcan-205ENSMUST00000159337 2273 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Ccdc180J3QNE4 Map7d1-203ENSMUST00000122129 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Ccdc180J3QNE4 Gm6159-201ENSMUST00000191249 1724 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
Ccdc180J3QNE4 Pomgnt1-202ENSMUST00000106496 2613 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Ccdc180J3QNE4 Eif3f-201ENSMUST00000033342 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Ccdc180J3QNE4 Pdss2-202ENSMUST00000159139 1467 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Ccdc180J3QNE4 Aip-202ENSMUST00000117831 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Ccdc180J3QNE4 Ypel3-202ENSMUST00000106356 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Ccdc180J3QNE4 Gm29649-201ENSMUST00000185649 419 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
Ccdc180J3QNE4 4930502C17Rik-201ENSMUST00000200282 948 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
Ccdc180J3QNE4 Gm40466-201ENSMUST00000212174 422 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
Ccdc180J3QNE4 Il27-201ENSMUST00000058429 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Ccdc180J3QNE4 Tldc2-201ENSMUST00000099140 608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.2 ms