Protein–RNA interactions for Protein: J3QMY9

Top6bl, Type 2 DNA topoisomerase 6 subunit B-like, mousemouse

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Length 579 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Top6blJ3QMY9 Dusp15-203ENSMUST00000123121 2993 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.83□□□□□ -0.03
Top6blJ3QMY9 Sh2b1-205ENSMUST00000205733 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Top6blJ3QMY9 Otud6b-201ENSMUST00000117268 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Top6blJ3QMY9 Hmgb3-201ENSMUST00000015361 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Top6blJ3QMY9 1500015A07Rik-201ENSMUST00000184181 1865 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
Top6blJ3QMY9 Ins2-205ENSMUST00000105933 552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Top6blJ3QMY9 Ins2-206ENSMUST00000105934 480 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Top6blJ3QMY9 Crip3-202ENSMUST00000113465 1035 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Top6blJ3QMY9 Dancr-202ENSMUST00000120364 575 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Top6blJ3QMY9 4930417O22Rik-201ENSMUST00000123249 1184 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Top6blJ3QMY9 Rpl27a-203ENSMUST00000143107 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Top6blJ3QMY9 Ly6f-202ENSMUST00000189654 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Top6blJ3QMY9 Gm29667-201ENSMUST00000190817 490 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
Top6blJ3QMY9 9430085M18Rik-201ENSMUST00000198824 1178 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Top6blJ3QMY9 Cxcl17-202ENSMUST00000200880 760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Top6blJ3QMY9 Dctn6-201ENSMUST00000033913 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Top6blJ3QMY9 S100a13-201ENSMUST00000048138 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Top6blJ3QMY9 Cxcl17-201ENSMUST00000074040 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Top6blJ3QMY9 P4hb-201ENSMUST00000026122 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Top6blJ3QMY9 Gm5478-201ENSMUST00000100184 2566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Top6blJ3QMY9 Crem-201ENSMUST00000025069 2931 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Top6blJ3QMY9 Psmc3-202ENSMUST00000067663 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Top6blJ3QMY9 Mapk7-202ENSMUST00000101085 3254 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Top6blJ3QMY9 Pfkfb3-205ENSMUST00000114845 1971 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Top6blJ3QMY9 Gm26565-201ENSMUST00000181642 1968 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
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Top6blJ3QMY9 Gm6263-201ENSMUST00000120029 1342 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
Top6blJ3QMY9 Fam8a1-201ENSMUST00000099547 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Top6blJ3QMY9 Morn1-201ENSMUST00000030915 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Top6blJ3QMY9 Syne3-201ENSMUST00000067005 5097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Top6blJ3QMY9 Hipk3-202ENSMUST00000111124 4125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Top6blJ3QMY9 Cdk2-202ENSMUST00000026416 2406 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Top6blJ3QMY9 Ppp2r1a-201ENSMUST00000007708 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Top6blJ3QMY9 Fgfr3-203ENSMUST00000114411 4225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Top6blJ3QMY9 Fgfr2-207ENSMUST00000117872 4223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Top6blJ3QMY9 Hes2-201ENSMUST00000030782 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Top6blJ3QMY9 Gm5934-201ENSMUST00000120734 2588 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Top6blJ3QMY9 Zfp410-201ENSMUST00000045931 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Top6blJ3QMY9 Acbd5-215ENSMUST00000228050 4804 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Top6blJ3QMY9 Bag6-202ENSMUST00000166426 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Top6blJ3QMY9 Abhd15-201ENSMUST00000094004 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Top6blJ3QMY9 Txndc11-202ENSMUST00000118362 4248 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Top6blJ3QMY9 Dnmt3b-202ENSMUST00000072997 4208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Top6blJ3QMY9 Cyp2d11-201ENSMUST00000170255 1590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Top6blJ3QMY9 Mmp14-206ENSMUST00000225641 3238 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
Top6blJ3QMY9 Tfap2c-201ENSMUST00000030391 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Top6blJ3QMY9 Nsd3-204ENSMUST00000139966 5261 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Top6blJ3QMY9 Cep295nl-202ENSMUST00000168100 1602 ntAPPRIS P1 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Top6blJ3QMY9 Wls-205ENSMUST00000198878 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Top6blJ3QMY9 A230077H06Rik-201ENSMUST00000188579 2918 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Top6blJ3QMY9 Chit1-201ENSMUST00000086475 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Top6blJ3QMY9 Rgs19-203ENSMUST00000108771 1110 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Top6blJ3QMY9 Rgs19-205ENSMUST00000108776 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Top6blJ3QMY9 Gm14493-201ENSMUST00000141174 543 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Top6blJ3QMY9 1700029H14Rik-204ENSMUST00000151400 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Top6blJ3QMY9 Timm13-201ENSMUST00000020440 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Top6blJ3QMY9 AC125206.2-201ENSMUST00000217454 574 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
Top6blJ3QMY9 Reep6-201ENSMUST00000040081 850 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Top6blJ3QMY9 Prss38-201ENSMUST00000061481 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Top6blJ3QMY9 Rnf151-201ENSMUST00000008626 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Top6blJ3QMY9 Ankrd10-202ENSMUST00000169782 5156 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Top6blJ3QMY9 Gpt-201ENSMUST00000023203 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Top6blJ3QMY9 Traf2-201ENSMUST00000028311 3044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Top6blJ3QMY9 Ttyh2-201ENSMUST00000045779 3486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Top6blJ3QMY9 Smg9-201ENSMUST00000002280 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Top6blJ3QMY9 Repin1-201ENSMUST00000009420 3145 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
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Top6blJ3QMY9 Taco1-201ENSMUST00000002048 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Top6blJ3QMY9 Pde8a-201ENSMUST00000026672 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Top6blJ3QMY9 Tomm6os-201ENSMUST00000155812 2944 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Top6blJ3QMY9 A930033H14Rik-201ENSMUST00000170048 2969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Top6blJ3QMY9 Lrp11-203ENSMUST00000130590 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Top6blJ3QMY9 Eml5-210ENSMUST00000223282 7595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Top6blJ3QMY9 Ywhag-205ENSMUST00000198270 1610 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Top6blJ3QMY9 Ankrd6-202ENSMUST00000084748 4354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Top6blJ3QMY9 Cdkn1b-201ENSMUST00000003115 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Top6blJ3QMY9 Rdm1-201ENSMUST00000010506 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Top6blJ3QMY9 Crybb3-203ENSMUST00000118226 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Top6blJ3QMY9 Gm15321-201ENSMUST00000121290 288 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
Top6blJ3QMY9 Sf3a2-204ENSMUST00000151928 781 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Top6blJ3QMY9 Gm24694-201ENSMUST00000180054 110 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
Top6blJ3QMY9 Gm6283-201ENSMUST00000182369 1000 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
Top6blJ3QMY9 Gm27663-201ENSMUST00000184839 110 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
Top6blJ3QMY9 1700025N23Rik-201ENSMUST00000186189 915 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Top6blJ3QMY9 Gm10766-202ENSMUST00000194123 606 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
Top6blJ3QMY9 Crybb3-201ENSMUST00000076069 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Top6blJ3QMY9 Polr2g-201ENSMUST00000096261 868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Top6blJ3QMY9 Syt7-204ENSMUST00000223586 1344 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
Top6blJ3QMY9 Josd1-201ENSMUST00000023061 3394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Top6blJ3QMY9 Golim4-201ENSMUST00000038563 5546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Top6blJ3QMY9 Map2k6-202ENSMUST00000100260 2088 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Top6blJ3QMY9 Med14-202ENSMUST00000096495 6963 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Top6blJ3QMY9 Stat3-201ENSMUST00000092671 2927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Top6blJ3QMY9 Trmt10c-201ENSMUST00000059052 3002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Top6blJ3QMY9 Dnm1-204ENSMUST00000113352 4605 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Top6blJ3QMY9 Serp1-201ENSMUST00000029385 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Top6blJ3QMY9 Trim24-203ENSMUST00000120428 3940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Top6blJ3QMY9 Pdlim2-210ENSMUST00000153735 1578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
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