Protein–RNA interactions for Protein: J3QJW5

Cldn34c3, Claudin 34C3, mousemouse

Predictions only

Length 233 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn34c3J3QJW5 Cmtm7-202ENSMUST00000084867 874 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Cldn34c3J3QJW5 Gm14812-201ENSMUST00000156494 1794 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Cldn34c3J3QJW5 Pramel1-201ENSMUST00000037419 2794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Cldn34c3J3QJW5 Kctd14-205ENSMUST00000206279 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Cldn34c3J3QJW5 Arhgef25-202ENSMUST00000167353 2189 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Cldn34c3J3QJW5 Erich6-201ENSMUST00000041115 2195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Cldn34c3J3QJW5 Exosc5-206ENSMUST00000206561 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Cldn34c3J3QJW5 Peli1-201ENSMUST00000093290 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Cldn34c3J3QJW5 Loxl2-202ENSMUST00000100420 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Cldn34c3J3QJW5 Nat6-201ENSMUST00000093785 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Cldn34c3J3QJW5 Prpf3-201ENSMUST00000015892 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Cldn34c3J3QJW5 Mbl1-202ENSMUST00000225792 1563 ntAPPRIS P1 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Cldn34c3J3QJW5 Enc1-201ENSMUST00000041623 4737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Cldn34c3J3QJW5 Slc25a47-201ENSMUST00000057026 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Cldn34c3J3QJW5 Nup62-203ENSMUST00000207103 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Cldn34c3J3QJW5 R3hcc1-202ENSMUST00000121142 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Cldn34c3J3QJW5 Tcf4-253ENSMUST00000202610 1959 ntTSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Cldn34c3J3QJW5 Cdx4-201ENSMUST00000033689 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Cldn34c3J3QJW5 Hsph1-205ENSMUST00000201452 3140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Cldn34c3J3QJW5 Kcnj9-202ENSMUST00000194204 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Cldn34c3J3QJW5 Fmnl2-205ENSMUST00000155586 3939 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Cldn34c3J3QJW5 Nos1ap-202ENSMUST00000160456 3022 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Cldn34c3J3QJW5 Magi1-206ENSMUST00000203688 4969 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Cldn34c3J3QJW5 Socs3-201ENSMUST00000054002 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Cldn34c3J3QJW5 Mfsd3-201ENSMUST00000019224 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Cldn34c3J3QJW5 Angptl7-201ENSMUST00000030840 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Cldn34c3J3QJW5 Dnmt3a-201ENSMUST00000020991 9685 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Cldn34c3J3QJW5 P2rx3-202ENSMUST00000111613 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Cldn34c3J3QJW5 Nfasc-207ENSMUST00000187861 4927 ntTSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Cldn34c3J3QJW5 Dcp1b-202ENSMUST00000112777 3313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Cldn34c3J3QJW5 Rbak-201ENSMUST00000049861 3335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Cldn34c3J3QJW5 Nup205-204ENSMUST00000201374 6411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Cldn34c3J3QJW5 Neu2-203ENSMUST00000164128 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Cldn34c3J3QJW5 Mbp-205ENSMUST00000091789 4797 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Cldn34c3J3QJW5 Scd2-201ENSMUST00000026221 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Cldn34c3J3QJW5 Tfap2a-201ENSMUST00000021787 3487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Cldn34c3J3QJW5 Slpi-201ENSMUST00000109367 876 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Cldn34c3J3QJW5 Slc39a1-ps-201ENSMUST00000120862 969 ntBASIC11.44□□□□□ -0.58
Cldn34c3J3QJW5 Gm13375-201ENSMUST00000126967 854 ntTSL 2 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Cldn34c3J3QJW5 Gm13496-201ENSMUST00000141133 1165 ntTSL 2 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Cldn34c3J3QJW5 Gm13830-202ENSMUST00000144202 381 ntTSL 3 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Cldn34c3J3QJW5 Hoxb8-203ENSMUST00000168043 1141 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Cldn34c3J3QJW5 Gm37230-201ENSMUST00000194491 818 ntBASIC11.44□□□□□ -0.58
Cldn34c3J3QJW5 Gm9449-201ENSMUST00000207265 1011 ntBASIC11.44□□□□□ -0.58
Cldn34c3J3QJW5 2300002M23Rik-201ENSMUST00000044326 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Cldn34c3J3QJW5 Atg101-201ENSMUST00000048393 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Cldn34c3J3QJW5 Meaf6-201ENSMUST00000055213 872 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Cldn34c3J3QJW5 Phykpl-201ENSMUST00000020625 1609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Cldn34c3J3QJW5 Sytl1-201ENSMUST00000030674 1951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Cldn34c3J3QJW5 Sufu-203ENSMUST00000118440 2663 ntTSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Cldn34c3J3QJW5 Epsti1-201ENSMUST00000022591 1870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Cldn34c3J3QJW5 Rprd1b-202ENSMUST00000103123 4504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Cldn34c3J3QJW5 Stip1-201ENSMUST00000025918 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Cldn34c3J3QJW5 Enox1-201ENSMUST00000022589 3142 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Cldn34c3J3QJW5 Sem1-201ENSMUST00000041111 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Cldn34c3J3QJW5 Srsf10-204ENSMUST00000105853 3058 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Cldn34c3J3QJW5 Srsf10-202ENSMUST00000097844 3055 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Cldn34c3J3QJW5 Tspyl5-201ENSMUST00000042021 4010 ntAPPRIS P1 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Cldn34c3J3QJW5 Prickle3-203ENSMUST00000129662 2376 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Cldn34c3J3QJW5 Rnpepl1-201ENSMUST00000027487 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Cldn34c3J3QJW5 Oser1-202ENSMUST00000104954 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Cldn34c3J3QJW5 Spon2-201ENSMUST00000046186 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Cldn34c3J3QJW5 Dhrs3-206ENSMUST00000154208 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Cldn34c3J3QJW5 A930004D18Rik-201ENSMUST00000066163 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Cldn34c3J3QJW5 Mgat3-201ENSMUST00000044970 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Cldn34c3J3QJW5 Snx22-201ENSMUST00000044711 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Cldn34c3J3QJW5 Serpinh1-201ENSMUST00000094154 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Cldn34c3J3QJW5 Prkg1-206ENSMUST00000182685 1628 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Cldn34c3J3QJW5 Eif2b2-201ENSMUST00000004910 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Cldn34c3J3QJW5 Trabd2b-201ENSMUST00000094894 6617 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Cldn34c3J3QJW5 Gm26513-201ENSMUST00000181802 2489 ntBASIC11.43□□□□□ -0.58
Cldn34c3J3QJW5 Men1-207ENSMUST00000113503 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Cldn34c3J3QJW5 Spon1-201ENSMUST00000046687 6161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Cldn34c3J3QJW5 Edil3-203ENSMUST00000118731 2721 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Cldn34c3J3QJW5 Gm11992-201ENSMUST00000043285 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Cldn34c3J3QJW5 Tnnt1-203ENSMUST00000108587 1059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Cldn34c3J3QJW5 Josd2-202ENSMUST00000117324 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Cldn34c3J3QJW5 Gm14042-201ENSMUST00000120139 833 ntBASIC11.43□□□□□ -0.58
Cldn34c3J3QJW5 Gm17112-201ENSMUST00000163194 432 ntTSL 3 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Cldn34c3J3QJW5 Hsf4-203ENSMUST00000172525 1276 ntTSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Cldn34c3J3QJW5 Lmbrd1-202ENSMUST00000186096 688 ntTSL 2 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Cldn34c3J3QJW5 Gm2651-201ENSMUST00000203560 838 ntBASIC11.43□□□□□ -0.58
Cldn34c3J3QJW5 Gm45747-201ENSMUST00000212203 999 ntBASIC11.43□□□□□ -0.58
Cldn34c3J3QJW5 Thap2-203ENSMUST00000218989 527 ntBASIC11.43□□□□□ -0.58
Cldn34c3J3QJW5 1700037H04Rik-201ENSMUST00000028800 832 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Cldn34c3J3QJW5 Dnajb1-201ENSMUST00000005620 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Cldn34c3J3QJW5 Rpl28-202ENSMUST00000078432 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Cldn34c3J3QJW5 Prdm5-203ENSMUST00000081219 984 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Cldn34c3J3QJW5 Etfdh-201ENSMUST00000029386 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Cldn34c3J3QJW5 Pgm2-201ENSMUST00000058351 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Cldn34c3J3QJW5 E130317F20Rik-202ENSMUST00000217802 3420 ntBASIC11.43□□□□□ -0.58
Cldn34c3J3QJW5 Kctd14-206ENSMUST00000206658 2339 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Cldn34c3J3QJW5 Apln-201ENSMUST00000039026 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Cldn34c3J3QJW5 Srl-201ENSMUST00000023161 5000 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Cldn34c3J3QJW5 Nxpe5-202ENSMUST00000159798 2568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Cldn34c3J3QJW5 Rgs12-202ENSMUST00000087684 4713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Cldn34c3J3QJW5 Sftpb-204ENSMUST00000183018 1490 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Cldn34c3J3QJW5 Tspyl1-201ENSMUST00000061372 3086 ntAPPRIS P1 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Cldn34c3J3QJW5 Olfr683-202ENSMUST00000209879 3841 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Cldn34c3J3QJW5 Mpped1-203ENSMUST00000109470 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
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