Protein–RNA interactions for Protein: F8VQM8

Xntrpc, Xndc1-transient receptor potential cation channel, subfamily C, member 2 readthrough, mousemouse

Predictions only

Length 1,264 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
XntrpcF8VQM8 Dmrtc2-201ENSMUST00000011493 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
XntrpcF8VQM8 2410002F23Rik-218ENSMUST00000188382 2301 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
XntrpcF8VQM8 Agbl5-213ENSMUST00000201917 3579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
XntrpcF8VQM8 Gtf2h1-201ENSMUST00000006774 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
XntrpcF8VQM8 Mlkl-201ENSMUST00000056157 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
XntrpcF8VQM8 Fermt2-201ENSMUST00000045905 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
XntrpcF8VQM8 Pth2r-201ENSMUST00000027083 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
XntrpcF8VQM8 Slc16a6-202ENSMUST00000070152 4219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
XntrpcF8VQM8 Acly-202ENSMUST00000107385 1741 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
XntrpcF8VQM8 Ap5m1-205ENSMUST00000227431 3757 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
XntrpcF8VQM8 Tcf4-248ENSMUST00000202354 2120 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
XntrpcF8VQM8 Tcf4-257ENSMUST00000202772 2125 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
XntrpcF8VQM8 Cyp2d11-201ENSMUST00000170255 1590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
XntrpcF8VQM8 Kcnj8-202ENSMUST00000203945 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
XntrpcF8VQM8 R3hcc1-202ENSMUST00000121142 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
XntrpcF8VQM8 Rph3al-203ENSMUST00000108420 695 ntTSL 3 BASIC14.95□□□□□ -0.02
XntrpcF8VQM8 Mrpl53-201ENSMUST00000113938 695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
XntrpcF8VQM8 Tmem219-204ENSMUST00000121532 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
XntrpcF8VQM8 Gm10766-202ENSMUST00000194123 606 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
XntrpcF8VQM8 AL593843.1-201ENSMUST00000195891 145 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
XntrpcF8VQM8 Cartpt-201ENSMUST00000022150 827 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
XntrpcF8VQM8 Cartpt-202ENSMUST00000224142 1238 ntAPPRIS P1 BASIC14.95□□□□□ -0.02
XntrpcF8VQM8 Tmem253-203ENSMUST00000227295 704 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
XntrpcF8VQM8 Fam162a-201ENSMUST00000004057 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
XntrpcF8VQM8 Med8-202ENSMUST00000073881 1052 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
XntrpcF8VQM8 Psrc1-202ENSMUST00000102629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
XntrpcF8VQM8 Zfp606-201ENSMUST00000098822 4748 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
XntrpcF8VQM8 Sapcd2-201ENSMUST00000028329 3121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
XntrpcF8VQM8 Plekhb1-206ENSMUST00000107047 1926 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
XntrpcF8VQM8 Tle3-210ENSMUST00000161207 2592 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
XntrpcF8VQM8 F2r-201ENSMUST00000059193 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
XntrpcF8VQM8 Rxra-203ENSMUST00000113934 1989 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
XntrpcF8VQM8 Kdm6b-201ENSMUST00000094077 6654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
XntrpcF8VQM8 Nr1d1-201ENSMUST00000064941 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
XntrpcF8VQM8 Usp31-201ENSMUST00000046929 10198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
XntrpcF8VQM8 Keap1-205ENSMUST00000194542 3151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
XntrpcF8VQM8 Gm44645-201ENSMUST00000205492 1653 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
XntrpcF8VQM8 Ecsit-201ENSMUST00000098937 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
XntrpcF8VQM8 Map4k5-202ENSMUST00000110567 4250 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
XntrpcF8VQM8 Zfp651-201ENSMUST00000093772 6353 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
XntrpcF8VQM8 Slc43a1-201ENSMUST00000028469 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
XntrpcF8VQM8 Arap2-201ENSMUST00000076623 7306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
XntrpcF8VQM8 Ppp2r5e-205ENSMUST00000220035 3135 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
XntrpcF8VQM8 Hpse-201ENSMUST00000045617 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
XntrpcF8VQM8 Fen1-204ENSMUST00000156291 2373 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
XntrpcF8VQM8 B230359F08Rik-201ENSMUST00000103671 426 ntAPPRIS P1 BASIC14.94□□□□□ -0.02
XntrpcF8VQM8 Gm12134-201ENSMUST00000122109 520 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
XntrpcF8VQM8 3110053B16Rik-204ENSMUST00000145605 575 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
XntrpcF8VQM8 Dap-204ENSMUST00000186425 597 ntTSL 3 BASIC14.94□□□□□ -0.02
XntrpcF8VQM8 Ighv8-14-201ENSMUST00000196781 358 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
XntrpcF8VQM8 Gm9797-201ENSMUST00000052902 613 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
XntrpcF8VQM8 Ssr1-204ENSMUST00000225319 1610 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
XntrpcF8VQM8 Psmd13-201ENSMUST00000026560 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
XntrpcF8VQM8 Enpp6-202ENSMUST00000119686 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
XntrpcF8VQM8 Map2k7-202ENSMUST00000062686 3525 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
XntrpcF8VQM8 AC148324.1-201ENSMUST00000219034 4240 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
XntrpcF8VQM8 Gm6159-201ENSMUST00000191249 1724 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
XntrpcF8VQM8 Cask-204ENSMUST00000115438 8366 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
XntrpcF8VQM8 Ldb3-207ENSMUST00000227819 1499 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
XntrpcF8VQM8 Mapt-203ENSMUST00000106989 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
XntrpcF8VQM8 Ppp1r3g-201ENSMUST00000132661 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
XntrpcF8VQM8 Alx1-205ENSMUST00000218282 2012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
XntrpcF8VQM8 Cep44-201ENSMUST00000040330 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
XntrpcF8VQM8 Zfp212-201ENSMUST00000009411 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
XntrpcF8VQM8 4930423C22Rik-201ENSMUST00000193863 1311 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
XntrpcF8VQM8 Nt5c3b-202ENSMUST00000092689 1344 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
XntrpcF8VQM8 Wsb1-201ENSMUST00000017821 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
XntrpcF8VQM8 Gtf2ird1-208ENSMUST00000167084 3283 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
XntrpcF8VQM8 Kcnh4-201ENSMUST00000107361 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
XntrpcF8VQM8 Sgk1-202ENSMUST00000092673 2576 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
XntrpcF8VQM8 Adgrd2-ps-201ENSMUST00000118797 2662 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
XntrpcF8VQM8 Kdm4b-202ENSMUST00000086835 4360 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
XntrpcF8VQM8 Ralgds-201ENSMUST00000028170 3590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
XntrpcF8VQM8 2010007H06Rik-202ENSMUST00000186025 4934 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
XntrpcF8VQM8 Pnck-201ENSMUST00000002087 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
XntrpcF8VQM8 Ncbp2-201ENSMUST00000023460 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
XntrpcF8VQM8 Rbbp9-201ENSMUST00000028915 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
XntrpcF8VQM8 Ube2j2-206ENSMUST00000118192 922 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
XntrpcF8VQM8 Gm5678-201ENSMUST00000120115 939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
XntrpcF8VQM8 Tpd52-206ENSMUST00000121038 849 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
XntrpcF8VQM8 C530008M17Rik-205ENSMUST00000121851 1165 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
XntrpcF8VQM8 Tex30-211ENSMUST00000150911 960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
XntrpcF8VQM8 Gm12446-202ENSMUST00000152069 713 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
XntrpcF8VQM8 Gm13568-201ENSMUST00000156099 446 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
XntrpcF8VQM8 Nacc2-201ENSMUST00000028300 6378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
XntrpcF8VQM8 Rps11-201ENSMUST00000003521 661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
XntrpcF8VQM8 Olfr1412-201ENSMUST00000062964 966 ntAPPRIS P1 BASIC14.93□□□□□ -0.02
XntrpcF8VQM8 Cspg5-204ENSMUST00000197850 7868 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
XntrpcF8VQM8 Rwdd2a-201ENSMUST00000034988 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
XntrpcF8VQM8 Ak1-201ENSMUST00000068271 2034 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
XntrpcF8VQM8 Itfg1-201ENSMUST00000034140 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
XntrpcF8VQM8 Gm45504-201ENSMUST00000211407 2107 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
XntrpcF8VQM8 Tmem101-201ENSMUST00000021296 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
XntrpcF8VQM8 Ddb2-201ENSMUST00000028696 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
XntrpcF8VQM8 Socs7-201ENSMUST00000045540 7015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
XntrpcF8VQM8 Fam174a-202ENSMUST00000186780 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
XntrpcF8VQM8 Rrp1-201ENSMUST00000062678 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
XntrpcF8VQM8 Rad54l2-201ENSMUST00000046502 9305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
XntrpcF8VQM8 Sox17-201ENSMUST00000027035 3127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
XntrpcF8VQM8 Dusp23-201ENSMUST00000027826 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.9 ms