Protein–RNA interactions for Protein: F6XLV1

Crocc2, Ciliary rootlet coiled-coil, rootletin family member 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,638 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Crocc2F6XLV1 Fam96a-201ENSMUST00000034945 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Crocc2F6XLV1 Leap2-201ENSMUST00000036045 531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Crocc2F6XLV1 Lrrc52-201ENSMUST00000036643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Crocc2F6XLV1 Uri1-201ENSMUST00000085513 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Crocc2F6XLV1 Ccdc154-201ENSMUST00000073277 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Crocc2F6XLV1 Foxp4-203ENSMUST00000113263 3156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Crocc2F6XLV1 Pax7-202ENSMUST00000174681 1725 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Crocc2F6XLV1 Gm16754-201ENSMUST00000181222 2077 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Crocc2F6XLV1 Pde7b-205ENSMUST00000169404 1697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Crocc2F6XLV1 Ecscr-204ENSMUST00000133064 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Crocc2F6XLV1 D230022J07Rik-201ENSMUST00000144735 1062 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Crocc2F6XLV1 1810059H22Rik-208ENSMUST00000204941 642 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Crocc2F6XLV1 Morn3-201ENSMUST00000031437 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Crocc2F6XLV1 Ecscr-201ENSMUST00000097618 1114 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Crocc2F6XLV1 Sox4-201ENSMUST00000067230 4795 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Crocc2F6XLV1 Tmem248-202ENSMUST00000111298 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Crocc2F6XLV1 Tril-201ENSMUST00000127748 5363 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Crocc2F6XLV1 Aifm1-202ENSMUST00000114945 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Crocc2F6XLV1 Pgm1-201ENSMUST00000087324 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Crocc2F6XLV1 Igf1-204ENSMUST00000121161 1344 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Crocc2F6XLV1 Tsta3-201ENSMUST00000023231 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Crocc2F6XLV1 Mboat7-201ENSMUST00000038608 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Crocc2F6XLV1 Gm26788-201ENSMUST00000181692 1750 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Crocc2F6XLV1 Aqp6-201ENSMUST00000023754 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Crocc2F6XLV1 Zpr1-206ENSMUST00000156440 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Crocc2F6XLV1 Cdca7l-201ENSMUST00000021592 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Crocc2F6XLV1 Nadk2-203ENSMUST00000100790 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
Crocc2F6XLV1 Strn4-202ENSMUST00000108495 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Crocc2F6XLV1 Gm12363-201ENSMUST00000122250 668 ntBASIC22.14■■□□□ 1.14
Crocc2F6XLV1 Gm14379-201ENSMUST00000128858 1878 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Crocc2F6XLV1 Endov-204ENSMUST00000129327 1184 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
Crocc2F6XLV1 4930579D09Rik-201ENSMUST00000132321 469 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Crocc2F6XLV1 Gm24514-201ENSMUST00000174961 285 ntBASIC22.14■■□□□ 1.14
Crocc2F6XLV1 Gm38144-201ENSMUST00000192790 465 ntBASIC22.14■■□□□ 1.14
Crocc2F6XLV1 Hax1-206ENSMUST00000197786 857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Crocc2F6XLV1 Crip3-201ENSMUST00000024764 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Crocc2F6XLV1 Tdrp-201ENSMUST00000062613 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Crocc2F6XLV1 Adam15-202ENSMUST00000074582 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Crocc2F6XLV1 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
Crocc2F6XLV1 Tnip2-202ENSMUST00000087737 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Crocc2F6XLV1 Gdap1l1-201ENSMUST00000018087 2220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Crocc2F6XLV1 Art3-206ENSMUST00000120416 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Crocc2F6XLV1 4931428F04Rik-203ENSMUST00000212219 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Crocc2F6XLV1 Mycl-201ENSMUST00000030407 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Crocc2F6XLV1 Wnt8b-201ENSMUST00000041163 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Crocc2F6XLV1 Zbtb2-201ENSMUST00000100077 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Crocc2F6XLV1 Asap2-203ENSMUST00000090834 5097 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Crocc2F6XLV1 Rbbp7-201ENSMUST00000033720 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Crocc2F6XLV1 Pisd-ps1-203ENSMUST00000145164 789 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Crocc2F6XLV1 Gm28085-201ENSMUST00000189281 1137 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Crocc2F6XLV1 Fgl1-201ENSMUST00000034003 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Crocc2F6XLV1 Sox12-201ENSMUST00000063332 4169 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Crocc2F6XLV1 Rwdd2b-201ENSMUST00000039101 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Crocc2F6XLV1 Ppp1r13b-201ENSMUST00000054815 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Crocc2F6XLV1 Eps8-203ENSMUST00000111878 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Crocc2F6XLV1 Erf-201ENSMUST00000045847 3505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Crocc2F6XLV1 Gm6159-201ENSMUST00000191249 1724 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
Crocc2F6XLV1 Acss3-201ENSMUST00000044668 2494 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Crocc2F6XLV1 Hexim2-202ENSMUST00000107037 1221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Crocc2F6XLV1 Rbm3-202ENSMUST00000115615 1183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Crocc2F6XLV1 Rbm3-203ENSMUST00000115616 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Crocc2F6XLV1 Gm7857-201ENSMUST00000117957 358 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
Crocc2F6XLV1 Tnfrsf18-203ENSMUST00000122001 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Crocc2F6XLV1 Gm15979-201ENSMUST00000149741 590 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Crocc2F6XLV1 Mir5120-201ENSMUST00000175020 78 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
Crocc2F6XLV1 Gm42797-201ENSMUST00000197573 494 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Crocc2F6XLV1 1700011D18Rik-201ENSMUST00000205762 277 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
Crocc2F6XLV1 Abhd11os-203ENSMUST00000222613 363 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
Crocc2F6XLV1 Psma1-201ENSMUST00000033008 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Crocc2F6XLV1 Gm13034-201ENSMUST00000121342 3177 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
Crocc2F6XLV1 Pou5f2-201ENSMUST00000175955 1394 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Crocc2F6XLV1 N6amt1-203ENSMUST00000118310 1700 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Crocc2F6XLV1 Endou-201ENSMUST00000023105 2404 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Crocc2F6XLV1 Duoxa2-201ENSMUST00000028656 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Crocc2F6XLV1 Sdccag8-202ENSMUST00000056773 1551 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Crocc2F6XLV1 Tbc1d12-201ENSMUST00000037302 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Crocc2F6XLV1 Iqcm-203ENSMUST00000212704 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Crocc2F6XLV1 Sorcs2-201ENSMUST00000037370 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Crocc2F6XLV1 Gm45338-207ENSMUST00000211499 1405 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Crocc2F6XLV1 Krt90-201ENSMUST00000023714 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Crocc2F6XLV1 Rgs6-216ENSMUST00000200911 2626 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Crocc2F6XLV1 Prss8-202ENSMUST00000206124 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Crocc2F6XLV1 C130074G19Rik-201ENSMUST00000048308 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Crocc2F6XLV1 Prmt2-201ENSMUST00000020452 2016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Crocc2F6XLV1 Alas1-201ENSMUST00000074082 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Crocc2F6XLV1 Mmp21-202ENSMUST00000122136 1599 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Crocc2F6XLV1 Gm44579-201ENSMUST00000142443 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Crocc2F6XLV1 Zbtb46-205ENSMUST00000180222 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Crocc2F6XLV1 Gm14028-201ENSMUST00000117434 479 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
Crocc2F6XLV1 Gm14017-201ENSMUST00000121934 386 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
Crocc2F6XLV1 Olfr668-201ENSMUST00000164391 957 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Crocc2F6XLV1 Gm32926-201ENSMUST00000214043 681 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Crocc2F6XLV1 Ctrb1-201ENSMUST00000034435 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Crocc2F6XLV1 Olfr667-201ENSMUST00000071362 981 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Crocc2F6XLV1 Olfr666-201ENSMUST00000081116 957 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Crocc2F6XLV1 Krt17-201ENSMUST00000080893 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Crocc2F6XLV1 Mus81-202ENSMUST00000124334 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Crocc2F6XLV1 Sft2d2-201ENSMUST00000043338 5535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Crocc2F6XLV1 Fam171a1-203ENSMUST00000091505 3449 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Crocc2F6XLV1 Spo11-203ENSMUST00000109126 1625 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.9 ms