Protein–RNA interactions for Protein: F6SEU4

Syngap1, Ras/Rap GTPase-activating protein SynGAP, mousemouse

Predictions only

Length 1,340 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Syngap1F6SEU4 Dnajc22-201ENSMUST00000061295 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Syngap1F6SEU4 Gm10406-202ENSMUST00000170738 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Syngap1F6SEU4 Hs3st3a1-201ENSMUST00000058652 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Syngap1F6SEU4 9130024F11Rik-202ENSMUST00000185204 2628 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Syngap1F6SEU4 Cgn-202ENSMUST00000107273 5016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Syngap1F6SEU4 Sec24a-202ENSMUST00000064297 2104 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Syngap1F6SEU4 Ydjc-202ENSMUST00000115702 1713 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Syngap1F6SEU4 Gpr135-201ENSMUST00000050649 3150 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Syngap1F6SEU4 1810014B01Rik-201ENSMUST00000181587 1661 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Syngap1F6SEU4 Lmna-203ENSMUST00000120377 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Syngap1F6SEU4 Fen1-204ENSMUST00000156291 2373 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Syngap1F6SEU4 Kmt5b-208ENSMUST00000113977 6002 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Syngap1F6SEU4 Htr2c-203ENSMUST00000112831 809 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Syngap1F6SEU4 Ldha-ps-201ENSMUST00000119390 995 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Syngap1F6SEU4 Gm12134-201ENSMUST00000122109 520 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Syngap1F6SEU4 Armc2-208ENSMUST00000162405 1135 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Syngap1F6SEU4 S100a14-202ENSMUST00000167598 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Syngap1F6SEU4 Flg-208ENSMUST00000180308 1076 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Syngap1F6SEU4 Gm26600-201ENSMUST00000181637 1256 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Syngap1F6SEU4 Gm4691-201ENSMUST00000182339 1000 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Syngap1F6SEU4 Platr12-202ENSMUST00000189722 549 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Syngap1F6SEU4 Gm2451-201ENSMUST00000199447 999 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Syngap1F6SEU4 Gm10290-201ENSMUST00000200451 999 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Syngap1F6SEU4 4933424G06Rik-204ENSMUST00000208994 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Syngap1F6SEU4 Gm26953-206ENSMUST00000212840 619 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Syngap1F6SEU4 Gm18934-201ENSMUST00000216671 1044 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Syngap1F6SEU4 AC149588.3-201ENSMUST00000227515 150 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Syngap1F6SEU4 Mettl6-204ENSMUST00000227595 1027 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Syngap1F6SEU4 AC150560.1-201ENSMUST00000227731 1187 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Syngap1F6SEU4 Rrp36-201ENSMUST00000024766 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Syngap1F6SEU4 Atp6v0c-201ENSMUST00000024932 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Syngap1F6SEU4 Atp6v1g1-201ENSMUST00000035301 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Syngap1F6SEU4 Txn2-201ENSMUST00000005487 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Syngap1F6SEU4 Tgif2-ps2-201ENSMUST00000061746 711 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Syngap1F6SEU4 Rec114-201ENSMUST00000098674 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Syngap1F6SEU4 Lrrc41-201ENSMUST00000030471 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Syngap1F6SEU4 Slc2a6-202ENSMUST00000102890 1887 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Syngap1F6SEU4 Sema4c-203ENSMUST00000191677 3779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Syngap1F6SEU4 Gm45504-201ENSMUST00000211407 2107 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Syngap1F6SEU4 Slc39a11-201ENSMUST00000042657 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Syngap1F6SEU4 Mus81-202ENSMUST00000124334 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Syngap1F6SEU4 Syngr2-202ENSMUST00000120928 1402 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Syngap1F6SEU4 Mcidas-201ENSMUST00000092089 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Syngap1F6SEU4 Slc35e2-201ENSMUST00000043829 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Syngap1F6SEU4 Parm1-201ENSMUST00000040576 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Syngap1F6SEU4 D830030K20Rik-201ENSMUST00000112797 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Syngap1F6SEU4 Slc9a3r2-202ENSMUST00000019684 1688 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Syngap1F6SEU4 Plin5-201ENSMUST00000019808 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Syngap1F6SEU4 Gm17108-201ENSMUST00000168625 2877 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Syngap1F6SEU4 Pcdh20-201ENSMUST00000061628 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Syngap1F6SEU4 Tada3-201ENSMUST00000032410 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Syngap1F6SEU4 Trmt6-201ENSMUST00000039554 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Syngap1F6SEU4 Foxp1-208ENSMUST00000113329 1926 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Syngap1F6SEU4 Fam151a-201ENSMUST00000047620 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Syngap1F6SEU4 Miip-202ENSMUST00000119975 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Syngap1F6SEU4 Usp33-202ENSMUST00000117492 3886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Syngap1F6SEU4 Jakmip3-201ENSMUST00000106111 1571 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Syngap1F6SEU4 Fbxl12-205ENSMUST00000140702 1555 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Syngap1F6SEU4 Pop7-202ENSMUST00000111035 988 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Syngap1F6SEU4 Gtf2a2-202ENSMUST00000118198 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Syngap1F6SEU4 Rpl3-ps1-201ENSMUST00000120557 1210 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Syngap1F6SEU4 Gstt1-201ENSMUST00000001713 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Syngap1F6SEU4 Gnpda2-207ENSMUST00000173927 1011 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Syngap1F6SEU4 Anapc16-202ENSMUST00000182116 581 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Syngap1F6SEU4 Gm27839-201ENSMUST00000184242 106 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Syngap1F6SEU4 Gm29237-201ENSMUST00000186216 448 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Syngap1F6SEU4 Sar1b-201ENSMUST00000020653 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Syngap1F6SEU4 Caly-203ENSMUST00000211044 1029 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Syngap1F6SEU4 AC144543.1-201ENSMUST00000221840 1064 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Syngap1F6SEU4 Kcnk9-201ENSMUST00000044624 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Syngap1F6SEU4 Elane-201ENSMUST00000046091 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Syngap1F6SEU4 Kdm8-201ENSMUST00000033010 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Syngap1F6SEU4 Dbn1-203ENSMUST00000109923 2940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Syngap1F6SEU4 Gigyf1-201ENSMUST00000031727 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Syngap1F6SEU4 Iqcm-201ENSMUST00000034033 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Syngap1F6SEU4 4930513N10Rik-203ENSMUST00000145562 2803 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Syngap1F6SEU4 Zfp683-201ENSMUST00000105884 1471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Syngap1F6SEU4 Sox5-202ENSMUST00000077160 2526 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Syngap1F6SEU4 Ptpn6-210ENSMUST00000174265 1743 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Syngap1F6SEU4 Krt25-201ENSMUST00000038004 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Syngap1F6SEU4 Tlr2-201ENSMUST00000029623 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Syngap1F6SEU4 Gpc6-201ENSMUST00000078849 1668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Syngap1F6SEU4 Ahctf1-201ENSMUST00000027768 8506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Syngap1F6SEU4 Pygo2-201ENSMUST00000060061 3198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Syngap1F6SEU4 Atp13a3-201ENSMUST00000061350 7220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Syngap1F6SEU4 Lmntd2-202ENSMUST00000170841 2077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Syngap1F6SEU4 Ccdc103-201ENSMUST00000021307 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Syngap1F6SEU4 C330018A13Rik-201ENSMUST00000127792 1599 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Syngap1F6SEU4 Las1l-201ENSMUST00000079987 2530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Syngap1F6SEU4 Slc24a3-201ENSMUST00000081121 1788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Syngap1F6SEU4 Hist1h4d-201ENSMUST00000102968 1138 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Syngap1F6SEU4 Tpi-rs2-201ENSMUST00000182471 756 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Syngap1F6SEU4 Mir7070-201ENSMUST00000183657 86 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Syngap1F6SEU4 1700028J19Rik-203ENSMUST00000206686 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Syngap1F6SEU4 Gm45453-201ENSMUST00000211758 853 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Syngap1F6SEU4 Ins1-201ENSMUST00000039652 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Syngap1F6SEU4 H2bfm-201ENSMUST00000059808 1052 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Syngap1F6SEU4 Smim11-201ENSMUST00000063641 517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Syngap1F6SEU4 Slc44a3-201ENSMUST00000039197 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Syngap1F6SEU4 Mcrs1-201ENSMUST00000041190 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.8 ms