Protein–RNA interactions for Protein: E9Q1M1

Pdzd2, PDZ domain-containing 2, mousemouse

Predictions only

Length 2,796 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pdzd2E9Q1M1 Usp1-201ENSMUST00000030289 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Pdzd2E9Q1M1 Rpl15-203ENSMUST00000100799 802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.91□□□□□ -0.66
Pdzd2E9Q1M1 Ptgr2-205ENSMUST00000135001 1286 ntTSL 5 BASIC10.91□□□□□ -0.66
Pdzd2E9Q1M1 Mymx-204ENSMUST00000208801 437 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.91□□□□□ -0.66
Pdzd2E9Q1M1 P4hb-201ENSMUST00000026122 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Pdzd2E9Q1M1 Anapc7-203ENSMUST00000122010 2950 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.91□□□□□ -0.66
Pdzd2E9Q1M1 Rab10-201ENSMUST00000021001 3513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Pdzd2E9Q1M1 Pou5f2-201ENSMUST00000175955 1394 ntAPPRIS P1 BASIC10.91□□□□□ -0.66
Pdzd2E9Q1M1 Acot10-201ENSMUST00000052910 1537 ntAPPRIS P1 BASIC10.91□□□□□ -0.66
Pdzd2E9Q1M1 Adam15-202ENSMUST00000074582 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Pdzd2E9Q1M1 Gm16685-201ENSMUST00000181286 1592 ntTSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Pdzd2E9Q1M1 F830212C03Rik-201ENSMUST00000191701 2285 ntBASIC10.91□□□□□ -0.66
Pdzd2E9Q1M1 AC140354.1-201ENSMUST00000219499 2425 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Pdzd2E9Q1M1 Rasal3-204ENSMUST00000135618 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.66
Pdzd2E9Q1M1 Poc1b-204ENSMUST00000159990 3449 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Pdzd2E9Q1M1 Asb2-201ENSMUST00000021617 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Pdzd2E9Q1M1 Esyt2-205ENSMUST00000220816 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Pdzd2E9Q1M1 Fundc1-201ENSMUST00000026016 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Pdzd2E9Q1M1 Hdgfl1-201ENSMUST00000055915 1993 ntAPPRIS P1 BASIC10.9□□□□□ -0.66
Pdzd2E9Q1M1 Gm4909-201ENSMUST00000118749 794 ntBASIC10.9□□□□□ -0.66
Pdzd2E9Q1M1 Drap1-209ENSMUST00000136579 734 ntTSL 2 BASIC10.9□□□□□ -0.66
Pdzd2E9Q1M1 Gm11290-203ENSMUST00000147811 314 ntTSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.66
Pdzd2E9Q1M1 1700066O22Rik-203ENSMUST00000150994 961 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Pdzd2E9Q1M1 Gm22334-201ENSMUST00000158070 133 ntBASIC10.9□□□□□ -0.66
Pdzd2E9Q1M1 Gm20036-201ENSMUST00000177547 844 ntTSL 3 BASIC10.9□□□□□ -0.66
Pdzd2E9Q1M1 Gm29264-201ENSMUST00000191240 1264 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Pdzd2E9Q1M1 Esrrb-201ENSMUST00000021680 2136 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.66
Pdzd2E9Q1M1 AC160029.2-201ENSMUST00000218285 548 ntTSL 3 BASIC10.9□□□□□ -0.66
Pdzd2E9Q1M1 Rpl24-201ENSMUST00000023269 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Pdzd2E9Q1M1 Fam96a-201ENSMUST00000034945 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Pdzd2E9Q1M1 Fmr1nb-202ENSMUST00000071848 842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Pdzd2E9Q1M1 Capn12-201ENSMUST00000066880 3040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.66
Pdzd2E9Q1M1 Edem2-201ENSMUST00000040833 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Pdzd2E9Q1M1 Gm37885-201ENSMUST00000192568 1391 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Pdzd2E9Q1M1 Sra1-205ENSMUST00000173875 2360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Pdzd2E9Q1M1 Fh1-201ENSMUST00000027810 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Pdzd2E9Q1M1 Neil1-203ENSMUST00000190245 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Pdzd2E9Q1M1 Fam122b-203ENSMUST00000114841 3074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Pdzd2E9Q1M1 Irs3-201ENSMUST00000057314 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Pdzd2E9Q1M1 Gtf2h1-201ENSMUST00000006774 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Pdzd2E9Q1M1 P2ry2-201ENSMUST00000037540 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Pdzd2E9Q1M1 Ndufs5-202ENSMUST00000106206 599 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.9□□□□□ -0.66
Pdzd2E9Q1M1 Pde4b-210ENSMUST00000172616 823 ntTSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.66
Pdzd2E9Q1M1 Gm18556-201ENSMUST00000219748 1031 ntBASIC10.9□□□□□ -0.66
Pdzd2E9Q1M1 CT009718.3-201ENSMUST00000221116 367 ntBASIC10.9□□□□□ -0.66
Pdzd2E9Q1M1 Gm40437-201ENSMUST00000222338 767 ntTSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.66
Pdzd2E9Q1M1 Ppil3-201ENSMUST00000081677 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Pdzd2E9Q1M1 Gm16168-201ENSMUST00000161091 1359 ntTSL 3 BASIC10.9□□□□□ -0.66
Pdzd2E9Q1M1 Aqp3-201ENSMUST00000055327 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Pdzd2E9Q1M1 Ccno-201ENSMUST00000038404 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Pdzd2E9Q1M1 Gm26850-201ENSMUST00000181653 2669 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Pdzd2E9Q1M1 Mvp-202ENSMUST00000165096 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Pdzd2E9Q1M1 Gng2-204ENSMUST00000160013 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.67
Pdzd2E9Q1M1 Eml3-202ENSMUST00000224272 2978 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.9□□□□□ -0.67
Pdzd2E9Q1M1 Kctd8-201ENSMUST00000054095 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.67
Pdzd2E9Q1M1 Slc25a19-212ENSMUST00000178003 2614 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.67
Pdzd2E9Q1M1 Gm44579-201ENSMUST00000142443 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Pdzd2E9Q1M1 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Pdzd2E9Q1M1 1500015A07Rik-201ENSMUST00000184181 1865 ntBASIC10.89□□□□□ -0.67
Pdzd2E9Q1M1 Gm45684-201ENSMUST00000210244 1571 ntBASIC10.89□□□□□ -0.67
Pdzd2E9Q1M1 1700029H14Rik-205ENSMUST00000187391 1408 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Pdzd2E9Q1M1 Hist1h4b-201ENSMUST00000102965 397 ntAPPRIS P1 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Pdzd2E9Q1M1 Gm23200-201ENSMUST00000104379 132 ntBASIC10.89□□□□□ -0.67
Pdzd2E9Q1M1 Rhox2f-201ENSMUST00000115173 799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Pdzd2E9Q1M1 Nbdy-201ENSMUST00000140575 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Pdzd2E9Q1M1 Nbdy-202ENSMUST00000149514 775 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Pdzd2E9Q1M1 Gm7008-202ENSMUST00000170019 402 ntTSL 2 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Pdzd2E9Q1M1 Gm2453-202ENSMUST00000195508 568 ntTSL 3 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Pdzd2E9Q1M1 Gm42797-201ENSMUST00000197573 494 ntTSL 3 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Pdzd2E9Q1M1 Tmem210-201ENSMUST00000028340 516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Pdzd2E9Q1M1 Gm3402-201ENSMUST00000036715 981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Pdzd2E9Q1M1 Slc20a2-201ENSMUST00000067786 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Pdzd2E9Q1M1 Prkar2b-202ENSMUST00000036497 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Pdzd2E9Q1M1 Mturn-203ENSMUST00000190641 5303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Pdzd2E9Q1M1 Ttyh3-202ENSMUST00000197452 4576 ntTSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Pdzd2E9Q1M1 Kazn-201ENSMUST00000036476 3843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Pdzd2E9Q1M1 Muc20-201ENSMUST00000041123 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Pdzd2E9Q1M1 Aurka-202ENSMUST00000109139 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Pdzd2E9Q1M1 Amhr2-201ENSMUST00000023809 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Pdzd2E9Q1M1 Aurka-201ENSMUST00000028997 1905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Pdzd2E9Q1M1 Atat1-201ENSMUST00000056034 1930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Pdzd2E9Q1M1 Ythdf3-203ENSMUST00000191774 3196 ntTSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Pdzd2E9Q1M1 Avpr2-201ENSMUST00000033765 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Pdzd2E9Q1M1 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC10.89□□□□□ -0.67
Pdzd2E9Q1M1 Gm17501-201ENSMUST00000181247 1700 ntTSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Pdzd2E9Q1M1 Gm14451-201ENSMUST00000121581 1542 ntBASIC10.89□□□□□ -0.67
Pdzd2E9Q1M1 Casp7-201ENSMUST00000026062 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Pdzd2E9Q1M1 Itfg1-201ENSMUST00000034140 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Pdzd2E9Q1M1 Pgm1-201ENSMUST00000087324 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Pdzd2E9Q1M1 Gli1-201ENSMUST00000026474 4057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Pdzd2E9Q1M1 Gm8862-201ENSMUST00000198379 1346 ntBASIC10.89□□□□□ -0.67
Pdzd2E9Q1M1 Rhox2c-201ENSMUST00000115190 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Pdzd2E9Q1M1 Iqcf1-202ENSMUST00000164965 523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Pdzd2E9Q1M1 Gm20636-201ENSMUST00000176660 707 ntTSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Pdzd2E9Q1M1 Anapc16-205ENSMUST00000182912 566 ntTSL 2 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Pdzd2E9Q1M1 Gm44064-201ENSMUST00000204964 1087 ntBASIC10.89□□□□□ -0.67
Pdzd2E9Q1M1 Gm8285-201ENSMUST00000208293 759 ntBASIC10.89□□□□□ -0.67
Pdzd2E9Q1M1 Mir497b-201ENSMUST00000093601 125 ntBASIC10.89□□□□□ -0.67
Pdzd2E9Q1M1 Nr1d1-201ENSMUST00000064941 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Pdzd2E9Q1M1 Sgk1-202ENSMUST00000092673 2576 ntTSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.5 ms