Protein–RNA interactions for Protein: E9PZQ0

Ryr1, Ryanodine receptor 1, mousemouse

Predictions only

Length 5,035 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ryr1E9PZQ0 Gm26858-201ENSMUST00000180608 2040 ntTSL 5 BASIC8.79□□□□□ -1
Ryr1E9PZQ0 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.79□□□□□ -1
Ryr1E9PZQ0 Ormdl2-201ENSMUST00000026409 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.79□□□□□ -1
Ryr1E9PZQ0 Ramp1-201ENSMUST00000097648 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.79□□□□□ -1
Ryr1E9PZQ0 BC026585-202ENSMUST00000119891 1125 ntTSL 1 (best) BASIC8.79□□□□□ -1
Ryr1E9PZQ0 Tex22-201ENSMUST00000012355 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.79□□□□□ -1
Ryr1E9PZQ0 Gm26957-201ENSMUST00000182645 977 ntBASIC8.79□□□□□ -1
Ryr1E9PZQ0 Gm8756-201ENSMUST00000183250 929 ntBASIC8.79□□□□□ -1
Ryr1E9PZQ0 Mt2-202ENSMUST00000212806 388 ntTSL 2 BASIC8.79□□□□□ -1
Ryr1E9PZQ0 Atp5j2-201ENSMUST00000037056 540 ntTSL 5 BASIC8.79□□□□□ -1
Ryr1E9PZQ0 Olfr223-201ENSMUST00000061293 1111 ntAPPRIS P1 BASIC8.79□□□□□ -1
Ryr1E9PZQ0 Trim15-203ENSMUST00000174195 1778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.79□□□□□ -1
Ryr1E9PZQ0 Aifm1-202ENSMUST00000114945 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.79□□□□□ -1
Ryr1E9PZQ0 Slc41a3-202ENSMUST00000044019 2412 ntTSL 1 (best) BASIC8.79□□□□□ -1
Ryr1E9PZQ0 Hnrnpl-202ENSMUST00000172529 1898 ntTSL 5 BASIC8.79□□□□□ -1
Ryr1E9PZQ0 Rarb-207ENSMUST00000225921 2756 ntBASIC8.79□□□□□ -1
Ryr1E9PZQ0 Sox14-201ENSMUST00000054819 2065 ntAPPRIS P1 BASIC8.79□□□□□ -1
Ryr1E9PZQ0 Gcnt2-205ENSMUST00000225759 1366 ntAPPRIS ALT2 BASIC8.79□□□□□ -1
Ryr1E9PZQ0 D130052B06Rik-201ENSMUST00000101371 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.79□□□□□ -1
Ryr1E9PZQ0 Isg20-203ENSMUST00000120331 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.78□□□□□ -1
Ryr1E9PZQ0 Ncf4-201ENSMUST00000096357 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.78□□□□□ -1
Ryr1E9PZQ0 Tmem163-203ENSMUST00000160616 2657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.78□□□□□ -1
Ryr1E9PZQ0 4930524O07Rik-203ENSMUST00000193135 2289 ntBASIC8.78□□□□□ -1
Ryr1E9PZQ0 Sulf2-201ENSMUST00000088086 3927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.78□□□□□ -1
Ryr1E9PZQ0 Gm11618-201ENSMUST00000117946 267 ntBASIC8.78□□□□□ -1
Ryr1E9PZQ0 Gm28037-201ENSMUST00000122365 611 ntTSL 3 BASIC8.78□□□□□ -1
Ryr1E9PZQ0 Ighv5-7-201ENSMUST00000192302 244 ntBASIC8.78□□□□□ -1
Ryr1E9PZQ0 Gm37246-201ENSMUST00000192665 835 ntBASIC8.78□□□□□ -1
Ryr1E9PZQ0 Gm45570-201ENSMUST00000211137 495 ntTSL 5 BASIC8.78□□□□□ -1
Ryr1E9PZQ0 Prss34-201ENSMUST00000037453 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.78□□□□□ -1
Ryr1E9PZQ0 Ccdc149-201ENSMUST00000059428 3295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.78□□□□□ -1
Ryr1E9PZQ0 Scube2-202ENSMUST00000106728 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.78□□□□□ -1
Ryr1E9PZQ0 AC153526.5-201ENSMUST00000218661 2147 ntBASIC8.78□□□□□ -1
Ryr1E9PZQ0 Fam114a2-201ENSMUST00000020831 2557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.78□□□□□ -1
Ryr1E9PZQ0 Tead3-207ENSMUST00000219703 1320 ntTSL 1 (best) BASIC8.78□□□□□ -1
Ryr1E9PZQ0 Slc29a1-202ENSMUST00000064889 1988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.78□□□□□ -1
Ryr1E9PZQ0 Elovl3-201ENSMUST00000043739 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.78□□□□□ -1
Ryr1E9PZQ0 Cdc42ep2-201ENSMUST00000055458 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.78□□□□□ -1
Ryr1E9PZQ0 Cds1-201ENSMUST00000031273 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.78□□□□□ -1
Ryr1E9PZQ0 Ciz1-201ENSMUST00000048964 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.78□□□□□ -1
Ryr1E9PZQ0 Kcnq2-201ENSMUST00000016491 3067 ntTSL 1 (best) BASIC8.78□□□□□ -1
Ryr1E9PZQ0 Rps3-201ENSMUST00000032998 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.78□□□□□ -1
Ryr1E9PZQ0 Klhdc4-201ENSMUST00000045884 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.78□□□□□ -1
Ryr1E9PZQ0 Rpl41-201ENSMUST00000176010 582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.78□□□□□ -1
Ryr1E9PZQ0 Rpl41-204ENSMUST00000176906 509 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC8.78□□□□□ -1
Ryr1E9PZQ0 Cd63-204ENSMUST00000219317 1109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.78□□□□□ -1
Ryr1E9PZQ0 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.78□□□□□ -1
Ryr1E9PZQ0 Car6-201ENSMUST00000030817 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.78□□□□□ -1
Ryr1E9PZQ0 Rgs6-203ENSMUST00000185665 2201 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC8.78□□□□□ -1
Ryr1E9PZQ0 Rbm47-203ENSMUST00000113724 2186 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC8.78□□□□□ -1
Ryr1E9PZQ0 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC8.78□□□□□ -1
Ryr1E9PZQ0 Gm12363-201ENSMUST00000122250 668 ntBASIC8.78□□□□□ -1
Ryr1E9PZQ0 Osgep-207ENSMUST00000162177 1219 ntTSL 1 (best) BASIC8.78□□□□□ -1
Ryr1E9PZQ0 Ip6k2-202ENSMUST00000192028 1199 ntTSL 1 (best) BASIC8.78□□□□□ -1
Ryr1E9PZQ0 Cinp-204ENSMUST00000221102 536 ntTSL 2 BASIC8.78□□□□□ -1
Ryr1E9PZQ0 Gm5544-201ENSMUST00000098828 891 ntTSL 1 (best) BASIC8.78□□□□□ -1
Ryr1E9PZQ0 Gm26565-201ENSMUST00000181642 1968 ntTSL 5 BASIC8.78□□□□□ -1
Ryr1E9PZQ0 A830012C17Rik-201ENSMUST00000131498 1665 ntTSL 1 (best) BASIC8.78□□□□□ -1
Ryr1E9PZQ0 Nkpd1-201ENSMUST00000078908 2753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.78□□□□□ -1
Ryr1E9PZQ0 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.77□□□□□ -1
Ryr1E9PZQ0 Ifna2-201ENSMUST00000105147 1032 ntAPPRIS P1 BASIC8.77□□□□□ -1
Ryr1E9PZQ0 Rwdd3-205ENSMUST00000106467 1158 ntTSL 1 (best) BASIC8.77□□□□□ -1
Ryr1E9PZQ0 Gm11451-201ENSMUST00000118946 630 ntBASIC8.77□□□□□ -1
Ryr1E9PZQ0 Gm16305-201ENSMUST00000140747 556 ntBASIC8.77□□□□□ -1
Ryr1E9PZQ0 Pde4b-210ENSMUST00000172616 823 ntTSL 5 BASIC8.77□□□□□ -1
Ryr1E9PZQ0 Rassf4-202ENSMUST00000203029 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.77□□□□□ -1
Ryr1E9PZQ0 AC162938.2-204ENSMUST00000216455 984 ntTSL 5 BASIC8.77□□□□□ -1
Ryr1E9PZQ0 Gjb6-201ENSMUST00000039380 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.77□□□□□ -1
Ryr1E9PZQ0 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.77□□□□□ -1.01
Ryr1E9PZQ0 Gngt2-201ENSMUST00000036088 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.77□□□□□ -1.01
Ryr1E9PZQ0 Kcnn1-208ENSMUST00000212611 2528 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.77□□□□□ -1.01
Ryr1E9PZQ0 Ywhaz-203ENSMUST00000110361 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.77□□□□□ -1.01
Ryr1E9PZQ0 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.77□□□□□ -1.01
Ryr1E9PZQ0 Tpgs2-202ENSMUST00000148255 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.77□□□□□ -1.01
Ryr1E9PZQ0 Wdr1-205ENSMUST00000201260 2139 ntTSL 1 (best) BASIC8.77□□□□□ -1.01
Ryr1E9PZQ0 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.77□□□□□ -1.01
Ryr1E9PZQ0 Spint5-201ENSMUST00000103097 443 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.77□□□□□ -1.01
Ryr1E9PZQ0 Gm23270-201ENSMUST00000104055 131 ntBASIC8.77□□□□□ -1.01
Ryr1E9PZQ0 9230102O04Rik-201ENSMUST00000114915 528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.77□□□□□ -1.01
Ryr1E9PZQ0 Spint5-202ENSMUST00000180193 443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.77□□□□□ -1.01
Ryr1E9PZQ0 Mir6998-201ENSMUST00000183343 64 ntBASIC8.77□□□□□ -1.01
Ryr1E9PZQ0 Gm42550-201ENSMUST00000201553 960 ntBASIC8.77□□□□□ -1.01
Ryr1E9PZQ0 Them5-201ENSMUST00000029794 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.77□□□□□ -1.01
Ryr1E9PZQ0 Sertm1-202ENSMUST00000162201 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.77□□□□□ -1.01
Ryr1E9PZQ0 Fbxo9-202ENSMUST00000085311 2155 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC8.77□□□□□ -1.01
Ryr1E9PZQ0 Mycn-201ENSMUST00000043396 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.77□□□□□ -1.01
Ryr1E9PZQ0 Gsdmd-201ENSMUST00000023238 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.77□□□□□ -1.01
Ryr1E9PZQ0 Mpp4-201ENSMUST00000066374 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.77□□□□□ -1.01
Ryr1E9PZQ0 Mpp4-202ENSMUST00000078874 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.77□□□□□ -1.01
Ryr1E9PZQ0 Ube2z-201ENSMUST00000100528 3997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.77□□□□□ -1.01
Ryr1E9PZQ0 Gm5106-201ENSMUST00000181058 1334 ntTSL 1 (best) BASIC8.77□□□□□ -1.01
Ryr1E9PZQ0 AI606473-201ENSMUST00000177201 1731 ntTSL 1 (best) BASIC8.77□□□□□ -1.01
Ryr1E9PZQ0 6430573F11Rik-202ENSMUST00000135373 2573 ntTSL 1 (best) BASIC8.77□□□□□ -1.01
Ryr1E9PZQ0 Acadl-201ENSMUST00000027153 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.77□□□□□ -1.01
Ryr1E9PZQ0 Snx17-201ENSMUST00000031029 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.77□□□□□ -1.01
Ryr1E9PZQ0 Gm6506-201ENSMUST00000119775 1136 ntBASIC8.77□□□□□ -1.01
Ryr1E9PZQ0 Rpl13-ps4-201ENSMUST00000194776 628 ntBASIC8.77□□□□□ -1.01
Ryr1E9PZQ0 Gm42657-201ENSMUST00000201746 211 ntBASIC8.77□□□□□ -1.01
Ryr1E9PZQ0 Gm3619-201ENSMUST00000219947 775 ntBASIC8.77□□□□□ -1.01
Ryr1E9PZQ0 CT030653.1-201ENSMUST00000224382 1279 ntBASIC8.77□□□□□ -1.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.9 ms