Protein–RNA interactions for Protein: E9PZ54

Gcom1, GRINL1A complex locus, mousemouse

Predictions only

Length 550 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gcom1E9PZ54 Gm6198-201ENSMUST00000191337 2929 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Gcom1E9PZ54 Gm2420-202ENSMUST00000202224 2249 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Gcom1E9PZ54 Etl4-201ENSMUST00000045555 5931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gcom1E9PZ54 P2rx3-202ENSMUST00000111613 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gcom1E9PZ54 Srgn-204ENSMUST00000160987 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gcom1E9PZ54 Ntng2-204ENSMUST00000102873 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gcom1E9PZ54 Vwa8-201ENSMUST00000040990 7054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gcom1E9PZ54 Hdac7-202ENSMUST00000088402 4223 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gcom1E9PZ54 Lancl1-203ENSMUST00000119559 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gcom1E9PZ54 Gm13294-201ENSMUST00000121757 1330 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Gcom1E9PZ54 Nup205-204ENSMUST00000201374 6411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gcom1E9PZ54 Zfp74-203ENSMUST00000108211 1278 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gcom1E9PZ54 Map2k3os-201ENSMUST00000123544 1291 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gcom1E9PZ54 1810062O18Rik-203ENSMUST00000129237 647 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gcom1E9PZ54 1500015A07Rik-203ENSMUST00000184678 890 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gcom1E9PZ54 Gm10459-201ENSMUST00000202708 1155 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Gcom1E9PZ54 Tssc4-208ENSMUST00000208779 647 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gcom1E9PZ54 Ly6d-201ENSMUST00000040404 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gcom1E9PZ54 Tdg-208ENSMUST00000151390 3502 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gcom1E9PZ54 Gucd1-201ENSMUST00000039796 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gcom1E9PZ54 Keap1-205ENSMUST00000194542 3151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gcom1E9PZ54 Hmx2-201ENSMUST00000051997 3102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gcom1E9PZ54 Rarg-201ENSMUST00000043172 2953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gcom1E9PZ54 Prrc2a-201ENSMUST00000025253 6888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gcom1E9PZ54 Prrc2b-201ENSMUST00000036691 8612 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gcom1E9PZ54 Avpr1a-201ENSMUST00000020323 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gcom1E9PZ54 Eif2d-202ENSMUST00000068805 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gcom1E9PZ54 Pdpk1-204ENSMUST00000115409 4623 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gcom1E9PZ54 Il11-201ENSMUST00000094892 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gcom1E9PZ54 Zfp467-203ENSMUST00000114558 3115 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gcom1E9PZ54 Stra8-201ENSMUST00000031876 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gcom1E9PZ54 AC025913.2-201ENSMUST00000220136 1766 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Gcom1E9PZ54 P4hb-201ENSMUST00000026122 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gcom1E9PZ54 Ywhag-205ENSMUST00000198270 1610 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gcom1E9PZ54 Sbno2-209ENSMUST00000219260 4850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gcom1E9PZ54 Krt42-201ENSMUST00000017270 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gcom1E9PZ54 Fam20a-201ENSMUST00000020938 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gcom1E9PZ54 Ripor2-201ENSMUST00000038477 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gcom1E9PZ54 Rbak-201ENSMUST00000049861 3335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gcom1E9PZ54 Il7-205ENSMUST00000194279 4858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gcom1E9PZ54 Tmem86b-202ENSMUST00000205360 1344 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gcom1E9PZ54 Park7-203ENSMUST00000105674 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gcom1E9PZ54 Gm7153-201ENSMUST00000117092 455 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Gcom1E9PZ54 Lgals3-204ENSMUST00000150290 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gcom1E9PZ54 Gm8584-201ENSMUST00000171982 758 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Gcom1E9PZ54 Gm17971-201ENSMUST00000190239 806 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Gcom1E9PZ54 AC161829.1-201ENSMUST00000220298 281 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Gcom1E9PZ54 CR974585.1-201ENSMUST00000221790 1263 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gcom1E9PZ54 Ndufs8-201ENSMUST00000075092 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gcom1E9PZ54 Ak1-202ENSMUST00000113277 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gcom1E9PZ54 Edrf1-202ENSMUST00000128901 4380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gcom1E9PZ54 Rdh10-201ENSMUST00000027053 3587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gcom1E9PZ54 Car10-203ENSMUST00000107858 2742 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gcom1E9PZ54 Pank1-201ENSMUST00000036584 3460 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gcom1E9PZ54 Iah1-204ENSMUST00000223345 1890 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gcom1E9PZ54 Syt10-201ENSMUST00000029441 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gcom1E9PZ54 Snx22-201ENSMUST00000044711 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gcom1E9PZ54 Rnf114-201ENSMUST00000078050 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gcom1E9PZ54 Cyp20a1-201ENSMUST00000060608 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gcom1E9PZ54 Erfe-201ENSMUST00000086861 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gcom1E9PZ54 Stip1-201ENSMUST00000025918 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gcom1E9PZ54 Sec62-201ENSMUST00000029256 3967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gcom1E9PZ54 Lrfn2-201ENSMUST00000046254 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gcom1E9PZ54 Gm8909-203ENSMUST00000173353 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gcom1E9PZ54 Sytl1-201ENSMUST00000030674 1951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gcom1E9PZ54 Trim52-201ENSMUST00000022708 3075 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gcom1E9PZ54 Ntf3-202ENSMUST00000112244 1399 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gcom1E9PZ54 Gm38102-201ENSMUST00000192791 1935 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Gcom1E9PZ54 Scml4-203ENSMUST00000105495 1033 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gcom1E9PZ54 Park7-204ENSMUST00000105675 882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gcom1E9PZ54 Gm6184-201ENSMUST00000120403 1261 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Gcom1E9PZ54 Gm12536-201ENSMUST00000129102 358 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gcom1E9PZ54 Gm16295-201ENSMUST00000139512 643 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gcom1E9PZ54 Fbxo17-205ENSMUST00000167118 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gcom1E9PZ54 H2-Bl-211ENSMUST00000195838 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gcom1E9PZ54 Gm45144-201ENSMUST00000207473 354 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gcom1E9PZ54 5033428I22Rik-203ENSMUST00000210614 952 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gcom1E9PZ54 Tmem52-201ENSMUST00000023920 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gcom1E9PZ54 Rph3al-202ENSMUST00000066504 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gcom1E9PZ54 Isg15-201ENSMUST00000085425 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gcom1E9PZ54 Kcnma1-214ENSMUST00000190044 3747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gcom1E9PZ54 Kcnq2-207ENSMUST00000103050 2713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gcom1E9PZ54 Neu2-203ENSMUST00000164128 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gcom1E9PZ54 Snai3-201ENSMUST00000006762 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gcom1E9PZ54 B3galnt2-201ENSMUST00000099747 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gcom1E9PZ54 Slc37a1-201ENSMUST00000165149 3354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gcom1E9PZ54 Map2k7-211ENSMUST00000145165 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gcom1E9PZ54 Pfkfb3-205ENSMUST00000114845 1971 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gcom1E9PZ54 Gm29530-201ENSMUST00000187556 1956 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gcom1E9PZ54 Nphp4-201ENSMUST00000056567 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gcom1E9PZ54 Tial1-203ENSMUST00000106228 2835 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gcom1E9PZ54 Trim80-201ENSMUST00000093914 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gcom1E9PZ54 Osbpl10-201ENSMUST00000046627 1872 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gcom1E9PZ54 Zfp367-201ENSMUST00000059817 3532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gcom1E9PZ54 Amz1-201ENSMUST00000060918 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gcom1E9PZ54 Evx1os-201ENSMUST00000125305 2916 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gcom1E9PZ54 Wdr36-202ENSMUST00000166214 2942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gcom1E9PZ54 Pcdh19-202ENSMUST00000149154 10289 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gcom1E9PZ54 Dnmt3a-201ENSMUST00000020991 9685 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gcom1E9PZ54 Spag9-202ENSMUST00000041956 7340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.8 ms