Protein–RNA interactions for Protein: E9PYQ0

Rsph10b, Radial spoke head 10 homolog B (Chlamydomonas), mousemouse

Predictions only

Length 876 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rsph10bE9PYQ0 Erbb2-201ENSMUST00000058295 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rsph10bE9PYQ0 Pafah1b1-202ENSMUST00000102520 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rsph10bE9PYQ0 Stra8-202ENSMUST00000114997 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rsph10bE9PYQ0 Serpinf1-202ENSMUST00000125982 605 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rsph10bE9PYQ0 Gm11795-201ENSMUST00000127180 396 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rsph10bE9PYQ0 Noct-203ENSMUST00000167780 2992 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rsph10bE9PYQ0 Gm10275-202ENSMUST00000168697 495 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Rsph10bE9PYQ0 Gm43474-201ENSMUST00000196415 774 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Rsph10bE9PYQ0 Gm2213-201ENSMUST00000197485 688 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Rsph10bE9PYQ0 Atf5-203ENSMUST00000209072 595 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rsph10bE9PYQ0 Ppcdc-205ENSMUST00000214144 724 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rsph10bE9PYQ0 Chchd1-203ENSMUST00000224633 557 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Rsph10bE9PYQ0 AC102291.3-201ENSMUST00000226566 405 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Rsph10bE9PYQ0 Rxfp4-201ENSMUST00000063119 1245 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rsph10bE9PYQ0 Stx5a-202ENSMUST00000073430 2112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rsph10bE9PYQ0 Gm10275-201ENSMUST00000092620 635 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Rsph10bE9PYQ0 Ulk1-211ENSMUST00000200299 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rsph10bE9PYQ0 Ywhag-205ENSMUST00000198270 1610 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rsph10bE9PYQ0 Zfp853-201ENSMUST00000180336 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rsph10bE9PYQ0 Zhx3-203ENSMUST00000109460 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rsph10bE9PYQ0 Sh3bp5-201ENSMUST00000091903 2684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rsph10bE9PYQ0 Cldn14-204ENSMUST00000169391 1456 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.14
Rsph10bE9PYQ0 Ankra2-208ENSMUST00000226100 1476 ntBASIC15.96■□□□□ 0.14
Rsph10bE9PYQ0 Rnf34-201ENSMUST00000031434 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Rsph10bE9PYQ0 Ffar2-202ENSMUST00000163504 1913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.14
Rsph10bE9PYQ0 Dnajc22-201ENSMUST00000061295 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Rsph10bE9PYQ0 Dlgap3-201ENSMUST00000046659 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rsph10bE9PYQ0 Klhdc4-210ENSMUST00000174717 1662 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rsph10bE9PYQ0 Tial1-203ENSMUST00000106228 2835 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rsph10bE9PYQ0 Espn-220ENSMUST00000207676 4618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rsph10bE9PYQ0 Olfr683-202ENSMUST00000209879 3841 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rsph10bE9PYQ0 Clcc1-201ENSMUST00000029483 2224 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rsph10bE9PYQ0 Pcp2-202ENSMUST00000128566 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rsph10bE9PYQ0 Tcf4-253ENSMUST00000202610 1959 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rsph10bE9PYQ0 Slc8a3-203ENSMUST00000182208 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rsph10bE9PYQ0 Elf3-201ENSMUST00000003135 2095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rsph10bE9PYQ0 Pcdhga8-201ENSMUST00000066149 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rsph10bE9PYQ0 Zfp606-201ENSMUST00000098822 4748 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rsph10bE9PYQ0 Nnat-209ENSMUST00000173793 386 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rsph10bE9PYQ0 Smco4-202ENSMUST00000178999 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rsph10bE9PYQ0 Nckipsd-206ENSMUST00000195323 467 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rsph10bE9PYQ0 Smco4-201ENSMUST00000045620 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rsph10bE9PYQ0 Eaf1-201ENSMUST00000022446 4918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rsph10bE9PYQ0 Rnf167-201ENSMUST00000037534 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rsph10bE9PYQ0 Gm10125-203ENSMUST00000161096 3493 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rsph10bE9PYQ0 Krt20-201ENSMUST00000017743 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rsph10bE9PYQ0 Serpinh1-201ENSMUST00000094154 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rsph10bE9PYQ0 Sh2b3-202ENSMUST00000086310 4195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rsph10bE9PYQ0 Tjap1-211ENSMUST00000225080 2412 ntAPPRIS P2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rsph10bE9PYQ0 Plxdc2-203ENSMUST00000114703 2061 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rsph10bE9PYQ0 Pex12-202ENSMUST00000108146 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rsph10bE9PYQ0 Gm14221-202ENSMUST00000209603 1437 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rsph10bE9PYQ0 Etfdh-201ENSMUST00000029386 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rsph10bE9PYQ0 Gpr137b-202ENSMUST00000220628 3634 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rsph10bE9PYQ0 Gins2-201ENSMUST00000034278 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rsph10bE9PYQ0 Col5a1-201ENSMUST00000028280 8406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rsph10bE9PYQ0 Zbtb20-203ENSMUST00000114691 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rsph10bE9PYQ0 Gm6159-201ENSMUST00000191249 1724 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Rsph10bE9PYQ0 Cdk11b-203ENSMUST00000105600 3170 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rsph10bE9PYQ0 Taf7l-201ENSMUST00000009740 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rsph10bE9PYQ0 Cnot7-201ENSMUST00000034012 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rsph10bE9PYQ0 Nr1d1-201ENSMUST00000064941 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rsph10bE9PYQ0 Gm23935-201ENSMUST00000102303 57 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Rsph10bE9PYQ0 Gm24270-201ENSMUST00000102326 57 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Rsph10bE9PYQ0 Gamt-202ENSMUST00000105363 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rsph10bE9PYQ0 Dhdds-202ENSMUST00000105885 998 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rsph10bE9PYQ0 Tmsb4x-201ENSMUST00000112172 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rsph10bE9PYQ0 Ppil3-202ENSMUST00000114345 1175 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rsph10bE9PYQ0 Gm24245-201ENSMUST00000157318 57 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Rsph10bE9PYQ0 Bcl2l2-204ENSMUST00000172844 498 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rsph10bE9PYQ0 Rhox2a-202ENSMUST00000173650 735 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rsph10bE9PYQ0 Rhox2c-204ENSMUST00000184688 720 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rsph10bE9PYQ0 AC151286.1-201ENSMUST00000198489 145 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Rsph10bE9PYQ0 Smim4-204ENSMUST00000203261 1219 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rsph10bE9PYQ0 Nmur1-202ENSMUST00000212058 1287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rsph10bE9PYQ0 1700128F08Rik-202ENSMUST00000213708 717 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Rsph10bE9PYQ0 Commd9-201ENSMUST00000028584 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rsph10bE9PYQ0 Dcun1d3-203ENSMUST00000106519 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rsph10bE9PYQ0 Tcf12-201ENSMUST00000034755 4621 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rsph10bE9PYQ0 Os9-201ENSMUST00000080975 2458 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rsph10bE9PYQ0 Mrpl58-209ENSMUST00000153983 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rsph10bE9PYQ0 Foxp2-207ENSMUST00000115477 6760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rsph10bE9PYQ0 Tgfbr3-201ENSMUST00000031224 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rsph10bE9PYQ0 Gm38102-201ENSMUST00000192791 1935 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Rsph10bE9PYQ0 Ssr1-204ENSMUST00000225319 1610 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Rsph10bE9PYQ0 Bcat2-202ENSMUST00000120864 1536 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rsph10bE9PYQ0 Adgrb2-206ENSMUST00000106018 4470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rsph10bE9PYQ0 AU040320-201ENSMUST00000047431 4384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rsph10bE9PYQ0 Diaph1-202ENSMUST00000080033 4378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rsph10bE9PYQ0 Rnf103-203ENSMUST00000114179 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rsph10bE9PYQ0 Ppip5k2-201ENSMUST00000042509 5882 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rsph10bE9PYQ0 Eef2kmt-201ENSMUST00000064635 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rsph10bE9PYQ0 Kpnb1-201ENSMUST00000001479 5894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rsph10bE9PYQ0 Noct-201ENSMUST00000023849 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rsph10bE9PYQ0 Lrrc8d-201ENSMUST00000060531 3923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rsph10bE9PYQ0 Acyp1-203ENSMUST00000117138 735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rsph10bE9PYQ0 Cdk2ap2-204ENSMUST00000174514 669 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rsph10bE9PYQ0 Ssty1-201ENSMUST00000180056 699 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rsph10bE9PYQ0 Gm29310-201ENSMUST00000185468 696 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Rsph10bE9PYQ0 Gm21825-201ENSMUST00000185728 696 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57.8 ms