Protein–RNA interactions for Protein: E9PWW9

Rsf1, Remodeling and spacing factor 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,441 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rsf1E9PWW9 Gm43138-201ENSMUST00000199123 708 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
Rsf1E9PWW9 Mrto4-ps1-201ENSMUST00000220565 721 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
Rsf1E9PWW9 Tsc22d4-201ENSMUST00000031738 1043 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Rsf1E9PWW9 Aspdh-201ENSMUST00000035929 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Rsf1E9PWW9 Gng8-201ENSMUST00000078182 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Rsf1E9PWW9 Gnb2-202ENSMUST00000111020 1470 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Rsf1E9PWW9 Slc8b1-203ENSMUST00000111889 1624 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Rsf1E9PWW9 Nrxn2-204ENSMUST00000113461 5505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Rsf1E9PWW9 Abhd3-202ENSMUST00000117726 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Rsf1E9PWW9 Trp53i11-201ENSMUST00000090554 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Rsf1E9PWW9 Iffo1-201ENSMUST00000117675 2833 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Rsf1E9PWW9 Hhat-201ENSMUST00000044190 2839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Rsf1E9PWW9 Wnk2-204ENSMUST00000110096 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Rsf1E9PWW9 Gm45212-201ENSMUST00000205831 3403 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
Rsf1E9PWW9 Tcf3-209ENSMUST00000105345 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Rsf1E9PWW9 Trmt1-201ENSMUST00000001974 2567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Rsf1E9PWW9 Tpm3-201ENSMUST00000029549 2230 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Rsf1E9PWW9 Zscan22-203ENSMUST00000119989 2087 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Rsf1E9PWW9 Trim15-203ENSMUST00000174195 1778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Rsf1E9PWW9 Gm5687-201ENSMUST00000118252 640 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
Rsf1E9PWW9 4930412M03Rik-201ENSMUST00000130746 1111 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Rsf1E9PWW9 1700012C08Rik-201ENSMUST00000141554 363 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Rsf1E9PWW9 Glo1-202ENSMUST00000167624 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Rsf1E9PWW9 Dcdc2b-203ENSMUST00000179209 864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Rsf1E9PWW9 Gm27341-201ENSMUST00000183570 106 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
Rsf1E9PWW9 Gm44127-201ENSMUST00000203565 291 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Rsf1E9PWW9 Ormdl2-204ENSMUST00000219524 724 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Rsf1E9PWW9 Hace1-201ENSMUST00000037044 3785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Rsf1E9PWW9 Fam214b-202ENSMUST00000107956 3107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Rsf1E9PWW9 Itpk1-201ENSMUST00000046518 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Rsf1E9PWW9 Slc32a1-201ENSMUST00000045738 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Rsf1E9PWW9 Tfeb-201ENSMUST00000024786 2296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Rsf1E9PWW9 Nlrx1-203ENSMUST00000169651 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Rsf1E9PWW9 Ddc-210ENSMUST00000178704 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Rsf1E9PWW9 Slc22a20-201ENSMUST00000041827 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Rsf1E9PWW9 Krt36-201ENSMUST00000107416 1671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Rsf1E9PWW9 Nr1d1-201ENSMUST00000064941 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Rsf1E9PWW9 Dhx30-224ENSMUST00000200066 4623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Rsf1E9PWW9 Map3k6-201ENSMUST00000030677 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Rsf1E9PWW9 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Rsf1E9PWW9 Cpeb3-208ENSMUST00000132580 3148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Rsf1E9PWW9 Cdk3-ps-202ENSMUST00000174177 915 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Rsf1E9PWW9 Gm26830-201ENSMUST00000180389 993 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Rsf1E9PWW9 Gm26728-201ENSMUST00000185268 595 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Rsf1E9PWW9 Mea1-201ENSMUST00000002845 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Rsf1E9PWW9 1700018B08Rik-201ENSMUST00000034265 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Rsf1E9PWW9 Obp2a-201ENSMUST00000077667 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Rsf1E9PWW9 1700012B07Rik-202ENSMUST00000106674 2035 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Rsf1E9PWW9 Pycr1-201ENSMUST00000026133 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Rsf1E9PWW9 Fzd10-201ENSMUST00000117102 3250 ntAPPRIS P1 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Rsf1E9PWW9 Mfsd6l-201ENSMUST00000053211 2060 ntAPPRIS P1 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Rsf1E9PWW9 Gm5779-202ENSMUST00000219564 1477 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Rsf1E9PWW9 AC113441.2-201ENSMUST00000221538 1468 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
Rsf1E9PWW9 Gm45630-201ENSMUST00000210243 1911 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
Rsf1E9PWW9 Zfp384-202ENSMUST00000054553 2451 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Rsf1E9PWW9 Ankrd50-201ENSMUST00000094300 1944 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Rsf1E9PWW9 Cct6b-202ENSMUST00000100722 1871 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Rsf1E9PWW9 Mypopos-201ENSMUST00000124897 560 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Rsf1E9PWW9 C030017D09Rik-201ENSMUST00000163690 923 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Rsf1E9PWW9 Il15-202ENSMUST00000209363 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Rsf1E9PWW9 Rpl10a-201ENSMUST00000042334 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Rsf1E9PWW9 Il27-201ENSMUST00000058429 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Rsf1E9PWW9 Fam173a-201ENSMUST00000072735 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Rsf1E9PWW9 Ifngr2-201ENSMUST00000023687 3254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Rsf1E9PWW9 Rnf4-207ENSMUST00000182709 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Rsf1E9PWW9 Rnase10-201ENSMUST00000022424 1629 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Rsf1E9PWW9 Gm17108-201ENSMUST00000168625 2877 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Rsf1E9PWW9 Sgce-202ENSMUST00000090686 1547 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Rsf1E9PWW9 Gm43289-201ENSMUST00000200537 1475 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
Rsf1E9PWW9 Plbd2-201ENSMUST00000031597 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Rsf1E9PWW9 Grin1os-201ENSMUST00000129723 2891 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Rsf1E9PWW9 Trappc12-203ENSMUST00000170994 2818 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Rsf1E9PWW9 Gm12997-201ENSMUST00000120207 640 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
Rsf1E9PWW9 Gm22902-201ENSMUST00000158488 302 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
Rsf1E9PWW9 Tmem255b-202ENSMUST00000167505 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Rsf1E9PWW9 St13-201ENSMUST00000023039 1089 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Rsf1E9PWW9 Gm9955-201ENSMUST00000067987 309 ntAPPRIS P1 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Rsf1E9PWW9 Gm43509-201ENSMUST00000196551 2594 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
Rsf1E9PWW9 Oprm1-214ENSMUST00000105605 1503 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Rsf1E9PWW9 Neurog3-201ENSMUST00000050103 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Rsf1E9PWW9 Oprm1-201ENSMUST00000000783 1500 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Rsf1E9PWW9 Chst3-202ENSMUST00000135158 6108 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Rsf1E9PWW9 Lcorl-202ENSMUST00000045586 5708 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Rsf1E9PWW9 Lgi3-201ENSMUST00000047331 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Rsf1E9PWW9 Gpr160-203ENSMUST00000108259 1916 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Rsf1E9PWW9 Mfsd4b5-205ENSMUST00000170579 1554 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Rsf1E9PWW9 Gm15738-202ENSMUST00000140892 427 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Rsf1E9PWW9 4930407G08Rik-201ENSMUST00000145831 698 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Rsf1E9PWW9 Atp6v0c-ps1-201ENSMUST00000206596 463 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
Rsf1E9PWW9 AC140406.1-201ENSMUST00000226481 465 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
Rsf1E9PWW9 Gm2762-202ENSMUST00000201517 2339 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Rsf1E9PWW9 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Rsf1E9PWW9 Ppp1r12b-202ENSMUST00000086444 3137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Rsf1E9PWW9 Nol4l-201ENSMUST00000035346 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Rsf1E9PWW9 Emc8-201ENSMUST00000034277 4942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Rsf1E9PWW9 Foxc2-201ENSMUST00000054691 2725 ntAPPRIS P1 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Rsf1E9PWW9 AC140354.1-201ENSMUST00000219499 2425 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Rsf1E9PWW9 Alox5-201ENSMUST00000026795 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
Rsf1E9PWW9 Ugcg-201ENSMUST00000030074 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
Rsf1E9PWW9 P3h1-203ENSMUST00000102662 2977 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.5 ms