Protein–RNA interactions for Protein: E9PW72

Gm3002, Predicted gene 3002, mousemouse

Predictions only

Length 216 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm3002E9PW72 Lmcd1-201ENSMUST00000032376 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gm3002E9PW72 Cul3-201ENSMUST00000163119 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gm3002E9PW72 Ncs1-201ENSMUST00000000199 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gm3002E9PW72 Pitpnm1-202ENSMUST00000100022 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gm3002E9PW72 Gm13883-201ENSMUST00000150450 1404 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gm3002E9PW72 Vsig10-202ENSMUST00000111967 4236 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Gm3002E9PW72 Pou5f1-201ENSMUST00000025271 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gm3002E9PW72 Foxp2-207ENSMUST00000115477 6760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gm3002E9PW72 Rph3al-203ENSMUST00000108420 695 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
Gm3002E9PW72 Id1-202ENSMUST00000109824 1160 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.04■□□□□ -0
Gm3002E9PW72 Gm16000-201ENSMUST00000146657 447 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
Gm3002E9PW72 Spata3-209ENSMUST00000152501 743 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gm3002E9PW72 Gm23984-201ENSMUST00000157139 203 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Gm3002E9PW72 Gm45668-201ENSMUST00000211271 493 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Gm3002E9PW72 AC153937.4-201ENSMUST00000218479 661 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
Gm3002E9PW72 Batf3-201ENSMUST00000027943 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gm3002E9PW72 Uqcr10-201ENSMUST00000058407 434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gm3002E9PW72 Hist1h3b-201ENSMUST00000091703 620 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
Gm3002E9PW72 Cgn-202ENSMUST00000107273 5016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gm3002E9PW72 Prkcd-207ENSMUST00000112210 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gm3002E9PW72 Traf7-210ENSMUST00000176353 2503 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gm3002E9PW72 Dlg1-201ENSMUST00000023454 3725 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gm3002E9PW72 BC005537-201ENSMUST00000019276 5849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gm3002E9PW72 Foxp1-208ENSMUST00000113329 1926 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gm3002E9PW72 Cgnl1-203ENSMUST00000122065 4487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gm3002E9PW72 Zfp184-202ENSMUST00000102978 3198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Gm3002E9PW72 Rnf146-201ENSMUST00000037548 4402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
Gm3002E9PW72 Rsbn1l-201ENSMUST00000036489 5550 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Gm3002E9PW72 Ncf1-205ENSMUST00000144086 2882 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
Gm3002E9PW72 Tepsin-203ENSMUST00000106225 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Gm3002E9PW72 Poli-201ENSMUST00000043286 2591 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gm3002E9PW72 Gnb4-201ENSMUST00000108234 2510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gm3002E9PW72 Zfp683-201ENSMUST00000105884 1471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Gm3002E9PW72 Cacnb1-201ENSMUST00000017552 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gm3002E9PW72 Ubn2-201ENSMUST00000039127 4243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gm3002E9PW72 Spidr-201ENSMUST00000040248 3279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gm3002E9PW72 Cspg5-204ENSMUST00000197850 7868 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Gm3002E9PW72 Hpse-201ENSMUST00000045617 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gm3002E9PW72 Hoxd8-203ENSMUST00000151380 557 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
Gm3002E9PW72 Senp1-204ENSMUST00000180657 3806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gm3002E9PW72 1700022A21Rik-201ENSMUST00000182745 1051 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Gm3002E9PW72 Dap-204ENSMUST00000186425 597 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
Gm3002E9PW72 Gm37917-201ENSMUST00000194711 392 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Gm3002E9PW72 Gm8515-201ENSMUST00000194852 576 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Gm3002E9PW72 Ighv8-14-201ENSMUST00000196781 358 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Gm3002E9PW72 Gm18018-201ENSMUST00000198273 408 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Gm3002E9PW72 Gm42846-201ENSMUST00000201771 514 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
Gm3002E9PW72 Cplx3-202ENSMUST00000215487 594 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
Gm3002E9PW72 AC159619.3-201ENSMUST00000222694 473 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Gm3002E9PW72 Oxt-201ENSMUST00000028764 537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gm3002E9PW72 Ins1-201ENSMUST00000039652 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gm3002E9PW72 Gm15823-201ENSMUST00000064305 670 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Gm3002E9PW72 Spns1-202ENSMUST00000119754 2001 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Gm3002E9PW72 Sytl1-201ENSMUST00000030674 1951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gm3002E9PW72 Mapk8-201ENSMUST00000022504 2587 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gm3002E9PW72 Ppp1r3d-201ENSMUST00000058678 3267 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
Gm3002E9PW72 Dlk1-205ENSMUST00000109844 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gm3002E9PW72 Zfp57-201ENSMUST00000069250 1749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gm3002E9PW72 Camta1-203ENSMUST00000105668 4962 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gm3002E9PW72 Gpt2-201ENSMUST00000034136 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gm3002E9PW72 Sez6-202ENSMUST00000093995 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gm3002E9PW72 Ly6h-207ENSMUST00000163116 2801 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
Gm3002E9PW72 Lman2l-204ENSMUST00000125304 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Gm3002E9PW72 Nup62-205ENSMUST00000208626 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Gm3002E9PW72 Nup62-201ENSMUST00000057195 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Gm3002E9PW72 Kcnq2-220ENSMUST00000197015 8031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Gm3002E9PW72 Ascc1-201ENSMUST00000050516 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Gm3002E9PW72 Krt2-201ENSMUST00000023712 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Gm3002E9PW72 1700012B07Rik-202ENSMUST00000106674 2035 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Gm3002E9PW72 Rbfox3-201ENSMUST00000017576 3150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Gm3002E9PW72 Rad18-201ENSMUST00000068487 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Gm3002E9PW72 Usp27x-203ENSMUST00000191497 4273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
Gm3002E9PW72 Gm16425-201ENSMUST00000118143 3130 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Gm3002E9PW72 Cdx4-201ENSMUST00000033689 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Gm3002E9PW72 Mcc-202ENSMUST00000164666 3606 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Gm3002E9PW72 Tm7sf2-203ENSMUST00000159084 1351 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Gm3002E9PW72 Mis12-201ENSMUST00000048807 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Gm3002E9PW72 Nt5c3b-202ENSMUST00000092689 1344 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Gm3002E9PW72 Pou2f2-209ENSMUST00000175774 7047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Gm3002E9PW72 Gm5678-201ENSMUST00000120115 939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Gm3002E9PW72 Gm13134-202ENSMUST00000144347 387 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
Gm3002E9PW72 3110053B16Rik-204ENSMUST00000145605 575 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Gm3002E9PW72 Atp6v1f-203ENSMUST00000149646 806 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Gm3002E9PW72 Cenpa-206ENSMUST00000149759 346 ntTSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
Gm3002E9PW72 Tnfrsf12a-202ENSMUST00000167059 858 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
Gm3002E9PW72 Tcta-203ENSMUST00000195615 597 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Gm3002E9PW72 Gm6745-201ENSMUST00000199216 526 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Gm3002E9PW72 Gm44608-201ENSMUST00000206827 855 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Gm3002E9PW72 Prrg2-207ENSMUST00000210500 922 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Gm3002E9PW72 Mzt2-201ENSMUST00000023351 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Gm3002E9PW72 Tnfrsf12a-201ENSMUST00000024698 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Gm3002E9PW72 Polr2g-201ENSMUST00000096261 868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Gm3002E9PW72 Gm14812-201ENSMUST00000156494 1794 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Gm3002E9PW72 Vps51-204ENSMUST00000159832 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Gm3002E9PW72 Dbn1-203ENSMUST00000109923 2940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Gm3002E9PW72 Pex11b-207ENSMUST00000165842 1562 ntTSL 2 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Gm3002E9PW72 Tesk2-203ENSMUST00000106459 2444 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Gm3002E9PW72 Gtf2ird1-208ENSMUST00000167084 3283 ntTSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Gm3002E9PW72 Sgce-202ENSMUST00000090686 1547 ntTSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Gm3002E9PW72 Lipo3-202ENSMUST00000112508 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.4 ms