Protein–RNA interactions for Protein: D3Z235

Gm3543, Predicted gene 3543, mousemouse

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Length 184 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm3543D3Z235 D6Ertd527e-204ENSMUST00000204927 2218 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Gm3543D3Z235 H60b-201ENSMUST00000105522 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Gm3543D3Z235 Styxl1-204ENSMUST00000111163 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Gm3543D3Z235 Gm11615-201ENSMUST00000156205 818 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Gm3543D3Z235 Khdc3-202ENSMUST00000167514 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Gm3543D3Z235 Mir7023-201ENSMUST00000185093 64 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
Gm3543D3Z235 4930500L23Rik-201ENSMUST00000198000 747 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
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Gm3543D3Z235 Smim8-201ENSMUST00000029972 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Gm3543D3Z235 Tex12-201ENSMUST00000034568 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Gm3543D3Z235 Pde4a-202ENSMUST00000039413 4653 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Gm3543D3Z235 Capn7-201ENSMUST00000022451 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Gm3543D3Z235 Bbs7-203ENSMUST00000108156 2687 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Gm3543D3Z235 Pja1-205ENSMUST00000167246 2666 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Gm3543D3Z235 Prrg3-203ENSMUST00000170096 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
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Gm3543D3Z235 Ttc7-201ENSMUST00000041110 4614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Gm3543D3Z235 Fbxo46-202ENSMUST00000165913 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
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Gm3543D3Z235 Fam19a4-201ENSMUST00000089295 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Gm3543D3Z235 Ccnj-201ENSMUST00000025983 3819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Gm3543D3Z235 Tmem30b-201ENSMUST00000042975 2991 ntAPPRIS P1 BASIC12.87□□□□□ -0.35
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Gm3543D3Z235 Limk1-201ENSMUST00000015137 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
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Gm3543D3Z235 Casc3-204ENSMUST00000169695 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Gm3543D3Z235 Gemin5-205ENSMUST00000172035 6213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
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Gm3543D3Z235 Gm15458-201ENSMUST00000156950 709 ntTSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
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Gm3543D3Z235 Tubgcp4-215ENSMUST00000186659 2915 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
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Gm3543D3Z235 Bet1l-201ENSMUST00000026557 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Gm3543D3Z235 Gpr88-201ENSMUST00000090473 3469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Gm3543D3Z235 Necap2-201ENSMUST00000030760 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
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Gm3543D3Z235 Il9r-202ENSMUST00000128311 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
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Gm3543D3Z235 Smdt1-201ENSMUST00000023086 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Gm3543D3Z235 Erp27-201ENSMUST00000032343 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Gm3543D3Z235 Iffo1-202ENSMUST00000119527 2840 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Gm3543D3Z235 Ints14-201ENSMUST00000037504 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Gm3543D3Z235 Rab3a-204ENSMUST00000110093 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Gm3543D3Z235 Arhgap20-201ENSMUST00000065496 7161 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Gm3543D3Z235 Adam15-204ENSMUST00000107448 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Gm3543D3Z235 Dmtn-202ENSMUST00000022695 4080 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Gm3543D3Z235 Chd1-202ENSMUST00000024627 7916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Gm3543D3Z235 Cyp4f18-201ENSMUST00000003574 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Gm3543D3Z235 Ap4b1-202ENSMUST00000076599 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Gm3543D3Z235 Rabggta-202ENSMUST00000163889 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Gm3543D3Z235 Rbms1-201ENSMUST00000028347 4436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Gm3543D3Z235 Cdt1-201ENSMUST00000006760 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Gm3543D3Z235 Olfml2a-201ENSMUST00000057279 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Gm3543D3Z235 Rasl12-202ENSMUST00000165682 1903 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Gm3543D3Z235 Acr-201ENSMUST00000023295 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Gm3543D3Z235 Eif4g3-215ENSMUST00000203828 5289 ntTSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
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Gm3543D3Z235 Itpk1-201ENSMUST00000046518 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
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