Protein–RNA interactions for Protein: C6EQI3

Gm17333, ASL1 fusion protein, mousemouse

Predictions only

Length 125 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm17333C6EQI3 Erfe-201ENSMUST00000086861 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gm17333C6EQI3 Stk25-201ENSMUST00000027498 4249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gm17333C6EQI3 Elk3-201ENSMUST00000008542 4212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gm17333C6EQI3 Abca7-201ENSMUST00000043866 6590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gm17333C6EQI3 Rab11b-203ENSMUST00000173860 1544 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gm17333C6EQI3 Ch25h-201ENSMUST00000050562 1350 ntAPPRIS P1 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gm17333C6EQI3 Arhgap4-203ENSMUST00000114405 6299 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gm17333C6EQI3 Armcx1-203ENSMUST00000113197 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
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Gm17333C6EQI3 Hsph1-201ENSMUST00000074846 3240 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gm17333C6EQI3 Gm26613-201ENSMUST00000180919 1457 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gm17333C6EQI3 Edn2-201ENSMUST00000030384 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gm17333C6EQI3 Ccdc155-201ENSMUST00000121017 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gm17333C6EQI3 Fn1-214ENSMUST00000188894 8043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gm17333C6EQI3 Desi1-206ENSMUST00000152227 2934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gm17333C6EQI3 Acat3-201ENSMUST00000043923 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gm17333C6EQI3 Slc11a2-201ENSMUST00000023774 3025 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
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Gm17333C6EQI3 Me1-201ENSMUST00000034989 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gm17333C6EQI3 Myo7a-213ENSMUST00000205746 6689 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gm17333C6EQI3 Apbb2-216ENSMUST00000162366 6540 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gm17333C6EQI3 Esm1-201ENSMUST00000038144 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gm17333C6EQI3 Ndufab1-203ENSMUST00000123296 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gm17333C6EQI3 Ilvbl-201ENSMUST00000105384 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gm17333C6EQI3 Ilvbl-203ENSMUST00000218215 2331 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gm17333C6EQI3 Wnt5a-201ENSMUST00000063465 7010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
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Gm17333C6EQI3 Arnt-204ENSMUST00000107160 783 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
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Gm17333C6EQI3 Chchd7-203ENSMUST00000119307 889 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gm17333C6EQI3 Gm12480-201ENSMUST00000129576 774 ntTSL 3 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gm17333C6EQI3 Gm13403-202ENSMUST00000134271 674 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gm17333C6EQI3 Tsfm-207ENSMUST00000152054 655 ntTSL 3 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gm17333C6EQI3 Slc25a5-201ENSMUST00000016463 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gm17333C6EQI3 Gm8584-201ENSMUST00000171982 758 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
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Gm17333C6EQI3 Flg-207ENSMUST00000180293 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gm17333C6EQI3 Gm32031-203ENSMUST00000208993 649 ntTSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gm17333C6EQI3 1300002E11Rik-207ENSMUST00000211443 767 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gm17333C6EQI3 Gm38575-201ENSMUST00000213881 652 ntTSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gm17333C6EQI3 Nudt8-202ENSMUST00000025802 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gm17333C6EQI3 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gm17333C6EQI3 Limd2-202ENSMUST00000064545 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gm17333C6EQI3 Rnft2-202ENSMUST00000121369 4431 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gm17333C6EQI3 Snx22-201ENSMUST00000044711 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gm17333C6EQI3 Klhl3-202ENSMUST00000160860 7149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gm17333C6EQI3 Dctn1-201ENSMUST00000077407 4118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gm17333C6EQI3 Adal-205ENSMUST00000119031 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gm17333C6EQI3 Tanc2-202ENSMUST00000100330 11855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gm17333C6EQI3 AI606473-201ENSMUST00000177201 1731 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gm17333C6EQI3 F2r-201ENSMUST00000059193 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gm17333C6EQI3 Anxa3-201ENSMUST00000031447 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Gm17333C6EQI3 Tmed5-202ENSMUST00000061203 2194 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Gm17333C6EQI3 Prkcd-207ENSMUST00000112210 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Gm17333C6EQI3 Sorcs1-203ENSMUST00000164039 7241 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Gm17333C6EQI3 Pou2f3-202ENSMUST00000176636 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Gm17333C6EQI3 Lrrc56-202ENSMUST00000070458 2502 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Gm17333C6EQI3 Enox1-201ENSMUST00000022589 3142 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Gm17333C6EQI3 Pax6-201ENSMUST00000090391 2869 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Gm17333C6EQI3 5730409E04Rik-201ENSMUST00000097886 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
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Gm17333C6EQI3 Csrnp1-201ENSMUST00000035101 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
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Gm17333C6EQI3 Kcng1-201ENSMUST00000099069 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Gm17333C6EQI3 Pla2g2c-201ENSMUST00000030530 1618 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Gm17333C6EQI3 Slc2a8-204ENSMUST00000153484 1168 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Gm17333C6EQI3 Flg-202ENSMUST00000178008 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.62□□□□□ -0.55
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Gm17333C6EQI3 4930579K19Rik-202ENSMUST00000190541 632 ntTSL 2 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Gm17333C6EQI3 4930500L23Rik-201ENSMUST00000198000 747 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Gm17333C6EQI3 Fcnb-201ENSMUST00000028179 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Gm17333C6EQI3 A430033K04Rik-201ENSMUST00000032590 1109 ntTSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Gm17333C6EQI3 0610009B22Rik-201ENSMUST00000007921 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Gm17333C6EQI3 Ppt2-205ENSMUST00000169067 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Gm17333C6EQI3 Rnpc3-202ENSMUST00000106535 2616 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Gm17333C6EQI3 Satb2-205ENSMUST00000177424 4694 ntTSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Gm17333C6EQI3 Car10-203ENSMUST00000107858 2742 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Gm17333C6EQI3 Xrra1-201ENSMUST00000036155 2731 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Gm17333C6EQI3 Atat1-202ENSMUST00000061052 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Gm17333C6EQI3 Gm38102-201ENSMUST00000192791 1935 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Gm17333C6EQI3 Hspa8-202ENSMUST00000117557 2019 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Gm17333C6EQI3 Ankrd34b-201ENSMUST00000061594 4013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
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Gm17333C6EQI3 Col25a1-201ENSMUST00000080335 2624 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Gm17333C6EQI3 Pbx3-202ENSMUST00000113132 2734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Gm17333C6EQI3 Hist1h2be-202ENSMUST00000091704 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Gm17333C6EQI3 Lrfn2-201ENSMUST00000046254 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
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