Protein–RNA interactions for Protein: B2RUS7

Abcc8, ATP-binding cassette, sub-family C (CFTR/MRP), member 8, mousemouse

Predictions only

Length 1,588 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Abcc8B2RUS7 Morn3-201ENSMUST00000031437 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Abcc8B2RUS7 Lsm7-201ENSMUST00000035775 468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Abcc8B2RUS7 Lrmda-201ENSMUST00000075639 908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Abcc8B2RUS7 Taz-201ENSMUST00000069722 1851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Abcc8B2RUS7 2900005J15Rik-202ENSMUST00000171190 2025 ntBASIC27.73■■■□□ 2.03
Abcc8B2RUS7 Sgpp1-202ENSMUST00000220285 3200 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Abcc8B2RUS7 Slc35c1-202ENSMUST00000125276 2668 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Abcc8B2RUS7 Kat2a-201ENSMUST00000006973 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Abcc8B2RUS7 Cngb1-201ENSMUST00000093268 1512 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Abcc8B2RUS7 Acp5-203ENSMUST00000165735 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Abcc8B2RUS7 Zbed5-201ENSMUST00000041466 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Abcc8B2RUS7 Rnf207-201ENSMUST00000076183 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Abcc8B2RUS7 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Abcc8B2RUS7 Ank1-208ENSMUST00000121075 1740 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Abcc8B2RUS7 Slc8b1-202ENSMUST00000076051 2661 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Abcc8B2RUS7 Rpl36-201ENSMUST00000080492 404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Abcc8B2RUS7 Lrp1-202ENSMUST00000118455 2097 ntTSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
Abcc8B2RUS7 Hck-204ENSMUST00000191431 1575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Abcc8B2RUS7 Cntf-201ENSMUST00000112933 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Abcc8B2RUS7 Gm13115-201ENSMUST00000156438 620 ntTSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
Abcc8B2RUS7 Gm43138-201ENSMUST00000199123 708 ntBASIC27.72■■■□□ 2.03
Abcc8B2RUS7 Pcbd1-201ENSMUST00000020298 789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Abcc8B2RUS7 Crabp2-201ENSMUST00000005019 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Abcc8B2RUS7 Rnf180-201ENSMUST00000069686 1728 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
Abcc8B2RUS7 Crmp1-202ENSMUST00000114158 3051 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Abcc8B2RUS7 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Abcc8B2RUS7 Gm8337-201ENSMUST00000187358 1938 ntBASIC27.72■■■□□ 2.03
Abcc8B2RUS7 Wwox-203ENSMUST00000109108 1771 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Abcc8B2RUS7 Pex2-202ENSMUST00000071280 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Abcc8B2RUS7 Rgs9-201ENSMUST00000020920 2434 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Abcc8B2RUS7 4930581F22Rik-201ENSMUST00000093873 2402 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Abcc8B2RUS7 Map2k7-203ENSMUST00000110994 1600 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Abcc8B2RUS7 Pacrg-201ENSMUST00000041463 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Abcc8B2RUS7 Ust-201ENSMUST00000061601 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Abcc8B2RUS7 Efnb3-201ENSMUST00000004036 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Abcc8B2RUS7 Gm24830-201ENSMUST00000102024 166 ntBASIC27.71■■■□□ 2.03
Abcc8B2RUS7 Rps10-203ENSMUST00000114882 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Abcc8B2RUS7 Gm25890-201ENSMUST00000177643 165 ntBASIC27.71■■■□□ 2.03
Abcc8B2RUS7 Rnu1b2-201ENSMUST00000178073 165 ntBASIC27.71■■■□□ 2.03
Abcc8B2RUS7 Rnu1b1-201ENSMUST00000178250 165 ntBASIC27.71■■■□□ 2.03
Abcc8B2RUS7 Gm22614-201ENSMUST00000178300 165 ntBASIC27.71■■■□□ 2.03
Abcc8B2RUS7 Gm5896-201ENSMUST00000189662 1024 ntBASIC27.71■■■□□ 2.03
Abcc8B2RUS7 Gm45437-201ENSMUST00000209998 448 ntTSL 3 BASIC27.71■■■□□ 2.03
Abcc8B2RUS7 Ggact-201ENSMUST00000038075 1076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Abcc8B2RUS7 Gm22042-201ENSMUST00000082989 165 ntBASIC27.71■■■□□ 2.03
Abcc8B2RUS7 Gm26232-201ENSMUST00000083360 166 ntBASIC27.71■■■□□ 2.03
Abcc8B2RUS7 Gm24136-201ENSMUST00000083374 165 ntBASIC27.71■■■□□ 2.03
Abcc8B2RUS7 Rnu1b6-201ENSMUST00000083839 166 ntBASIC27.71■■■□□ 2.03
Abcc8B2RUS7 Gm26110-201ENSMUST00000083971 165 ntBASIC27.71■■■□□ 2.03
Abcc8B2RUS7 Aurkc-201ENSMUST00000086248 1154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Abcc8B2RUS7 Rev1-201ENSMUST00000027251 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Abcc8B2RUS7 Etfdh-201ENSMUST00000029386 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Abcc8B2RUS7 Hcrtr1-201ENSMUST00000030562 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Abcc8B2RUS7 Smg9-201ENSMUST00000002280 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Abcc8B2RUS7 Slc9a3-201ENSMUST00000036208 2490 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
Abcc8B2RUS7 Dpm1-209ENSMUST00000154111 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Abcc8B2RUS7 Vill-203ENSMUST00000126251 1411 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
Abcc8B2RUS7 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.03
Abcc8B2RUS7 Timm9-203ENSMUST00000220482 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.7■■■□□ 2.03
Abcc8B2RUS7 Rab11fip3-202ENSMUST00000120691 5103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
Abcc8B2RUS7 Atrip-201ENSMUST00000045011 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
Abcc8B2RUS7 Mocs1-201ENSMUST00000024797 2646 ntTSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.02
Abcc8B2RUS7 Prss42-201ENSMUST00000035715 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
Abcc8B2RUS7 Tomt-202ENSMUST00000106970 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
Abcc8B2RUS7 Nadk2-203ENSMUST00000100790 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.02
Abcc8B2RUS7 Cdh24-201ENSMUST00000067784 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.02
Abcc8B2RUS7 Ppm1h-206ENSMUST00000161487 2931 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
Abcc8B2RUS7 Cant1-203ENSMUST00000106287 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
Abcc8B2RUS7 Dap3-201ENSMUST00000090938 4760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
Abcc8B2RUS7 Acbd5-204ENSMUST00000114529 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
Abcc8B2RUS7 Adra1b-204ENSMUST00000167574 3047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
Abcc8B2RUS7 0610006L08Rik-201ENSMUST00000205326 1589 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Abcc8B2RUS7 Arhgef25-201ENSMUST00000019611 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Abcc8B2RUS7 Gm11439-201ENSMUST00000118598 409 ntBASIC27.69■■■□□ 2.02
Abcc8B2RUS7 Gm2231-201ENSMUST00000125661 612 ntBASIC27.69■■■□□ 2.02
Abcc8B2RUS7 Gm43303-201ENSMUST00000200133 669 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Abcc8B2RUS7 Crip3-201ENSMUST00000024764 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Abcc8B2RUS7 Mrpl57-201ENSMUST00000022538 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Abcc8B2RUS7 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Abcc8B2RUS7 Slc52a3-202ENSMUST00000109858 2094 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Abcc8B2RUS7 Endou-201ENSMUST00000023105 2404 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Abcc8B2RUS7 P3h1-204ENSMUST00000121111 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Abcc8B2RUS7 Gm2694-202ENSMUST00000180806 1452 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Abcc8B2RUS7 Inha-201ENSMUST00000037330 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Abcc8B2RUS7 Rell1-204ENSMUST00000154169 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Abcc8B2RUS7 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Abcc8B2RUS7 Gm12012-201ENSMUST00000118857 1066 ntBASIC27.69■■■□□ 2.02
Abcc8B2RUS7 Rpl13-ps1-201ENSMUST00000121801 668 ntBASIC27.69■■■□□ 2.02
Abcc8B2RUS7 Gm13716-201ENSMUST00000126401 808 ntTSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
Abcc8B2RUS7 Gm24990-201ENSMUST00000157406 323 ntBASIC27.69■■■□□ 2.02
Abcc8B2RUS7 Olfr366-201ENSMUST00000091001 930 ntAPPRIS P1 BASIC27.69■■■□□ 2.02
Abcc8B2RUS7 Coq7-202ENSMUST00000098090 1215 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Abcc8B2RUS7 Ccdc158-204ENSMUST00000151180 3352 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Abcc8B2RUS7 Banp-210ENSMUST00000173254 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
Abcc8B2RUS7 Cdadc1-204ENSMUST00000171683 1892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Abcc8B2RUS7 Mrpl55-203ENSMUST00000108785 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Abcc8B2RUS7 Gm16202-201ENSMUST00000117532 544 ntBASIC27.68■■■□□ 2.02
Abcc8B2RUS7 AC122305.4-201ENSMUST00000216159 1206 ntBASIC27.68■■■□□ 2.02
Abcc8B2RUS7 AC139319.1-201ENSMUST00000223331 690 ntTSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
Abcc8B2RUS7 Lrrc52-201ENSMUST00000036643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.6 ms