Protein–RNA interactions for Protein: B2RUJ5

Apba1, Amyloid-beta A4 precursor protein-binding family A member 1, mousemouse

Predictions only

Length 842 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Apba1B2RUJ5 Cdkn2aip-201ENSMUST00000038738 3464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Apba1B2RUJ5 Mesd-201ENSMUST00000094215 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Apba1B2RUJ5 Arhgef40-201ENSMUST00000093813 5621 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Apba1B2RUJ5 Efcab8-203ENSMUST00000175856 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
Apba1B2RUJ5 Six3os1-211ENSMUST00000176958 2889 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
Apba1B2RUJ5 Gm8242-201ENSMUST00000193029 1420 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Apba1B2RUJ5 Htatip2-201ENSMUST00000085272 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Apba1B2RUJ5 Tpm3-201ENSMUST00000029549 2230 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Apba1B2RUJ5 Gm14435-201ENSMUST00000108995 643 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
Apba1B2RUJ5 Gm11467-201ENSMUST00000129407 674 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
Apba1B2RUJ5 1810032O08Rik-206ENSMUST00000144049 966 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
Apba1B2RUJ5 Nr5a1os-201ENSMUST00000146954 926 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Apba1B2RUJ5 Gm16163-201ENSMUST00000161868 1119 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Apba1B2RUJ5 1700028B04Rik-202ENSMUST00000190841 971 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Apba1B2RUJ5 Gm37857-201ENSMUST00000191784 1199 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Apba1B2RUJ5 Gm43691-201ENSMUST00000196625 697 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Apba1B2RUJ5 Gm42912-201ENSMUST00000197195 716 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Apba1B2RUJ5 1700016B15Rik-201ENSMUST00000209027 733 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Apba1B2RUJ5 Gm36495-201ENSMUST00000221201 684 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Apba1B2RUJ5 AC102569.1-204ENSMUST00000222816 793 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
Apba1B2RUJ5 Mrpl54-201ENSMUST00000046114 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Apba1B2RUJ5 Aqp12-201ENSMUST00000059676 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Apba1B2RUJ5 Smim4-202ENSMUST00000064032 791 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
Apba1B2RUJ5 Ccdc172-201ENSMUST00000069419 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Apba1B2RUJ5 Lhb-201ENSMUST00000072453 678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
Apba1B2RUJ5 Hist1h2ab-201ENSMUST00000078369 473 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
Apba1B2RUJ5 Hist1h2al-201ENSMUST00000091708 339 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Apba1B2RUJ5 Chrna4-202ENSMUST00000108851 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Apba1B2RUJ5 Olfr1411-202ENSMUST00000190844 1821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Apba1B2RUJ5 Necab3-201ENSMUST00000000895 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Apba1B2RUJ5 Phykpl-201ENSMUST00000020625 1609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Apba1B2RUJ5 Tsc2-221ENSMUST00000228412 5432 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.03■□□□□ -0
Apba1B2RUJ5 Tmprss9-201ENSMUST00000105333 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Apba1B2RUJ5 Igfbp1-201ENSMUST00000020704 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Apba1B2RUJ5 Mgat1-202ENSMUST00000101293 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Apba1B2RUJ5 Etnk2-201ENSMUST00000129213 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
Apba1B2RUJ5 Dagla-201ENSMUST00000039327 5634 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Apba1B2RUJ5 Gm37863-201ENSMUST00000194911 1457 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Apba1B2RUJ5 Spg20-201ENSMUST00000044116 3770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Apba1B2RUJ5 Hsd17b7-202ENSMUST00000111353 1446 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Apba1B2RUJ5 Pqlc2-205ENSMUST00000172747 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Apba1B2RUJ5 Rbsn-201ENSMUST00000014694 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Apba1B2RUJ5 Gm3139-202ENSMUST00000201138 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Apba1B2RUJ5 Gm3183-203ENSMUST00000202911 1303 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Apba1B2RUJ5 Rgs14-201ENSMUST00000063771 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Apba1B2RUJ5 Prickle3-201ENSMUST00000033485 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Apba1B2RUJ5 Arid4b-203ENSMUST00000110534 5864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Apba1B2RUJ5 Npm1-204ENSMUST00000109354 1157 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Apba1B2RUJ5 Gm21984-201ENSMUST00000123117 822 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Apba1B2RUJ5 Gm11508-201ENSMUST00000129337 440 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
Apba1B2RUJ5 Haghl-206ENSMUST00000138759 1074 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Apba1B2RUJ5 Tmem9-205ENSMUST00000165125 901 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
Apba1B2RUJ5 1600014C10Rik-207ENSMUST00000179503 784 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Apba1B2RUJ5 2010015M23Rik-201ENSMUST00000181900 1199 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Apba1B2RUJ5 Cox6b2-203ENSMUST00000182111 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Apba1B2RUJ5 Gm44596-201ENSMUST00000204223 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Apba1B2RUJ5 Gm44552-201ENSMUST00000205458 1247 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Apba1B2RUJ5 AI463170-203ENSMUST00000219353 430 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Apba1B2RUJ5 Ftl1-ps1-202ENSMUST00000222435 938 ntAPPRIS P1 BASIC15.02■□□□□ -0
Apba1B2RUJ5 Med8-203ENSMUST00000084319 1134 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Apba1B2RUJ5 Map3k12-207ENSMUST00000169377 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Apba1B2RUJ5 Carmil3-201ENSMUST00000076236 4602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Apba1B2RUJ5 Gm45003-201ENSMUST00000205875 2158 ntBASIC15.02□□□□□ -0.01
Apba1B2RUJ5 B3gnt3-201ENSMUST00000034260 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Apba1B2RUJ5 Snrpn-202ENSMUST00000098402 2076 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Apba1B2RUJ5 Lzts3-203ENSMUST00000110260 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Apba1B2RUJ5 Myocd-202ENSMUST00000102635 4935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Apba1B2RUJ5 Ckb-201ENSMUST00000001304 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Apba1B2RUJ5 Ntrk2-208ENSMUST00000225583 2719 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Apba1B2RUJ5 Oas1a-201ENSMUST00000080322 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Apba1B2RUJ5 Fam57b-202ENSMUST00000098032 1894 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Apba1B2RUJ5 Islr2-201ENSMUST00000114144 3880 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Apba1B2RUJ5 Ubiad1-201ENSMUST00000051633 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Apba1B2RUJ5 Hmgn1-201ENSMUST00000050884 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Apba1B2RUJ5 Gm26718-201ENSMUST00000181048 1378 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Apba1B2RUJ5 Rundc1-201ENSMUST00000040561 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Apba1B2RUJ5 Fbxo21-206ENSMUST00000202447 3959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Apba1B2RUJ5 Mif4gd-203ENSMUST00000106507 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Apba1B2RUJ5 Ralgapb-201ENSMUST00000046274 8366 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Apba1B2RUJ5 1700012B07Rik-202ENSMUST00000106674 2035 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Apba1B2RUJ5 Gm5089-201ENSMUST00000081580 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Apba1B2RUJ5 Sohlh2-201ENSMUST00000029369 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Apba1B2RUJ5 Gm1330-202ENSMUST00000109942 555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Apba1B2RUJ5 Acvr1c-203ENSMUST00000112607 1266 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Apba1B2RUJ5 Gm13313-201ENSMUST00000118938 1084 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Apba1B2RUJ5 Gm11724-201ENSMUST00000125577 472 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Apba1B2RUJ5 Gm13658-201ENSMUST00000135329 929 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Apba1B2RUJ5 Nrxn1-214ENSMUST00000173222 859 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Apba1B2RUJ5 Znrf1-213ENSMUST00000174333 515 ntTSL 3 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Apba1B2RUJ5 Gpx4-207ENSMUST00000183037 735 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Apba1B2RUJ5 Gm37612-201ENSMUST00000193626 582 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Apba1B2RUJ5 Ino80e-214ENSMUST00000206349 883 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Apba1B2RUJ5 9230110C19Rik-202ENSMUST00000215478 533 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Apba1B2RUJ5 9430081H08Rik-201ENSMUST00000217460 818 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Apba1B2RUJ5 Gm1000-201ENSMUST00000220520 801 ntTSL 3 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Apba1B2RUJ5 AC154848.1-201ENSMUST00000225451 846 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Apba1B2RUJ5 Gm9898-201ENSMUST00000065469 1161 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Apba1B2RUJ5 Zfyve27-207ENSMUST00000169536 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Apba1B2RUJ5 Gm18829-201ENSMUST00000188150 1622 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Apba1B2RUJ5 Vta1-205ENSMUST00000154132 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.4 ms