Protein–RNA interactions for Protein: B2RS76

Cpb1, Carboxypeptidase B1 (Tissue), isoform CRA_b, mousemouse

Predictions only

Length 415 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cpb1B2RS76 Gif-201ENSMUST00000025585 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cpb1B2RS76 Fam192a-201ENSMUST00000034226 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cpb1B2RS76 Tomm34-202ENSMUST00000109384 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cpb1B2RS76 Alox8-202ENSMUST00000094078 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cpb1B2RS76 Ism2-202ENSMUST00000125733 2526 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cpb1B2RS76 Fggy-203ENSMUST00000107091 1395 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cpb1B2RS76 Lpar5-201ENSMUST00000088292 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cpb1B2RS76 Slc4a1-201ENSMUST00000006749 4545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cpb1B2RS76 Pdlim2-210ENSMUST00000153735 1578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cpb1B2RS76 Hspa1a-201ENSMUST00000087328 2967 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cpb1B2RS76 Eomes-201ENSMUST00000035020 3560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cpb1B2RS76 Hoxb8-201ENSMUST00000052650 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cpb1B2RS76 Fbxo44-205ENSMUST00000151127 1403 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cpb1B2RS76 Ptprv-210ENSMUST00000183317 6108 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cpb1B2RS76 F2r-201ENSMUST00000059193 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cpb1B2RS76 Rnf146-201ENSMUST00000037548 4402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cpb1B2RS76 Ppp1r14d-202ENSMUST00000110820 790 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cpb1B2RS76 Vamp2-202ENSMUST00000117780 1113 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cpb1B2RS76 Gm15957-201ENSMUST00000118893 974 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Cpb1B2RS76 Cpsf4l-205ENSMUST00000173655 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cpb1B2RS76 Gm17344-202ENSMUST00000173980 621 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cpb1B2RS76 Trp53tg5-201ENSMUST00000017864 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cpb1B2RS76 AC151828.1-201ENSMUST00000219552 661 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cpb1B2RS76 Asah1-201ENSMUST00000034000 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cpb1B2RS76 Hist1h1e-201ENSMUST00000062045 1930 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cpb1B2RS76 Rnf11-201ENSMUST00000030284 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cpb1B2RS76 Tgfbr3-201ENSMUST00000031224 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cpb1B2RS76 Chfr-207ENSMUST00000198633 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cpb1B2RS76 Sytl1-201ENSMUST00000030674 1951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cpb1B2RS76 Zbtb46-201ENSMUST00000029106 5309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cpb1B2RS76 Meioc-201ENSMUST00000100378 4573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cpb1B2RS76 Slc23a3-201ENSMUST00000027405 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cpb1B2RS76 Midn-201ENSMUST00000042057 3727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cpb1B2RS76 Ttc22-201ENSMUST00000047922 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cpb1B2RS76 Afg3l2-201ENSMUST00000025408 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cpb1B2RS76 Cc2d1b-201ENSMUST00000030320 3303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cpb1B2RS76 Pde8a-201ENSMUST00000026672 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cpb1B2RS76 Npas3-204ENSMUST00000223358 3143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cpb1B2RS76 Fam131a-201ENSMUST00000056518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cpb1B2RS76 Cbfa2t3-201ENSMUST00000006525 3161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cpb1B2RS76 Elac1-201ENSMUST00000041138 4971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cpb1B2RS76 Kcnq2-220ENSMUST00000197015 8031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cpb1B2RS76 Miga1-204ENSMUST00000199334 4024 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cpb1B2RS76 Gm14812-201ENSMUST00000156494 1794 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cpb1B2RS76 Ppt2-210ENSMUST00000171376 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cpb1B2RS76 Evc-201ENSMUST00000031005 4325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cpb1B2RS76 B230359F08Rik-201ENSMUST00000103671 426 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cpb1B2RS76 Crip3-202ENSMUST00000113465 1035 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cpb1B2RS76 Mrpl53-201ENSMUST00000113938 695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cpb1B2RS76 Cmss1-201ENSMUST00000114371 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cpb1B2RS76 Gm15393-201ENSMUST00000120499 219 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Cpb1B2RS76 Gm12212-201ENSMUST00000141032 378 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cpb1B2RS76 H2-Pa-201ENSMUST00000182803 626 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Cpb1B2RS76 Ighv8-8-201ENSMUST00000192591 358 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cpb1B2RS76 AC102291.3-201ENSMUST00000226566 405 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Cpb1B2RS76 Armc12-201ENSMUST00000025060 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cpb1B2RS76 Mfsd6l-201ENSMUST00000053211 2060 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cpb1B2RS76 Rpa2-201ENSMUST00000102561 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cpb1B2RS76 Cspg5-204ENSMUST00000197850 7868 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cpb1B2RS76 Zfp109-203ENSMUST00000206960 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cpb1B2RS76 Pcdha12-201ENSMUST00000047614 5335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cpb1B2RS76 Gnpda2-201ENSMUST00000031117 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cpb1B2RS76 Gm45133-201ENSMUST00000207548 2773 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Cpb1B2RS76 Cdx4-201ENSMUST00000033689 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cpb1B2RS76 Atp2a2-202ENSMUST00000177974 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cpb1B2RS76 Edn3-201ENSMUST00000029030 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cpb1B2RS76 Timp4-201ENSMUST00000032462 5496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cpb1B2RS76 Paf1-201ENSMUST00000003529 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cpb1B2RS76 Sh2b3-202ENSMUST00000086310 4195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cpb1B2RS76 Osbpl8-202ENSMUST00000105275 7204 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cpb1B2RS76 Gtf2h1-201ENSMUST00000006774 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cpb1B2RS76 Gm26852-201ENSMUST00000180691 5751 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cpb1B2RS76 Gm10710-201ENSMUST00000047876 3971 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Cpb1B2RS76 Fdx1-202ENSMUST00000214013 2759 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cpb1B2RS76 Iqce-202ENSMUST00000077890 2494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cpb1B2RS76 Gspt2-201ENSMUST00000096368 2491 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cpb1B2RS76 Ptdss1-201ENSMUST00000021990 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cpb1B2RS76 Uqcrq-203ENSMUST00000109021 405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cpb1B2RS76 Gm12859-201ENSMUST00000117834 427 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Cpb1B2RS76 Pax8-208ENSMUST00000153601 1226 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cpb1B2RS76 2210408F21Rik-214ENSMUST00000155345 1022 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cpb1B2RS76 Cyba-201ENSMUST00000017604 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cpb1B2RS76 Gm29542-201ENSMUST00000186876 704 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cpb1B2RS76 Gm42612-201ENSMUST00000197986 623 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Cpb1B2RS76 Gm43170-201ENSMUST00000199827 612 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Cpb1B2RS76 Gm35549-203ENSMUST00000204619 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cpb1B2RS76 Gm45195-201ENSMUST00000205597 1008 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Cpb1B2RS76 Ins2-209ENSMUST00000210288 918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cpb1B2RS76 Tmem253-203ENSMUST00000227295 704 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cpb1B2RS76 Gstm1-201ENSMUST00000004140 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cpb1B2RS76 Ghr-201ENSMUST00000069451 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cpb1B2RS76 4932422M17Rik-201ENSMUST00000195992 2639 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Cpb1B2RS76 Zfp57-201ENSMUST00000069250 1749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cpb1B2RS76 Ppp2r5e-205ENSMUST00000220035 3135 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cpb1B2RS76 Fancm-201ENSMUST00000058889 7775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cpb1B2RS76 Itgav-201ENSMUST00000028499 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cpb1B2RS76 Gjb4-202ENSMUST00000106090 1446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cpb1B2RS76 Gjb4-201ENSMUST00000060419 1445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cpb1B2RS76 Grin2a-202ENSMUST00000115835 5023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cpb1B2RS76 Map3k8-201ENSMUST00000025078 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.8 ms