Protein–RNA interactions for Protein: B2RQG2

Phf3, PHD finger protein 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,025 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Phf3B2RQG2 Ip6k2-210ENSMUST00000194875 748 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Phf3B2RQG2 Tnfrsf19-205ENSMUST00000225730 744 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Phf3B2RQG2 Ins1-201ENSMUST00000039652 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Phf3B2RQG2 Ubxn11-201ENSMUST00000070246 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Phf3B2RQG2 Eda-206ENSMUST00000113779 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Phf3B2RQG2 Fzd5-201ENSMUST00000063982 6915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Phf3B2RQG2 Kdm4b-202ENSMUST00000086835 4360 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Phf3B2RQG2 Ftcd-201ENSMUST00000001183 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Phf3B2RQG2 Dbndd1-201ENSMUST00000176155 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Phf3B2RQG2 Tbc1d1-203ENSMUST00000119756 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Phf3B2RQG2 Trmt1-205ENSMUST00000125370 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Phf3B2RQG2 Wdr73-201ENSMUST00000026816 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Phf3B2RQG2 Slc39a3-202ENSMUST00000117276 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Phf3B2RQG2 Kdm2b-201ENSMUST00000031435 3532 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Phf3B2RQG2 Zmym3-208ENSMUST00000121429 1890 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Phf3B2RQG2 Ccer1-201ENSMUST00000060703 1865 ntAPPRIS P1 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Phf3B2RQG2 Atp2a2-202ENSMUST00000177974 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Phf3B2RQG2 Lpar5-201ENSMUST00000088292 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Phf3B2RQG2 Slc17a9-201ENSMUST00000094218 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Phf3B2RQG2 Adck5-214ENSMUST00000162503 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Phf3B2RQG2 Fam126a-201ENSMUST00000030849 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Phf3B2RQG2 Klc2-203ENSMUST00000113728 2838 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Phf3B2RQG2 Pak1-205ENSMUST00000206984 2794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Phf3B2RQG2 Rdm1-201ENSMUST00000010506 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Phf3B2RQG2 Pex11g-202ENSMUST00000111081 666 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Phf3B2RQG2 Mir1894-201ENSMUST00000122802 81 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Phf3B2RQG2 Mtmr2-209ENSMUST00000156801 617 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Phf3B2RQG2 Gstt1-201ENSMUST00000001713 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Phf3B2RQG2 Gm31728-201ENSMUST00000192164 435 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Phf3B2RQG2 Gm33320-201ENSMUST00000192232 530 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Phf3B2RQG2 H2-Bl-210ENSMUST00000195833 829 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Phf3B2RQG2 1700020A23Rik-201ENSMUST00000028898 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Phf3B2RQG2 Fkbp2-201ENSMUST00000070878 642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Phf3B2RQG2 Cnksr2-201ENSMUST00000026750 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Phf3B2RQG2 Alx1-208ENSMUST00000219194 1695 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Phf3B2RQG2 Ush1c-207ENSMUST00000176371 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Phf3B2RQG2 Sfmbt1-201ENSMUST00000054230 7837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Phf3B2RQG2 Zbtb11-201ENSMUST00000050248 4920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Phf3B2RQG2 Prox1-201ENSMUST00000010319 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Phf3B2RQG2 Prickle1-201ENSMUST00000048982 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Phf3B2RQG2 Krt18-201ENSMUST00000023803 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Phf3B2RQG2 Tc2n-203ENSMUST00000160830 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Phf3B2RQG2 D6Ertd527e-204ENSMUST00000204927 2218 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Phf3B2RQG2 Utp4-201ENSMUST00000047629 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Phf3B2RQG2 Prdm4-207ENSMUST00000220032 3962 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Phf3B2RQG2 Ints3-203ENSMUST00000196530 3778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Phf3B2RQG2 Pex12-202ENSMUST00000108146 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Phf3B2RQG2 Gatsl3-201ENSMUST00000020699 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Phf3B2RQG2 Gpx3-201ENSMUST00000082430 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Phf3B2RQG2 Zfp628-201ENSMUST00000116354 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Phf3B2RQG2 Slc43a1-201ENSMUST00000028469 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Phf3B2RQG2 Aldh16a1-201ENSMUST00000107815 2685 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Phf3B2RQG2 Cbln4-201ENSMUST00000087950 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Phf3B2RQG2 Lrriq4-202ENSMUST00000108267 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Phf3B2RQG2 Ociad2-204ENSMUST00000200830 2384 ntTSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Phf3B2RQG2 Nme1-202ENSMUST00000107844 452 ntTSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Phf3B2RQG2 C530008M17Rik-205ENSMUST00000121851 1165 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Phf3B2RQG2 Gm43691-201ENSMUST00000196625 697 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Phf3B2RQG2 9230114J08Rik-201ENSMUST00000200375 350 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Phf3B2RQG2 Rnf151-201ENSMUST00000008626 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Phf3B2RQG2 Arhgap10-201ENSMUST00000076316 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Phf3B2RQG2 Slc35g3-201ENSMUST00000102586 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Phf3B2RQG2 Pxdn-201ENSMUST00000118321 2698 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Phf3B2RQG2 Cdk8-205ENSMUST00000161181 2467 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Phf3B2RQG2 Pelp1-201ENSMUST00000019065 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Phf3B2RQG2 Slc44a5-201ENSMUST00000089948 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Phf3B2RQG2 Acbd6-201ENSMUST00000035560 5592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Phf3B2RQG2 Bag6-201ENSMUST00000025250 3858 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Phf3B2RQG2 Mtif2-202ENSMUST00000093239 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Phf3B2RQG2 Gm31326-201ENSMUST00000191856 1048 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Phf3B2RQG2 Gm43630-201ENSMUST00000201550 776 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Phf3B2RQG2 Gm40193-201ENSMUST00000209971 237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Phf3B2RQG2 AC166349.1-201ENSMUST00000220866 695 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Phf3B2RQG2 Gm9797-201ENSMUST00000052902 613 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Phf3B2RQG2 Ftl1-201ENSMUST00000094434 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Phf3B2RQG2 Tspan15-201ENSMUST00000047883 3638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Phf3B2RQG2 Fam19a4-201ENSMUST00000089295 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Phf3B2RQG2 Dlgap1-201ENSMUST00000060072 5420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Phf3B2RQG2 Tbc1d8-201ENSMUST00000054462 4451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Phf3B2RQG2 Skida1-201ENSMUST00000066885 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Phf3B2RQG2 Wdyhv1-201ENSMUST00000067563 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Phf3B2RQG2 Gm5763-201ENSMUST00000155951 1530 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Phf3B2RQG2 Socs4-201ENSMUST00000065562 6877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Phf3B2RQG2 Srcin1-202ENSMUST00000107593 3733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Phf3B2RQG2 Gm12503-201ENSMUST00000146576 3127 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Phf3B2RQG2 Map2k6-201ENSMUST00000020949 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Phf3B2RQG2 Col9a2-201ENSMUST00000030372 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Phf3B2RQG2 Scp2-201ENSMUST00000030340 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Phf3B2RQG2 Fbxo46-202ENSMUST00000165913 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Phf3B2RQG2 Mindy3-201ENSMUST00000028105 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Phf3B2RQG2 Tuft1-203ENSMUST00000196655 2156 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Phf3B2RQG2 Dnm1l-201ENSMUST00000023477 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Phf3B2RQG2 Palb2-201ENSMUST00000063587 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Phf3B2RQG2 Gata2-201ENSMUST00000015197 3571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Phf3B2RQG2 Gm8602-201ENSMUST00000184045 607 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Phf3B2RQG2 Gm28760-201ENSMUST00000185995 736 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Phf3B2RQG2 Blvra-201ENSMUST00000002064 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Phf3B2RQG2 4933405L10Rik-202ENSMUST00000211852 1097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Phf3B2RQG2 Taf11-201ENSMUST00000025057 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Phf3B2RQG2 Ifitm3-201ENSMUST00000026565 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.5 ms