Protein–RNA interactions for Protein: B1ATG9

Trabd2b, Metalloprotease TIKI2, mousemouse

Predictions only

Length 517 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trabd2bB1ATG9 Strap-201ENSMUST00000064910 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Trabd2bB1ATG9 Cep170-205ENSMUST00000192961 2708 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Trabd2bB1ATG9 Lenep-201ENSMUST00000057431 1806 ntAPPRIS P1 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Trabd2bB1ATG9 Asb10-203ENSMUST00000119657 1536 ntTSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Trabd2bB1ATG9 Pccb-204ENSMUST00000149322 2188 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Trabd2bB1ATG9 Lamp2-203ENSMUST00000074913 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Trabd2bB1ATG9 Lcn5-203ENSMUST00000100313 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Trabd2bB1ATG9 Gm4875-201ENSMUST00000118257 786 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
Trabd2bB1ATG9 Flt3l-201ENSMUST00000146760 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Trabd2bB1ATG9 Tnnt1-208ENSMUST00000166161 750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Trabd2bB1ATG9 Gm38319-201ENSMUST00000194537 1266 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
Trabd2bB1ATG9 Gm43568-203ENSMUST00000199116 1270 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Trabd2bB1ATG9 Gm42787-201ENSMUST00000200879 1164 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Trabd2bB1ATG9 Gm19265-201ENSMUST00000201818 894 ntTSL 3 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Trabd2bB1ATG9 Gm6266-201ENSMUST00000203844 806 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
Trabd2bB1ATG9 CT009510.1-201ENSMUST00000227972 270 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
Trabd2bB1ATG9 Gm15823-201ENSMUST00000064305 670 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
Trabd2bB1ATG9 Spcs2-210ENSMUST00000209032 1610 ntTSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Trabd2bB1ATG9 Rxra-202ENSMUST00000100251 1952 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Trabd2bB1ATG9 Zdhhc19-201ENSMUST00000064192 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Trabd2bB1ATG9 Fbxl5-207ENSMUST00000124610 2306 ntTSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Trabd2bB1ATG9 Dnmt3b-210ENSMUST00000109774 4320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Trabd2bB1ATG9 Ubqln1-201ENSMUST00000058735 3686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Trabd2bB1ATG9 Nup62-205ENSMUST00000208626 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Trabd2bB1ATG9 Nup62-201ENSMUST00000057195 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Trabd2bB1ATG9 Slc16a9-201ENSMUST00000046807 3756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Trabd2bB1ATG9 Pola2-201ENSMUST00000025752 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Trabd2bB1ATG9 Grk5-201ENSMUST00000003313 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Trabd2bB1ATG9 Cbfb-203ENSMUST00000109394 2487 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Trabd2bB1ATG9 Tdrd12-205ENSMUST00000205407 1412 ntTSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Trabd2bB1ATG9 Reep1-201ENSMUST00000121469 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Trabd2bB1ATG9 Gm45003-201ENSMUST00000205875 2158 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
Trabd2bB1ATG9 Sergef-201ENSMUST00000033127 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Trabd2bB1ATG9 Ntf3-201ENSMUST00000050484 1483 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Trabd2bB1ATG9 Scp2-201ENSMUST00000030340 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Trabd2bB1ATG9 Fam57b-203ENSMUST00000205324 1915 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Trabd2bB1ATG9 Daxx-208ENSMUST00000174541 2325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Trabd2bB1ATG9 AC162938.1-201ENSMUST00000213140 2323 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
Trabd2bB1ATG9 Edn3-201ENSMUST00000029030 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Trabd2bB1ATG9 Emilin3-201ENSMUST00000057169 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Trabd2bB1ATG9 Gtf2h4-207ENSMUST00000160734 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Trabd2bB1ATG9 Dcaf13-201ENSMUST00000022909 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Trabd2bB1ATG9 Ilf2-201ENSMUST00000001042 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Trabd2bB1ATG9 Pisd-ps1-201ENSMUST00000119128 1115 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
Trabd2bB1ATG9 Rpl17-ps10-201ENSMUST00000119383 555 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
Trabd2bB1ATG9 Rpl17-ps9-201ENSMUST00000119541 555 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
Trabd2bB1ATG9 Crybb3-204ENSMUST00000119627 828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Trabd2bB1ATG9 Rpl17-ps4-201ENSMUST00000120241 555 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
Trabd2bB1ATG9 Mansc4-202ENSMUST00000123367 542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Trabd2bB1ATG9 Gm5108-201ENSMUST00000177891 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Trabd2bB1ATG9 Tbc1d17-209ENSMUST00000207293 692 ntTSL 3 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Trabd2bB1ATG9 Gm45668-201ENSMUST00000211271 493 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
Trabd2bB1ATG9 Gm46209-201ENSMUST00000217912 553 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
Trabd2bB1ATG9 Crybb2-201ENSMUST00000031295 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Trabd2bB1ATG9 Ss18l1-201ENSMUST00000041126 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Trabd2bB1ATG9 Mbp-202ENSMUST00000062446 2186 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Trabd2bB1ATG9 D6Ertd527e-204ENSMUST00000204927 2218 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Trabd2bB1ATG9 Phactr3-203ENSMUST00000108915 2694 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Trabd2bB1ATG9 Phactr3-204ENSMUST00000108916 2656 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Trabd2bB1ATG9 Ctnnb1-201ENSMUST00000007130 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Trabd2bB1ATG9 Adk-207ENSMUST00000224069 1818 ntAPPRIS ALT1 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Trabd2bB1ATG9 Ralgds-203ENSMUST00000113893 3683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Trabd2bB1ATG9 Arhgef33-202ENSMUST00000223878 3253 ntAPPRIS P1 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Trabd2bB1ATG9 Vps53-201ENSMUST00000056601 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Trabd2bB1ATG9 Tap2-201ENSMUST00000025197 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Trabd2bB1ATG9 Zfp316-202ENSMUST00000161448 6891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Trabd2bB1ATG9 AC164565.1-201ENSMUST00000217520 1484 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
Trabd2bB1ATG9 Morc4-201ENSMUST00000033811 4412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Trabd2bB1ATG9 Gm43205-201ENSMUST00000198622 1968 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
Trabd2bB1ATG9 Dym-201ENSMUST00000039608 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Trabd2bB1ATG9 Tmem184a-201ENSMUST00000044002 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Trabd2bB1ATG9 Slc44a5-201ENSMUST00000089948 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Trabd2bB1ATG9 Scube2-203ENSMUST00000106729 3563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Trabd2bB1ATG9 Pbx3-201ENSMUST00000040638 2587 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Trabd2bB1ATG9 Kcnc1-201ENSMUST00000025202 7760 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Trabd2bB1ATG9 Ghr-201ENSMUST00000069451 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Trabd2bB1ATG9 Chmp1a-201ENSMUST00000000759 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Trabd2bB1ATG9 Gm26850-201ENSMUST00000181653 2669 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Trabd2bB1ATG9 Cry2-202ENSMUST00000111278 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Trabd2bB1ATG9 Arhgef33-201ENSMUST00000068175 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Trabd2bB1ATG9 Hnrnpa3-202ENSMUST00000111961 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Trabd2bB1ATG9 Ulk1-211ENSMUST00000200299 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Trabd2bB1ATG9 Dffa-202ENSMUST00000103216 1835 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Trabd2bB1ATG9 Sp2-203ENSMUST00000107624 3055 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Trabd2bB1ATG9 Lrwd1-201ENSMUST00000006301 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Trabd2bB1ATG9 Adrb3-203ENSMUST00000121838 1864 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Trabd2bB1ATG9 Slc4a7-201ENSMUST00000057015 8132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Trabd2bB1ATG9 Wdr31-203ENSMUST00000120095 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Trabd2bB1ATG9 F11r-201ENSMUST00000043839 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Trabd2bB1ATG9 1700042O10Rik-201ENSMUST00000151032 1075 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Trabd2bB1ATG9 Gas5-210ENSMUST00000159706 557 ntTSL 2 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Trabd2bB1ATG9 Otx2os1-202ENSMUST00000183803 743 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Trabd2bB1ATG9 Poc1a-205ENSMUST00000191434 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Trabd2bB1ATG9 Gm38182-203ENSMUST00000192984 993 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Trabd2bB1ATG9 Pcdhgc5-204ENSMUST00000193941 593 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Trabd2bB1ATG9 Gm43630-201ENSMUST00000201550 776 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
Trabd2bB1ATG9 Ifitm3-201ENSMUST00000026565 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Trabd2bB1ATG9 Rps11-201ENSMUST00000003521 661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Trabd2bB1ATG9 Rpsa-ps10-201ENSMUST00000057740 885 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
Trabd2bB1ATG9 Rassf8-202ENSMUST00000058538 1131 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 73.5 ms