Protein–RNA interactions for Protein: B1ASB6

Spocd1, SPOC domain-containing 1, mousemouse

Predictions only

Length 936 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Spocd1B1ASB6 Cryba4-202ENSMUST00000112383 754 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Spocd1B1ASB6 Vamp2-202ENSMUST00000117780 1113 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Spocd1B1ASB6 Hoxa7-202ENSMUST00000134367 807 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Spocd1B1ASB6 U2af1l4-216ENSMUST00000166510 835 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Spocd1B1ASB6 Gm9824-201ENSMUST00000178707 561 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Spocd1B1ASB6 C330022C24Rik-201ENSMUST00000190581 1077 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Spocd1B1ASB6 AC158529.1-201ENSMUST00000223618 239 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Spocd1B1ASB6 Commd9-201ENSMUST00000028584 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Spocd1B1ASB6 Hes5-201ENSMUST00000049621 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Spocd1B1ASB6 Rnf217-201ENSMUST00000081989 11013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Spocd1B1ASB6 Narfl-204ENSMUST00000134108 2062 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Spocd1B1ASB6 Ly9-201ENSMUST00000004827 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Spocd1B1ASB6 Pdk2-201ENSMUST00000038431 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Spocd1B1ASB6 Kcp-201ENSMUST00000078112 4775 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Spocd1B1ASB6 Wac-201ENSMUST00000074919 3070 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Spocd1B1ASB6 Tpd52-203ENSMUST00000091355 3081 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Spocd1B1ASB6 Iffo1-202ENSMUST00000119527 2840 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Spocd1B1ASB6 Slc46a3-201ENSMUST00000031655 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Spocd1B1ASB6 Pard3-202ENSMUST00000079777 3394 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Spocd1B1ASB6 Syt17-204ENSMUST00000203796 2957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Spocd1B1ASB6 Sh2b1-205ENSMUST00000205733 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Spocd1B1ASB6 Btbd10-201ENSMUST00000047091 2581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Spocd1B1ASB6 4921504A21Rik-201ENSMUST00000180594 2156 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Spocd1B1ASB6 Zfp503-201ENSMUST00000043409 4216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Spocd1B1ASB6 Dnmt3a-205ENSMUST00000172689 2328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Spocd1B1ASB6 Fbxo46-202ENSMUST00000165913 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Spocd1B1ASB6 Gm44981-201ENSMUST00000205549 1943 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Spocd1B1ASB6 Tdrp-201ENSMUST00000062613 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Spocd1B1ASB6 Plxdc2-203ENSMUST00000114703 2061 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Spocd1B1ASB6 Dmpk-201ENSMUST00000032568 2761 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Spocd1B1ASB6 Adgrb2-202ENSMUST00000097868 4635 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Spocd1B1ASB6 Gpr137-205ENSMUST00000166115 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Spocd1B1ASB6 Camsap2-202ENSMUST00000192001 6329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Spocd1B1ASB6 Abl2-201ENSMUST00000027888 3549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Spocd1B1ASB6 Gm3002-201ENSMUST00000170480 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Spocd1B1ASB6 Gm3005-202ENSMUST00000178728 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Spocd1B1ASB6 Nop9-201ENSMUST00000019441 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Spocd1B1ASB6 H60b-201ENSMUST00000105522 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Spocd1B1ASB6 Abhd11-202ENSMUST00000111216 972 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Spocd1B1ASB6 Hras-203ENSMUST00000124314 1073 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Spocd1B1ASB6 Nr2f1-202ENSMUST00000125176 841 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Spocd1B1ASB6 Gm15199-201ENSMUST00000129933 542 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Spocd1B1ASB6 Mir99ahg-211ENSMUST00000183099 1189 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Spocd1B1ASB6 Gm17837-201ENSMUST00000186435 985 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Spocd1B1ASB6 Gm36536-201ENSMUST00000194241 959 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Spocd1B1ASB6 AC155729.1-201ENSMUST00000227758 544 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Spocd1B1ASB6 Gm17619-201ENSMUST00000180625 1449 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Spocd1B1ASB6 Cdca5-201ENSMUST00000025704 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Spocd1B1ASB6 Maea-201ENSMUST00000114449 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Spocd1B1ASB6 Smpd3-202ENSMUST00000212896 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Spocd1B1ASB6 Fh1-201ENSMUST00000027810 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Spocd1B1ASB6 Repin1-204ENSMUST00000135151 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Spocd1B1ASB6 Eif4g3-203ENSMUST00000084215 8134 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Spocd1B1ASB6 Gm10457-201ENSMUST00000222619 1906 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Spocd1B1ASB6 Vps53-201ENSMUST00000056601 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Spocd1B1ASB6 Rims1-201ENSMUST00000081544 5954 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Spocd1B1ASB6 Vcan-205ENSMUST00000159337 2273 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Spocd1B1ASB6 Ttc24-201ENSMUST00000050258 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Spocd1B1ASB6 Fhad1-202ENSMUST00000105779 4263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Spocd1B1ASB6 Trim68-205ENSMUST00000210855 2301 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Spocd1B1ASB6 Lrrc7-205ENSMUST00000200137 7321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Spocd1B1ASB6 Adgrg5-205ENSMUST00000166802 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Spocd1B1ASB6 Amz2-202ENSMUST00000092500 2816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Spocd1B1ASB6 Lypd1-202ENSMUST00000159417 6464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Spocd1B1ASB6 Pcp2-202ENSMUST00000128566 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Spocd1B1ASB6 Kcna1-202ENSMUST00000203094 3150 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Spocd1B1ASB6 Gm14042-201ENSMUST00000120139 833 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Spocd1B1ASB6 Gm11899-201ENSMUST00000142373 745 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Spocd1B1ASB6 Gm20444-201ENSMUST00000174014 648 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Spocd1B1ASB6 Lsamp-207ENSMUST00000189229 637 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Spocd1B1ASB6 Lsamp-210ENSMUST00000191610 1297 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Spocd1B1ASB6 Lce1d-201ENSMUST00000029524 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Spocd1B1ASB6 Gk-201ENSMUST00000026039 4340 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Spocd1B1ASB6 Sgk1-202ENSMUST00000092673 2576 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Spocd1B1ASB6 2810006K23Rik-202ENSMUST00000111477 1637 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Spocd1B1ASB6 Cers5-202ENSMUST00000109035 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Spocd1B1ASB6 Dym-201ENSMUST00000039608 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Spocd1B1ASB6 Adgrb2-206ENSMUST00000106018 4470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Spocd1B1ASB6 AU040320-202ENSMUST00000102607 4191 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Spocd1B1ASB6 Rnf168-201ENSMUST00000014218 3932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Spocd1B1ASB6 Ap1s2-202ENSMUST00000069041 2226 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Spocd1B1ASB6 Gm5478-201ENSMUST00000100184 2566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Spocd1B1ASB6 Capg-203ENSMUST00000114072 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Spocd1B1ASB6 Gpr108-201ENSMUST00000005975 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Spocd1B1ASB6 Olfr317-202ENSMUST00000215513 2769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Spocd1B1ASB6 Grin3a-202ENSMUST00000093859 7491 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Spocd1B1ASB6 Tomm34-202ENSMUST00000109384 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Spocd1B1ASB6 Tap1-206ENSMUST00000170086 2953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Spocd1B1ASB6 Dlg1-201ENSMUST00000023454 3725 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Spocd1B1ASB6 Dnajc7-201ENSMUST00000014339 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Spocd1B1ASB6 Hist1h2br-202ENSMUST00000110476 381 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Spocd1B1ASB6 Stra8-202ENSMUST00000114997 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Spocd1B1ASB6 Gm14206-201ENSMUST00000132973 747 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Spocd1B1ASB6 Mecp2-204ENSMUST00000140399 1168 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Spocd1B1ASB6 4930573H18Rik-201ENSMUST00000197696 906 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Spocd1B1ASB6 1700028E10Rik-205ENSMUST00000202024 924 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Spocd1B1ASB6 Ino80e-214ENSMUST00000206349 883 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Spocd1B1ASB6 Hist1h2bq-201ENSMUST00000078156 381 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Spocd1B1ASB6 Mlkl-201ENSMUST00000056157 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Spocd1B1ASB6 Gm13517-201ENSMUST00000120782 1495 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.4 ms