Protein–RNA interactions for Protein: A2APF3

Ctcfl, Transcriptional repressor CTCFL, mousemouse

Predictions only

Length 636 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CtcflA2APF3 Tdg-208ENSMUST00000151390 3502 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
CtcflA2APF3 Clmp-201ENSMUST00000034522 4154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
CtcflA2APF3 Tspan5-202ENSMUST00000119993 2107 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
CtcflA2APF3 Arhgef2-229ENSMUST00000177303 3000 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
CtcflA2APF3 2610206C17Rik-201ENSMUST00000129059 1717 ntTSL 2 BASIC12.96□□□□□ -0.33
CtcflA2APF3 Rnf122-205ENSMUST00000217278 1726 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
CtcflA2APF3 Sall4-201ENSMUST00000029061 5073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
CtcflA2APF3 Hid1-201ENSMUST00000044152 3236 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
CtcflA2APF3 Ybx2-202ENSMUST00000108601 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
CtcflA2APF3 Pik3cd-201ENSMUST00000038859 4905 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
CtcflA2APF3 Rufy3-203ENSMUST00000196894 3703 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
CtcflA2APF3 Lmbr1-203ENSMUST00000196321 3422 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
CtcflA2APF3 Bud23-201ENSMUST00000071677 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
CtcflA2APF3 Glud1-201ENSMUST00000022322 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
CtcflA2APF3 Azi2-201ENSMUST00000044454 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
CtcflA2APF3 Arfip1-201ENSMUST00000098990 2799 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
CtcflA2APF3 Hapln4-201ENSMUST00000007738 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
CtcflA2APF3 Erc1-207ENSMUST00000183911 3865 ntTSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
CtcflA2APF3 Dlg4-204ENSMUST00000108589 3271 ntTSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
CtcflA2APF3 Gm24589-201ENSMUST00000116692 94 ntBASIC12.96□□□□□ -0.33
CtcflA2APF3 Gm8344-201ENSMUST00000119813 856 ntBASIC12.96□□□□□ -0.33
CtcflA2APF3 Tsfm-207ENSMUST00000152054 655 ntTSL 3 BASIC12.96□□□□□ -0.33
CtcflA2APF3 Fhad1os2-201ENSMUST00000152351 945 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
CtcflA2APF3 Eapp-203ENSMUST00000160085 676 ntTSL 3 BASIC12.96□□□□□ -0.33
CtcflA2APF3 Gm8318-201ENSMUST00000182954 872 ntBASIC12.96□□□□□ -0.33
CtcflA2APF3 Gm43347-201ENSMUST00000200226 580 ntBASIC12.96□□□□□ -0.33
CtcflA2APF3 AC133183.1-201ENSMUST00000221229 429 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.96□□□□□ -0.33
CtcflA2APF3 Kars-202ENSMUST00000093120 2131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
CtcflA2APF3 Slc16a3-208ENSMUST00000168579 4335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
CtcflA2APF3 Trmu-201ENSMUST00000023019 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
CtcflA2APF3 Nup160-201ENSMUST00000057481 5684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
CtcflA2APF3 Traf1-201ENSMUST00000028234 2069 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
CtcflA2APF3 Slc39a2-201ENSMUST00000047726 2334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
CtcflA2APF3 Rbm47-204ENSMUST00000113726 4703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
CtcflA2APF3 Mlkl-201ENSMUST00000056157 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
CtcflA2APF3 Trim52-201ENSMUST00000022708 3075 ntAPPRIS P1 BASIC12.96□□□□□ -0.34
CtcflA2APF3 Hspa4l-208ENSMUST00000204702 9479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
CtcflA2APF3 Usp24-204ENSMUST00000165709 10594 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.34
CtcflA2APF3 Cdk8-205ENSMUST00000161181 2467 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
CtcflA2APF3 Plet1-201ENSMUST00000114474 1689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
CtcflA2APF3 Dbndd1-201ENSMUST00000176155 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
CtcflA2APF3 Mapt-204ENSMUST00000106992 5253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
CtcflA2APF3 Ppp4r3b-202ENSMUST00000102856 2410 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
CtcflA2APF3 4931414P19Rik-201ENSMUST00000022786 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
CtcflA2APF3 Sema6d-206ENSMUST00000103239 6225 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
CtcflA2APF3 Clpb-211ENSMUST00000209579 4159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
CtcflA2APF3 Ibtk-201ENSMUST00000039213 5650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
CtcflA2APF3 Acsl6-210ENSMUST00000108905 5807 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
CtcflA2APF3 Itgb4-202ENSMUST00000068981 5584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
CtcflA2APF3 Cep68-201ENSMUST00000050611 4804 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
CtcflA2APF3 Rbak-201ENSMUST00000049861 3335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
CtcflA2APF3 Rasd2-202ENSMUST00000139848 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
CtcflA2APF3 Cxcr5-204ENSMUST00000215293 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
CtcflA2APF3 Kctd14-206ENSMUST00000206658 2339 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC12.95□□□□□ -0.34
CtcflA2APF3 Gm11405-201ENSMUST00000118689 1556 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
CtcflA2APF3 Crtc1-201ENSMUST00000076615 5683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
CtcflA2APF3 Osm-201ENSMUST00000075221 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
CtcflA2APF3 AI464131-201ENSMUST00000054920 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
CtcflA2APF3 Snap23-202ENSMUST00000110711 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
CtcflA2APF3 Crhbp-202ENSMUST00000221025 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
CtcflA2APF3 Src-202ENSMUST00000092576 3887 ntTSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
CtcflA2APF3 Ftsj1-202ENSMUST00000115594 1529 ntTSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
CtcflA2APF3 Gm25745-201ENSMUST00000174945 133 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
CtcflA2APF3 Gm42456-201ENSMUST00000196840 387 ntTSL 3 BASIC12.95□□□□□ -0.34
CtcflA2APF3 CR974585.1-201ENSMUST00000221790 1263 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
CtcflA2APF3 Cmtm5-203ENSMUST00000227441 610 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
CtcflA2APF3 Lce1a2-201ENSMUST00000029530 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
CtcflA2APF3 Psmg3-201ENSMUST00000031531 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
CtcflA2APF3 Dupd1-201ENSMUST00000073870 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
CtcflA2APF3 Rapgef2-201ENSMUST00000118100 6573 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
CtcflA2APF3 Ciz1-202ENSMUST00000113331 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
CtcflA2APF3 Mtmr2-208ENSMUST00000155679 3088 ntTSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
CtcflA2APF3 Ell-201ENSMUST00000093454 3072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
CtcflA2APF3 Ephb3-201ENSMUST00000006112 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
CtcflA2APF3 Wasl-201ENSMUST00000031695 4352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
CtcflA2APF3 Gm14963-201ENSMUST00000146751 2558 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
CtcflA2APF3 Gm26559-201ENSMUST00000181939 2481 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
CtcflA2APF3 Pax2-203ENSMUST00000174490 4358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
CtcflA2APF3 Egr2-202ENSMUST00000105438 2864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
CtcflA2APF3 Capn5-202ENSMUST00000107112 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
CtcflA2APF3 Pcdh10-203ENSMUST00000171554 7273 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
CtcflA2APF3 Samd11-202ENSMUST00000217934 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
CtcflA2APF3 Pid1-204ENSMUST00000176559 1564 ntTSL 2 BASIC12.94□□□□□ -0.34
CtcflA2APF3 Tfap2c-206ENSMUST00000170744 2776 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
CtcflA2APF3 Arhgef1-202ENSMUST00000098683 3375 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
CtcflA2APF3 Renbp-201ENSMUST00000114379 1318 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
CtcflA2APF3 Gm26882-201ENSMUST00000181611 1537 ntTSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
CtcflA2APF3 Xrra1-201ENSMUST00000036155 2731 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
CtcflA2APF3 Epb41l5-208ENSMUST00000191046 6870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
CtcflA2APF3 Pank1-201ENSMUST00000036584 3460 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
CtcflA2APF3 Tfap2a-202ENSMUST00000110193 2863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
CtcflA2APF3 Pax6-201ENSMUST00000090391 2869 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
CtcflA2APF3 Clgn-202ENSMUST00000109831 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
CtcflA2APF3 Epsti1-201ENSMUST00000022591 1870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
CtcflA2APF3 Pdia2-202ENSMUST00000120333 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
CtcflA2APF3 Nap1l1-201ENSMUST00000065917 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
CtcflA2APF3 Ticrr-201ENSMUST00000035977 7199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
CtcflA2APF3 Rhoc-202ENSMUST00000106787 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.94□□□□□ -0.34
CtcflA2APF3 Syne4-208ENSMUST00000176304 1006 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
CtcflA2APF3 Arhgap33-206ENSMUST00000208522 781 ntTSL 3 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.7 ms