Protein–RNA interactions for Protein: A2AFR3

Frmpd4, FERM and PDZ domain-containing protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 1,320 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Frmpd4A2AFR3 Npnt-204ENSMUST00000117164 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Frmpd4A2AFR3 Snx29-207ENSMUST00000180792 2667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Frmpd4A2AFR3 Rph3al-203ENSMUST00000108420 695 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Frmpd4A2AFR3 Ngb-202ENSMUST00000110176 908 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Frmpd4A2AFR3 3110053B16Rik-204ENSMUST00000145605 575 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Frmpd4A2AFR3 Cpne8-201ENSMUST00000014777 697 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Frmpd4A2AFR3 Ercc1-203ENSMUST00000160369 1175 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Frmpd4A2AFR3 A330069E16Rik-201ENSMUST00000181191 887 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Frmpd4A2AFR3 Mir7654-201ENSMUST00000185082 70 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Frmpd4A2AFR3 Zfp936-202ENSMUST00000200973 578 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Frmpd4A2AFR3 Hddc3-208ENSMUST00000206122 696 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Frmpd4A2AFR3 Gm17795-201ENSMUST00000214505 757 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Frmpd4A2AFR3 Prss38-201ENSMUST00000061481 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Frmpd4A2AFR3 Fkbp2-201ENSMUST00000070878 642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Frmpd4A2AFR3 Mpl-203ENSMUST00000106375 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Frmpd4A2AFR3 Dlk1-205ENSMUST00000109844 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Frmpd4A2AFR3 Unc5d-202ENSMUST00000209401 3081 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Frmpd4A2AFR3 AC154527.2-201ENSMUST00000225256 1466 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Frmpd4A2AFR3 Ntf3-201ENSMUST00000050484 1483 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Frmpd4A2AFR3 Plekhb1-206ENSMUST00000107047 1926 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Frmpd4A2AFR3 Gm13589-201ENSMUST00000146404 1675 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Frmpd4A2AFR3 Edem3-201ENSMUST00000059498 6327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Frmpd4A2AFR3 Fggy-202ENSMUST00000079223 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Frmpd4A2AFR3 Repin1-207ENSMUST00000163452 2959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Frmpd4A2AFR3 Gm10605-202ENSMUST00000183019 3198 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Frmpd4A2AFR3 Gm42690-201ENSMUST00000197921 1836 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Frmpd4A2AFR3 Opn5-201ENSMUST00000068355 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Frmpd4A2AFR3 Cpne6-201ENSMUST00000074225 2201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Frmpd4A2AFR3 Fam189b-203ENSMUST00000119707 2415 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Frmpd4A2AFR3 Tmem101-201ENSMUST00000021296 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Frmpd4A2AFR3 Map6-203ENSMUST00000122101 3233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Frmpd4A2AFR3 Gm37297-201ENSMUST00000192974 2384 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Frmpd4A2AFR3 Snph-204ENSMUST00000109877 3367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Frmpd4A2AFR3 Tsc22d4-203ENSMUST00000100540 2730 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Frmpd4A2AFR3 Sox17-201ENSMUST00000027035 3127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Frmpd4A2AFR3 Gm4981-201ENSMUST00000099726 1854 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Frmpd4A2AFR3 Gm5678-201ENSMUST00000120115 939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Frmpd4A2AFR3 H60b-202ENSMUST00000131558 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Frmpd4A2AFR3 Gm17150-201ENSMUST00000165577 381 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Frmpd4A2AFR3 Gm28911-201ENSMUST00000188837 117 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Frmpd4A2AFR3 Ly6f-202ENSMUST00000189654 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Frmpd4A2AFR3 Gm28198-201ENSMUST00000190938 471 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Frmpd4A2AFR3 Gm42921-201ENSMUST00000196670 655 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Frmpd4A2AFR3 Gm44608-201ENSMUST00000206827 855 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Frmpd4A2AFR3 Gm18062-201ENSMUST00000208020 547 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Frmpd4A2AFR3 Gm18055-201ENSMUST00000208254 547 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Frmpd4A2AFR3 Ap4b1-204ENSMUST00000106824 2412 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Frmpd4A2AFR3 Syvn1-203ENSMUST00000134667 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Frmpd4A2AFR3 Hdac10-202ENSMUST00000109347 1824 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Frmpd4A2AFR3 Pacs2-201ENSMUST00000084891 5480 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Frmpd4A2AFR3 Sytl1-201ENSMUST00000030674 1951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Frmpd4A2AFR3 Rnf180-203ENSMUST00000224662 2734 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Frmpd4A2AFR3 Ppp1r18-204ENSMUST00000144382 2536 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Frmpd4A2AFR3 Gm8131-201ENSMUST00000213783 1570 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Frmpd4A2AFR3 AC013548.1-201ENSMUST00000228850 4738 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Frmpd4A2AFR3 Cep295nl-201ENSMUST00000103024 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Frmpd4A2AFR3 Rad51-201ENSMUST00000028795 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Frmpd4A2AFR3 Bsx-201ENSMUST00000067375 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Frmpd4A2AFR3 Zbtb20-202ENSMUST00000114690 2759 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Frmpd4A2AFR3 Gm9913-201ENSMUST00000066157 2793 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Frmpd4A2AFR3 Cep44-201ENSMUST00000040330 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Frmpd4A2AFR3 Ilf2-201ENSMUST00000001042 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Frmpd4A2AFR3 Tor1aip1-201ENSMUST00000027738 1952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Frmpd4A2AFR3 Alox5-201ENSMUST00000026795 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Frmpd4A2AFR3 Slc35g3-201ENSMUST00000102586 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Frmpd4A2AFR3 Fzd7-201ENSMUST00000114246 4532 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Frmpd4A2AFR3 Plod1-202ENSMUST00000105712 1059 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Frmpd4A2AFR3 Mars-206ENSMUST00000171564 2962 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Frmpd4A2AFR3 Ighv8-14-201ENSMUST00000196781 358 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Frmpd4A2AFR3 Pxn-213ENSMUST00000202564 2126 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Frmpd4A2AFR3 Polr2h-201ENSMUST00000021405 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Frmpd4A2AFR3 Gm5035-201ENSMUST00000215581 927 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Frmpd4A2AFR3 Gm36756-203ENSMUST00000223029 1166 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Frmpd4A2AFR3 AC155252.1-201ENSMUST00000226462 1208 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Frmpd4A2AFR3 Pld3-201ENSMUST00000117095 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Frmpd4A2AFR3 Ehd4-201ENSMUST00000028755 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Frmpd4A2AFR3 Fbxl16-201ENSMUST00000045692 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Frmpd4A2AFR3 Mastl-201ENSMUST00000028119 5590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Frmpd4A2AFR3 Acr-201ENSMUST00000023295 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Frmpd4A2AFR3 Dnmt3a-205ENSMUST00000172689 2328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Frmpd4A2AFR3 Rnf167-201ENSMUST00000037534 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Frmpd4A2AFR3 Cask-203ENSMUST00000115436 8260 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Frmpd4A2AFR3 Tomm34-202ENSMUST00000109384 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Frmpd4A2AFR3 Eif3f-201ENSMUST00000033342 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Frmpd4A2AFR3 Gm26850-201ENSMUST00000181653 2669 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Frmpd4A2AFR3 Brix1-201ENSMUST00000022855 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Frmpd4A2AFR3 Mbd3-202ENSMUST00000105347 914 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Frmpd4A2AFR3 Klk12-201ENSMUST00000014063 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Frmpd4A2AFR3 Tars2-204ENSMUST00000163530 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Frmpd4A2AFR3 Arf5-202ENSMUST00000169841 768 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Frmpd4A2AFR3 Otx2os1-202ENSMUST00000183803 743 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Frmpd4A2AFR3 Gm38293-201ENSMUST00000193209 600 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Frmpd4A2AFR3 Gm6266-201ENSMUST00000203844 806 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Frmpd4A2AFR3 Cacna1g-201ENSMUST00000021234 8139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Frmpd4A2AFR3 Klf4-201ENSMUST00000107619 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Frmpd4A2AFR3 Cald1-201ENSMUST00000031775 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Frmpd4A2AFR3 Edem3-202ENSMUST00000187951 3115 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Frmpd4A2AFR3 Bahd1-201ENSMUST00000036578 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Frmpd4A2AFR3 Irak1-206ENSMUST00000114354 3835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Frmpd4A2AFR3 Eps8l1-201ENSMUST00000086372 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 65.5 ms